| 厚生労働省 | 水道施設等整備費（水道施設災害復旧費補助含む） | 2017 | 簡易水道等施設整備事業の実施 | 138 |
| 厚生労働省 | 社会福祉施設等災害復旧費補助金 | 2020 | 災害復旧に必要な経費 | 101 |
| 厚生労働省 | 水道施設等整備費(水道施設災害復旧費補助含む) | 2016 | 水道施設災害復旧事業の実施 | 84 |
| 厚生労働省 | 水道施設等整備費(水道施設災害復旧費補助含む) | 2016 | 簡易水道等施設整備事業の実施 | 80 |
| 国土交通省 | 空き家対策総合支援事業 | 2019 | 空き家対策総合支援事業 | 59 |
| 環境省 | 災害等廃棄物処理事業費補助金 | 2015 | 災害により発生した廃棄物の収集、運搬及び処分 | 45 |
| 国土交通省 | 都市防災関連事業 | 2016 | 都市災害復旧事業 | 38 |
| 厚生労働省 | 水道施設等整備費(水道施設災害復旧費補助含む) | 2015 | H27.6.10 台風18号豪雨 | 37 |
| 農林水産省 | 農地利用最適化交付金 | 2018 | 農地の出し手の掘り起こし活動、人・農地プランの作成・見直し等 | 20 |
| 農林水産省 | 農地利用最適化交付金 | 2017 | 農地の出し手の掘り起こし活動、人・農地プランの作成・見直し等 | 20 |
| 厚生労働省 | 令和元年台風第19号に係る医療保険者への財政支援（医療保険） | 2019 | 一部負担金等の免除措置を実施した医療保険者等への財政支援 | 20 |
| 厚生労働省 | 感染症予防事業費等負担金（感染症発生動向調査事業を除く） | 2015 | 感染症の病原体に汚染された場所及び物件の消毒等 | 18 |
| 農林水産省 | 農地利用最適化交付金 | 2016 | 〃 | 15 |
| 厚生労働省 | 令和元年度台風第19号に係る介護保険利用料・保険料減免に対する財政支援 | 2019 | 保険料減免等に対する財政支援 | 9 |
| 国土交通省 | 河川・ダムの維持管理事業 | 2017 | 樋管操作委託 | 9 |
| 内閣府 | 子どものための教育・保育給付に必要な経費 | 2019 | 子どものための教育・保育給付災害臨時特例補助金 | 7 |
| 厚生労働省 | 介護保険事業費補助金（（項）介護保険制度運営推進費） | 2018 | 低所得高齢者等住まい・生活支援モデル事業 | 6 |
| 厚生労働省 | 介護保険事業費補助金（（項）介護保険制度運営推進費） | 2017 | 低所得高齢者等住まい・生活支援モデル事業等 | 5 |
| 文部科学省 | 特別支援教育充実事業 | 2019 | 通常の学級において発達障害の可能性のある児童生徒が、教科毎の学習でつまずくポイントについて専門家を活用し明らかにするなど、効果的な教科指導の方向性のあるかたについて調査研究を行う。
| 3 |
| 国土交通省 | 河川・ダムの維持管理事業 | 2019 | 操作委託 | 3 |
| 厚生労働省 | 社会福祉施設等設備災害復旧費補助金 | 2019 | 再開等準備費用 | 2 |
| 農林水産省 | 経営継承・発展等支援事業（旧「人・農地問題解決加速化支援事業」） | 2020 | 人・農地プラン実質化に向けた取組 | 1 |
| 厚生労働省 | 令和元年台風第19号に係る医療保険者への財政支援（介護２号保険料分） | 2019 | 介護２号保険料の免除を実施した国保保険者への財政支援 | 1 |
| 農林水産省 | 国有農地等管理処分事業 | 2017 | 農地法等に基づく管理事務の実施（交付金） | 1 |
| 農林水産省 | 国有農地等管理処分事業 | 2016 | 〃 | 1 |
| 農林水産省 | 国有農地等管理処分事業 | 2015 | 〃 | 1 |
| 厚生労働省 | 地域生活支援拠点等整備推進モデル事業 | 2015 | 地域生活支援のためのサービス提供体制の立ち上げに係る費用 | 1 |
| 厚生労働省 | 障害福祉サービス等災害臨時特例補助金 | 2019 | 被災した障害者等に係る障害福祉サービス等の利用者負担の減免 | 0 |
