| 国土交通省 | 独立行政法人自動車事故対策機構運営費交付金 | 2020 | 運営委託 | 595 |
| 国土交通省 | 独立行政法人自動車事故対策機構運営費交付金 | 2016 | 運営委託 | 589 |
| 国土交通省 | 独立行政法人自動車事故対策機構運営費交付金 | 2019 | 運営委託 | 576 |
| 国土交通省 | 独立行政法人自動車事故対策機構運営費交付金 | 2017 | 運営委託 | 542 |
| 国土交通省 | 独立行政法人自動車事故対策機構運営費交付金 | 2015 | 運営委託 | 531 |
| 国土交通省 | 独立行政法人自動車事故対策機構運営費交付金 | 2018 | 運営委託 | 523 |
| 内閣府 | 原子力災害対策事業 | 2015 | 放射線防護対策の実施 | 212 |
| 厚生労働省 | 医療提供体制施設整備交付金 | 2019 | 救命救急センター施設整備事業に係る工事等 | 117 |
| 内閣府 | 原子力発電施設等緊急時安全対策交付金 | 2015 | 鹿児島県二次被ばく医療施設の運営費補助金 | 55 |
| 厚生労働省 | 救命救急センター運営事業 | 2018 | 救命救急センターの運営 | 44 |
| 厚生労働省 | 救命救急センター運営事業 | 2019 | 救命救急センターの運営 | 41 |
| 厚生労働省 | 救命救急センター運営事業 | 2020 | 救命救急センターの運営 | 38 |
| 厚生労働省 | 医療施設等災害復旧費 | 2019 | 暴風、豪雨、洪水、高潮、地震、津波、噴火その他の異常な自然現象により被害を受けたものの災害復旧 | 37 |
| 経済産業省 | 健康・医療情報を活用したヘルスケア・イノベーション基盤整備事業 | 2019 | クリニカルパス標準データモデルの開発および利活用 | 35 |
| 厚生労働省 | 救命救急センター運営事業 | 2017 | 救命救急センターの運営 | 34 |
| 厚生労働省 | 医療施設の設備整備の支援（統合補助金分） | 2020 | 医療機関に対する医療機器等の導入に係る補助 | 28 |
| 法務省 | 検察事務処理への対応 | 2020 | 鑑定料等 | 23 |
| 厚生労働省 | 保健衛生施設等施設・設備整備費補助金
（保健衛生施設等災害復旧費補助金含む） | 2019 | 施設・設備整備費の支出 | 23 |
| 内閣府 | 原子力発電施設等緊急時安全対策交付金 | 2019 | 被ばく医療対策施設運営 | 22 |
| 厚生労働省 | 医療施設の設備整備の支援（統合補助金分） | 2019 | 医療機関に対する医療機器等の導入に係る補助 | 21 |
| 内閣府 | 原子力発電施設等緊急時安全対策交付金 | 2016 | 二次被ばく医療施設運営費 | 21 |
| 総務省 | 地域IoT実装総合支援施策 | 2018 | 横浜市鶴見区地域医療介護連携ネットワークシステム構築事業 | 20 |
| 経済産業省 | 医療機器等における先進的研究開発・開発体制強靱化事業(旧:先進的医療機器・システム等技術開発事業) | 2020 | 健康・医療情報活用技術開発課題 | 18 |
| 内閣府 | 原子力発電施設等緊急時安全対策交付金 | 2020 | 原子力災害拠点病院等の維持管理 | 17 |
| 厚生労働省 | 救急患者の受入体制の充実 | 2019 | 搬送困難事例受入医療機関支援事業 | 16 |
| 厚生労働省 | 救急患者の受入体制の充実 | 2018 | 搬送困難事例受入医療機関支援事業 | 16 |
| 内閣府 | 原子力発電施設等緊急時安全対策交付金 | 2017 | 被ばく医療対策施設運営費補助金 | 14 |
| 厚生労働省 | 医療施設等災害復旧費 | 2019 | 暴風、豪雨、洪水、高潮、地震、津波、噴火その他の異常な自然現象により被害を受けたものの災害復旧 | 14 |
| 厚生労働省 | 医療施設の設備整備の支援（統合補助金分） | 2016 | 医療機関に対する医療機器等の購入に係る補助 | 14 |
| 厚生労働省 | 共同利用型病院運営事業 | 2019 | 共同利用型病院に対する運営費の補助 | 11 |
| 経済産業省 | 電気・熱エネルギー高度利用支援事業費補助金 | 2016 | 高効率コージェネレーション導入（1件） | 11 |
| 厚生労働省 | 医療施設の設備整備の支援（統合補助金分） | 2017 | 医療機関に対する医療機器等の導入に係る補助 | 11 |
| 厚生労働省 | 共同利用型病院運営事業 | 2020 | 共同利用型病院に対する運営費の補助 | 10 |
| 厚生労働省 | 共同利用型病院運営事業 | 2018 | 共同利用型病院に対する運営費の補助 | 10 |
| 厚生労働省 | 共同利用型病院運営事業 | 2015 | 共同利用型病院の運営 | 10 |
| 厚生労働省 | 社会福祉施設等施設整備（災害復旧費含む） | 2016 | 施設の災害復旧 | 7 |
| 厚生労働省 | 保健衛生施設等施設・設備整備費補助金
（保健衛生施設等災害復旧費補助金含む） | 2015 | 施設･設備整備費の支出 | 7 |
| 厚生労働省 | 救急患者退院コーディネーター事業 | 2019 | 救急医療用病床からの転床、転院促進、施設間連携構築を図る専任者の配置 | 3 |
| 厚生労働省 | 救急患者退院コーディネーター事業 | 2018 | 救急医療用病床からの転床、転院促進、施設間連携構築を図る専任者の配置 | 3 |
| 環境省 | 石綿問題への緊急対応に必要な経費 | 2016 | 石綿ばく露者の健康管理に係る試行調査に関する検査等 | 2 |
| 環境省 | 石綿問題への緊急対応に必要な経費 | 2015 | 石綿ばく露者の健康管理に係る試行調査に関する検査等 | 2 |
| 厚生労働省 | 救急患者退院コーディネーター事業 | 2017 | 救急医療用病床からの転床、転院促進、施設間連携構築を図る専任者を配置した医療機関等に対する補助 | 2 |
| 厚生労働省 | 救急患者退院コーディネーター事業 | 2016 | 救急医療用病床からの転床、転院促進、施設間連携構築を図る専任者を配置した医療機関等に対する補助 | 2 |
| 内閣府 | 原子力発電施設等緊急時安全対策交付金 | 2015 | 鳥取県放射線防護対策施設の維持管理 | 2 |
| 厚生労働省 | 外国人受入医療機関認証制度等推進事業 | 2019 | 団体契約を通じた電話医療通訳事業 | 1 |
| 厚生労働省 | 救急患者退院コーディネーター事業 | 2020 | 救急医療用病床からの転床、転院促進、施設間連携構築を図る専任者を配置した医療機関等に対する補助 | 1 |
| 環境省 | 茨城県神栖市における有機ヒ素化合物汚染等への緊急対応策 | 2017 | ジフェニルアルシン酸中毒治療特定診療 | 1 |
| 環境省 | 茨城県神栖市における有機ヒ素化合物汚染等への緊急対応策 | 2015 | ジフェニルアルシン酸中毒治療特定診療 | 1 |
| 環境省 | 茨城県神栖市における有機ヒ素化合物汚染等への緊急対応策 | 2019 | 生体試料保管 | 1 |
| 環境省 | 茨城県神栖市における有機ヒ素化合物汚染等への緊急対応策 | 2018 | ジフェニルアルシン酸中毒治療特定診療 | 1 |
| 環境省 | 茨城県神栖市における有機ヒ素化合物汚染等への緊急対応策 | 2016 | ジフェニルアルシン酸中毒治療特定診療 | 1 |
| 環境省 | 茨城県神栖市における有機ヒ素化合物汚染等への緊急対応策 | 2020 | 特定診療業務 | 0 |
