| 文部科学省 | 感染症医療人材養成事業 | 2020 | 感染症医療人材養成事業 | 103 |
| 文部科学省 | 私立大学等研究設備整備等 | 2016 | 教育基盤設備、研究設備の整備費 | 82 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（新興・再興感染症制御プロジェクト） | 2017 | - | 71 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（新興・再興感染症制御プロジェクト） | 2017 | 薬剤耐性菌サーベイランスの強化及びゲノム解析の促進に伴う迅速検査法開発に関する研究 | 66 |
| 厚生労働省 | 医療施設の設備整備の支援（統合補助金分） | 2019 | 医療機関に対する医療機器等の導入に係る補助 | 57 |
| 厚生労働省 | 医療施設の設備整備の支援（統合補助金分） | 2020 | 医療機関に対する医療機器等の導入に係る補助 | 56 |
| 厚生労働省 | 医療施設の設備整備の支援（統合補助金分） | 2018 | 医療機関に対する医療機器等の導入に係る補助 | 51 |
| 厚生労働省 | 医療施設の設備整備の支援（統合補助金分） | 2016 | 医療機関に対する医療機器等の購入に係る補助 | 49 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（脳とこころの健康大国実現プロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 2018 | 児童・思春期における心の健康発達・成長支援に関する研究 | 45 |
| 厚生労働省 | 医療施設の設備整備の支援（統合補助金分） | 2017 | 医療機関に対する医療機器等の導入に係る補助 | 40 |
| 厚生労働省 | 周産期医療体制の確保 | 2020 | 周産期母子医療センター運営事業 | 38 |
| 厚生労働省 | 医療施設の設備整備の支援（統合補助金分） | 2015 | 医療機関に対する医療機器等の購入に係る補助 | 33 |
| 厚生労働省 | 救命救急センター運営事業 | 2020 | 救命救急センターの運営 | 28 |
| 文部科学省 | 私立学校施設高度化推進事業費補助 | 2018 | 利子の支払の一部に充当 | 27 |
| 文部科学省 | 私立学校施設高度化推進事業費補助 | 2019 | 利子の支払の一部に充当 | 26 |
| 文部科学省 | 私立学校施設高度化推進事業費補助 | 2020 | 利子の支払いの一部に充当 | 25 |
| 経済産業省 | 迅速ウイルス検出機器導入実証事業（先進的医療機器・システム等技術開発事業） | 2019 | 基盤技術開発プロジェクト | 19 |
| 厚生労働省 | 周産期医療体制の確保 | 2015 | 周産期母子医療センター運営事業 | 18 |
| 厚生労働省 | 周産期医療体制の確保 | 2017 | 周産期母子医療センター運営事業 | 17 |
| 厚生労働省 | 外国人医師等研修受入推進事業 | 2018 | 医療技術等国際展開推進事業 | 10 |
| 厚生労働省 | がん診療連携拠点病院機能強化事業費等 | 2016 | がん診療連携拠点病院への補助金の配分 | 9 |
| 厚生労働省 | がん診療連携拠点病院機能強化事業費 | 2015 | がん診療連携拠点病院への補助金の配分 | 8 |
| 厚生労働省 | 外国人医師等研修受入推進事業 | 2017 | 医療技術等国際展開推進事業の実施 | 8 |
| 厚生労働省 | がん診療連携拠点病院機能強化事業等 | 2018 | がん診療連携拠点病院機能強化事業の実施 | 7 |
| 厚生労働省 | がん診療連携拠点病院機能強化事業費 | 2017 | がん診療連携拠点病院への補助金の配分 | 7 |
| 厚生労働省 | ＮＩＣＵ等からの退院の促進 | 2016 | NICU等に長期入院している小児の在宅への移行事業等 | 3 |
| 厚生労働省 | ＮＩＣＵ等からの退院の促進 | 2015 | NICU等に長期入院している小児の在宅への移行事業等 | 3 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（新興・再興感染症制御プロジェクト） | 2017 | 薬剤耐性性感染症の分子疫学解析手法の確立と薬剤耐性化機構に関する研究 | 3 |
| 環境省 | イタイイタイ病及び慢性カドミウム中毒に関する総合的研究 | 2020 | カドミウムの腎障害に関与する内皮細胞毒性を担う金属輸送体の発現制御機構 | 3 |
| 環境省 | イタイイタイ病及び慢性カドミウム中毒に関する総合的研究 | 2019 | カドミウムの腎障害に関与する内皮細胞毒性を担う金属輸送体の発現制御機構 | 3 |
| 厚生労働省 | 医療連携体制推進事業 | 2018 | 脳卒中対策に係る医療関係者による検討会等の開催 | 2 |
| 経済産業省 | 洋上風力発電等の導入拡大に向けた研究開発事業 | 2019 | 次世代浮体式洋上風力発電システム実証研究（要素技術実証）における再委託先（委託先からの選定による） | 1 |
| 厚生労働省 | 災害時における医療提供体制の確保 | 2018 | 防災訓練等参加支援事業 | 1 |
