| 環境省 | 風力発電等に係る環境アセスメント基礎情報整備モデル事業（経済産業省連携事業） | 2017 | 洋上風力発電所の環境影響評価に係る調査検討業務 | 144 |
| 環境省 | 潮流発電技術実用化推進事業（経済産業省連携事業） | 2015 | 潮流・波浪調査 | 135 |
| 環境省 | CO2排出削減対策強化誘導型技術開発・実証事業 | 2019 | 反射波を活用した油圧シリンダ鉛直配置式波力発電装置（平塚波力発電所）の海域実証 | 78 |
| 農林水産省 | 有明海漁場環境改善技術開発事業 | 2016 | 有明海における漁場環境改善技術の開発 | 75 |
| 農林水産省 | 有明海漁場環境改善技術開発事業 | 2015 | 有明海における漁場環境改善技術の開発 | 63 |
| 農林水産省 | 有明海のアサリ等の生産性向上実証事業 | 2017 | 有明海における漁場環境改善技術の開発 | 58 |
| 農林水産省 | 有明海のアサリ等の生産性向上実証事業 | 2018 | 有明海における漁場環境改善技術の開発 | 33 |
| 農林水産省 | 有明海のアサリ等の生産性向上実証事業 | 2020 | 有明海における漁場環境改善技術の開発 | 26 |
| 農林水産省 | 有明海のアサリ等の生産性向上実証事業 | 2020 | 有明海における漁場環境改善技術の開発 | 26 |
| 環境省 | 水質環境基準検討費（水質・底質分析法検討費を統合） | 2017 | 奄美大島での油状物質漂着状況確認及び周辺への環境影響調査等 | 26 |
| 環境省 | 自然公園等事業費等 | 2019 | 平成３１年度石西礁湖サンゴ群集モニタリング調査等業務 | 23 |
| 環境省 | 自然公園等事業費等 | 2020 | 令和2年度石西礁湖サンゴ群集モニタリング調査等業務 | 21 |
| 農林水産省 | 有明海のアサリ等の生産性向上実証事業 | 2019 | 有明海における漁場環境改善技術の開発 | 21 |
| 環境省 | 風力発電等に係る環境アセスメント基礎情報整備モデル事業（経済産業省連携事業） | 2015 | 地域固有環境情報調査
（鹿児島県薩摩川内市沖） | 21 |
| 環境省 | 自然公園等事業費等 | 2016 | 石西礁湖サンゴ群集モニタリング調査等業務 | 19 |
| 環境省 | 自然公園等事業費等 | 2016 | 阿蘇草原再生野草地環境保全計画策定検討業務 | 17 |
| 農林水産省 | 有明海再生関係事業 | 2017 | 水生生物等の調査 | 16 |
| 環境省 | 自然公園等事業費等 | 2019 | 平成３１年度石西礁湖自然再生事業環境省事業実施計画検討等業務 | 15 |
| 環境省 | 脱炭素・資源循環「まち・暮らし創生」FS事業 | 2020 | 共同実施委託費
・環境調査、発電部品の検討 | 14 |
| 環境省 | 日本の国立公園と世界遺産を活かした地域活性化推進費 | 2015 | 慶良間諸島周辺海域におけるサンゴ礁モニタリング調査業務 | 5 |
| 農林水産省 | 水産多面的機能発揮対策 | 2015 | 水産多面的機能活動サポート推進事業：モデル地区サポート業務 | 4 |
| 環境省 | 漂流・漂着・海底ごみに係る削減方策総合検討事業 | 2015 | 微細なプラスチックごみの採集 | 4 |
| 国土交通省 | 沿岸域における環境保全技術の効果的活用のための評価手法の開発 | 2019 | 宮古湾における底質および藻場の調査に関する業務 | 3 |
| 国土交通省 | 沿岸域における環境保全技術の効果的活用のための評価手法の開発 | 2019 | 東京湾における干潟の生物調査に関する業務 | 2 |
| 国土交通省 | 津波災害時における港湾活動の安定的な維持方策に関する研究 | 2015 | 宮古湾におけるアマモ等の藻場分布調査 | 2 |
| 国土交通省 | 国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所運営費交付金 | 2016 | ﾙｶﾝ礁における炭素系連続測定補助業務 | 2 |
| 環境省 | 水質環境基準検討費 | 2018 | 油状物質等の分析業務 | 1 |
