| 財務省 | 特定国有財産の整備（財政投融資特別会計特定国有財産整備勘定） | 2017 | 国際法務総合センター（仮称）A工区新営（機械設備）工事 | 2,064 |
| 財務省 | 特定国有財産の整備（財政投融資特別会計特定国有財産整備勘定） | 2016 | 国際法務総合センター（仮称）A工区新営（機械設備）工事 | 1,683 |
| 文部科学省 | 国立アイヌ民族博物館の施設整備 | 2019 | 博物館機械設備工事 | 1,422 |
| 法務省 | 官署施設の整備充実 | 2016 | 国際法務総合センター（仮称）A工区新営（機械設備）工事 | 1,262 |
| 財務省 | 特定国有財産の整備（財政投融資特別会計特定国有財産整備勘定） | 2015 | 国際法務総合センター（仮称）A工区新営（機械設備）工事（26年度国庫債務負担行為） | 1,119 |
| 国土交通省 | 数値予報業務 | 2018 | 気象庁（16）清瀬庁舎機械設備改修その他工事 | 956 |
| 法務省 | 官署施設の整備充実 | 2016 | 福岡第1法務総合庁舎（26）機械設備工事 | 764 |
| 法務省 | 官署施設の整備充実 | 2015 | 国際法務総合センター(仮称)A工区新営（機械設備）工事 | 736 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人海洋研究開発機構施設整備費補助 | 2017 | 地球シミュレータ施設の機械設備機能を強化するための改修工事 | 575 |
| 法務省 | 法務省施設の整備充実 | 2017 | 国際法務総合センター（仮称）A工区新営（機械設備）工事 | 509 |
| 警察庁 | 機動隊等警察施設の整備 | 2018 | 科学警察研究所機械設備改修工事 | 374 |
| 国土交通省 | 官庁営繕費 | 2019 | 名古屋第２国税総合庁舎設備改修工事 | 282 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設整備経費 | 2017 | 検査機器更新 | 231 |
| 文部科学省 | 国立アイヌ民族博物館の施設整備 | 2018 | 博物館機械設備工事 | 209 |
| 外務省 | 施設整備費 | 2020 | 本省空調更新工事 | 192 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人物質・材料研究機構施設整備に必要な経費 | 2019 | 千現地区研究本館標準実験棟-建物附属設備-冷暖房装置 | 173 |
| 経済産業省 | 国立研究開発法人産業技術総合研究所運営費交付金 | 2017 | つくば西－７Ｂ棟ＩｏＴ拠点化事業第３次二次側用力接続工事 | 158 |
| 文部科学省 | 国立アイヌ民族博物館の施設整備 | 2017 | 博物館機械設備工事 | 150 |
| 外務省 | 施設整備費 | 2018 | 空調改修工事 | 140 |
| 経済産業省 | 国立研究開発法人産業技術総合研究所施設整備費補助 | 2020 | つくば西事業所機械設備（特殊ガス防災他）改修工事 | 137 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設整備経費 | 2019 | 工事業務 | 129 |
| 環境省 | 再エネ等を活用した水素社会推進事業 | 2018 | 水素製造設備工事、燃料電池設置工事 | 106 |
| 国土交通省 | 官庁営繕費 | 2020 | 中央合同庁舎第３号館空気調和設備改修工事 | 83 |
| 国土交通省 | 官庁営繕費 | 2019 | 中央合同庁舎第３号館外１件改修機械設備その他工事 | 70 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設整備経費 | 2019 | 工事業務 | 51 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設整備経費 | 2017 | 工事業務 | 48 |
| 外務省 | 施設整備費 | 2019 | 空調更新工事 | 46 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人海洋研究開発機構施設整備費補助 | 2017 | 地球シミュレータ施設機械設備機能強化に伴う空調加湿設備の整備工事 | 40 |
| 総務省 | 国立研究開発法人情報通信研究機構運営費交付金 | 2020 | 本部111棟・130棟スクラバー改修工事 | 35 |
| 国土交通省 | 数値予報業務 | 2016 | 気象庁清瀬庁舎（16）機械設備改修その他工事 | 32 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2015 | 実験設備等定期点検業務 | 32 |
| 環境省 | 温室効果ガス観測技術衛星「いぶき」（GOSAT）シリーズによる排出量検証に向けた技術高度化事業 | 2018 | 再生可能エネルギーによる冷凍貯蔵システムの開発業務 | 31 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人理化学研究所運営費交付金に必要な経費 | 2018 | 平成30年度研究排水処理設備保守点検整備業務 | 31 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人物質・材料研究機構施設整備に必要な経費 | 2019 | 千現地区研究本館標準実験棟-建物附属設備-冷暖房装置 | 27 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人理化学研究所運営費交付金に必要な経費 | 2020 | 研究排水処理設備保守点検整備業務 | 25 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人理化学研究所運営費交付金に必要な経費 | 2019 | 研究排水処理設備保守点検整備業務 | 24 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2017 | ＢＳＬ３・ＢＳＬ４定期点検（自動制御機器保守点検業務等） | 20 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2016 | Ｐ３・Ｐ４定期点検（自動制御機器保守点検業務等） | 18 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2016 | Ｐ３・Ｐ４定期点検（オートクレーブ保守点検） | 17 |
| 環境省 | 温室効果ガス観測技術衛星等による排出量検証に向けた技術高度化事業 | 2019 | 再生可能エネルギーによる冷凍貯蔵システムの開発業務 | 17 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人理化学研究所運営費交付金に必要な経費 | 2020 | 和光地区研究排水処理設備(一般実験系排水・中水処理等)等運転・維持管理業務 | 17 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人理化学研究所運営費交付金に必要な経費 | 2019 | 和光地区研究排水処理設備(一般実験系排水・中水処理等)等運転 | 16 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人理化学研究所運営費交付金に必要な経費 | 2018 | 和光地区研究排水処理設備(一般実験系排水・中水処理等)等運転 | 16 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2016 | ８号棟排水処理施設自動制御盤等改修工事 | 16 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設整備経費 | 2017 | 検査機器修理 | 14 |
| 厚生労働省 | 新型コロナウイルスに係るゲノム解析等による感染拡大防止のための体制整備事業 | 2020 | 動物実験施設の整備 | 14 |
| 厚生労働省 | 研究研修棟施設管理等事務経費 | 2015 | 室内空気汚染機構実験室ブライン配管更新工事 | 12 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2015 | オートクレーブ保守点検 | 11 |
| 厚生労働省 | 一種病原体等の取扱に伴う高度安全試験検査施設の管理強化及び人材育成 | 2020 | 設備点検 | 11 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2018 | BSL3・BSL4定期点検（オートクレーブ保守点検） | 9 |
| 厚生労働省 | 戸山庁舎関係経費 | 2019 | 庁舎設備改修業務 | 9 |
| 厚生労働省 | 生物安全対策費 | 2019 | 設備点検 | 8 |
| 厚生労働省 | 生物安全対策費 | 2016 | 設備点検 | 8 |
| 厚生労働省 | 戸山庁舎関係経費 | 2015 | 動物実験室系統自動制御機器交換業務 | 8 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2017 | ＢＳＬ３・ＢＳＬ４定期点検（給排気ファン分解整備） | 8 |
| 厚生労働省 | 生物安全対策費 | 2018 | 設備点検 | 8 |
| 厚生労働省 | 戸山庁舎関係経費 | 2020 | 庁舎維持管理業務 | 7 |
| 厚生労働省 | 戸山庁舎関係経費 | 2019 | 庁舎設備点検業務 | 7 |
| 厚生労働省 | 生物安全対策費 | 2015 | 設備点検 | 7 |
| 厚生労働省 | 新型コロナウイルスに係るゲノム解析等による感染拡大防止のための体制整備事業 | 2020 | 消耗品購入 | 6 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人物質・材料研究機構施設整備に必要な経費 | 2019 | 千現地区研究本館標準実験棟-建物附属設備-ガス装置 | 6 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2017 | ＢＳＬ３・ＢＳＬ４定期点検（オートクレーブ保守点検） | 6 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2018 | BSL3・BSL4定期点検（自動制御機器保守点検業務等） | 5 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人物質・材料研究機構施設整備に必要な経費 | 2019 | 千現地区研究本館標準実験棟-建物附属設備-諸作業装置 | 4 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設整備経費 | 2019 | 工事業務 | 4 |
| 厚生労働省 | 戸山庁舎関係経費 | 2015 | 冷温水機保守 | 4 |
| 厚生労働省 | 一種病原体等の取扱に伴う高度安全試験検査施設の管理強化及び人材育成 | 2020 | 設備点検 | 4 |
| 厚生労働省 | 一種病原体等の取扱に伴う高度安全試験検査施設の管理強化及び人材育成 | 2020 | 設備点検 | 3 |
| 厚生労働省 | 生物安全対策費 | 2020 | 設備点検 | 3 |
| 厚生労働省 | 新型コロナウイルスに係るゲノム解析等による感染拡大防止のための体制整備事業 | 2020 | 消耗品購入 | 3 |
| 厚生労働省 | 新型コロナウイルスに係るゲノム解析等による感染拡大防止のための体制整備事業 | 2020 | 動物実験施設の整備 | 3 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設整備経費 | 2019 | 工事業務 | 3 |
| 総務省 | 消防防災分野の研究開発に必要な経費 | 2018 | 水再生装置脱水ポンプ・汚泥配管交換工事 | 3 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2017 | 設備棟中央監視端末他修理工事 | 3 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2019 | ＢＳＬ３実験室設備定期点検業務（自動制御機器保守点検） | 3 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所共同利用型高額研究機器整備費 | 2020 | 設備改修工事 | 3 |
| 厚生労働省 | 一種病原体等の取扱に伴う高度安全試験検査施設の管理強化及び人材育成 | 2020 | 設備点検 | 2 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設整備経費 | 2019 | 工事業務 | 2 |
| 経済産業省 | 国立研究開発法人産業技術総合研究所施設整備費補助 | 2019 | つくば西－７Ｂ棟３階高機能ＩｏＴデバイス検査用走査電子顕微鏡用力接続工事 | 2 |
| 警察庁 | 科学警察研究所 | 2015 | 排煙処理装置定期点検 | 2 |
| 警察庁 | 科学警察研究所 | 2015 | 実験室燻蒸及びフィルタ交換作業 | 2 |
| 厚生労働省 | 一種病原体等の取扱に伴う高度安全試験検査施設の管理強化及び人材育成 | 2020 | 設備点検 | 2 |
| 厚生労働省 | 生物安全対策費 | 2020 | 設備工事 | 2 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所共同利用型高額研究機器整備費 | 2020 | 備品購入 | 1 |
| 厚生労働省 | 新型コロナウイルスに係るゲノム解析等による感染拡大防止のための体制整備事業 | 2020 | 消耗品購入 | 1 |
| 厚生労働省 | 一種病原体等の取扱に伴う高度安全試験検査施設の管理強化及び人材育成 | 2020 | 設備点検 | 1 |
| 厚生労働省 | 一種病原体等の取扱に伴う高度安全試験検査施設の管理強化及び人材育成 | 2020 | 設備点検 | 1 |
| 厚生労働省 | 新型コロナウイルスに係るゲノム解析等による感染拡大防止のための体制整備事業 | 2020 | 消耗品購入 | 1 |
| 厚生労働省 | 生物安全対策費 | 2020 | 設備点検 | 1 |
| 厚生労働省 | 一種病原体等の取扱に伴う高度安全試験検査施設の管理強化及び人材育成 | 2020 | 設備点検 | 1 |
| 厚生労働省 | 戸山庁舎関係経費 | 2019 | 庁舎設備部品交換業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所基盤的研究費 | 2019 | 消耗品購入 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設整備経費 | 2019 | 工事業務 | 1 |
| 経済産業省 | 国立研究開発法人産業技術総合研究所施設整備費補助 | 2019 | つくば西－７Ｂ棟３階複数機能の実装化装置用力接続工事 | 1 |
| 警察庁 | 科学警察研究所 | 2015 | ＢＳＬ３排水処理装置定期点検 | 1 |
| 経済産業省 | 国立研究開発法人産業技術総合研究所運営費交付金 | 2017 | 西-7A分析室 プローバ装置解体搬出 | 1 |
| 経済産業省 | 国立研究開発法人産業技術総合研究所施設整備費補助金 | 2018 | つくば西－７Ｂ棟３階複数機能の実装化装置用力接続工事 | 1 |
| 国土交通省 | 下水道事業 | 2017 | 水処理装置等の設計、製造、施工、保守 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2018 | 9号棟ABSL3-2機密ドア保守点検業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2017 | ９号棟ＡＢＳＬ３－２気密ドア保守点検業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2017 | ９号棟解剖台キャビネット性能保守点検業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2016 | 蒸気滅菌槽通気用ＨＥＰＡフィルターユニット更新工事 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所共同利用型高額研究機器整備費 | 2020 | 検査機器修理 | 1 |
| 厚生労働省 | 生物安全対策費 | 2020 | 設備点検 | 1 |
| 厚生労働省 | 生物安全対策費 | 2020 | 設備点検 | 1 |
| 厚生労働省 | 戸山庁舎関係経費 | 2019 | 庁舎設備修繕業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 感染症発生動向等調査費 | 2019 | 実験室解剖台キャビネット点検費として | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2018 | 9号棟解剖台キャビネット性能保守点検業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2018 | 8号棟自動制御機器交換業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2017 | ９号棟蒸気発生器保守点検業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2017 | ９号棟温熱源台数制御ユニット交換修理 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2016 | 解剖台キャビネット性能保守点検業務１式 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所共同利用型高額研究機器整備費 | 2020 | 消耗品購入 | 1 |
| 厚生労働省 | 生物安全対策費 | 2020 | 設備点検 | 1 |
| 厚生労働省 | 生物安全対策費 | 2020 | 設備点検 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所基盤的研究費 | 2019 | 消耗品購入 | 1 |
| 厚生労働省 | 生物安全対策費 | 2018 | 消耗品購入 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所競争的研究事務経費 | 2017 | 装置更新業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2018 | 8号棟空気源装置部品交換等業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2017 | Ｂ実験室１番から３番扉電気錠交換修理 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2017 | ９号棟全身気密防護服保守点検 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2016 | ＡＢＳＬ３－１気密ドア保守点検業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 生物安全対策費 | 2020 | 設備点検 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2018 | 6号棟一般系統ＣＡＶ部品交換業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2018 | 6号棟細胞2，3，4系統ＣＡＶ部品交換業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2016 | 蒸気発生器保守点検業務１式 | 1 |
| 厚生労働省 | 戸山庁舎関係経費 | 2015 | ＲＩ実験室（Ｐ３）防火ダンパー交換作業 | 1 |
| 厚生労働省 | 戸山庁舎関係経費 | 2015 | 実験室用モーター等部品交換 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2018 | 6号棟空調機ＡＣＣ－１－１冷温水３方弁交換業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2018 | 6号棟再熱制御用指示調節計交換業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2018 | 6号棟動物系統ＣＡＶ部品交換業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2017 | ８号棟Ａ実験室系統制御盤指示調節器交換工事 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2017 | ６号棟冷却塔ファン整備 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2017 | ９号棟蒸気発生器熱交換管上部穴埋め（栓）工事 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2018 | 6号棟ACC－4－1空調機用加湿2方弁モーター交換業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2018 | 6号棟大型細胞系統ＶＡＶ、ＣＡＶ部品交換業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2016 | 全身気密防護服保守点検業務１式 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2016 | 空気源装置点検整備業務１式 | 1 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2018 | ８号棟ＡＣ－４蒸気配管補修工事 | 0 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2018 | ＢＳＬ３・ＢＳＬ４定期点検（８号棟風量測定及び調整業務） | 0 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2016 | ＡＣ空調機交換整備業務１式 | 0 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2016 | ８号棟排水槽液面計仮設電源盤設置工事１式 | 0 |
| 厚生労働省 | 一種病原体等の取扱に伴う高度安全試験検査施設の管理強化及び人材育成 | 2020 | 設備点検 | 0 |
| 厚生労働省 | 生物安全対策費 | 2020 | 設備点検 | 0 |
| 厚生労働省 | 戸山庁舎関係経費 | 2019 | 庁舎設備部品交換業務 | 0 |
| 厚生労働省 | 戸山庁舎関係経費 | 2019 | 庁舎設備修繕業務 | 0 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2018 | 9号棟BSL3（3）実験室系統湿度指示調節器交換業務 | 0 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2016 | Ｂ１、Ｂ２実験室ハバキ補修工事 | 0 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2016 | 冷水チラーＮｏ．１凝縮器薬品洗浄作業 | 0 |
| 厚生労働省 | 一種病原体等の取扱に伴う高度安全試験検査施設の管理強化及び人材育成 | 2020 | 設備点検 | 0 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所基盤的研究費 | 2019 | 検査用機器部品交換業務 | 0 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2018 | 8号棟マノスターゲージと中央監視の室圧数値誤差調査業務 | 0 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2018 | 8号棟排気ファン制御用空気4方弁交換修理業務 | 0 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所施設管理事務経費 | 2016 | Ｂ２実験室サポート間電線管シール材充填工事 | 0 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所共同利用型高額研究機器整備費 | 2020 | 消耗品購入 | 0 |
| 厚生労働省 | 国立感染症研究所共同利用型高額研究機器整備費 | 2020 | 消耗品購入 | 0 |
| 環境省 | 再エネ等を活用した水素社会推進事業 | 2019 | 露点計交換・調整作業 | 0 |
