| 国土交通省 | 河川改修事業 | 2016 | 生息環境検討 | 93 |
| 国土交通省 | 河川改修事業 | 2017 | 河川生息環境検討業務 | 89 |
| 国土交通省 | 河川改修事業 | 2019 | 河川生態系保全活動支援業務 | 73 |
| 国土交通省 | 河川改修事業 | 2020 | 生態系保全活動支援業務 | 54 |
| 国土交通省 | 河川改修事業 | 2015 | 渡良瀬遊水地における環境検討 | 34 |
| 国土交通省 | 河川・ダムの維持管理事業 | 2018 | 生態系保全活動支援業務 | 30 |
| 農林水産省 | 森林経営管理制度推進事業 | 2020 | 森林経営管理制度実施円滑化事業 | 20 |
| 農林水産省 | 森林・山村多面的機能発揮対策 | 2017 | 森林・山村多面的機能発揮対策交付金の活動の評価検証 | 14 |
| 国土交通省 | 国土形成計画等の基礎的・長期的検討 | 2018 | 平成３０年度所有者の所在の把握が難しい土地の利活用・管理に関する検討調査 | 14 |
| 国土交通省 | 国土形成計画等の基礎的・長期的検討 | 2016 | 平成28年度 所有者の所在の把握が難しい土地の利活用に関する検討調査 | 13 |
| 国土交通省 | 国土形成計画等の基礎的・長期的検討 | 2019 | ２０１９年度 放置された土地の悪影響（外部不経済等）に関する分析・評価及び管理のあり方に関する調査 | 11 |
| 国土交通省 | 河川・ダムの維持管理事業 | 2020 | 遊水地周辺利活用等検討 | 9 |
| 国土交通省 | 国土形成計画等の基礎的・長期的検討 | 2015 | 平成27年度地域活性化に資する所有者不明の土地の活用に関する検討調査 | 9 |
| 農林水産省 | 森林・山村多面的機能発揮対策 | 2020 | 森林・山村多面的機能発揮対策交付金の活動の評価検証 | 9 |
| 農林水産省 | 森林・山村多面的機能発揮対策 | 2019 | 森林・山村多面的機能発揮対策交付金の活動の評価検証 | 9 |
| 農林水産省 | 森林・山村多面的機能発揮対策 | 2016 | 森林・山村多面的機能発揮対策交付金の活動の評価検証 | 8 |
| 農林水産省 | 森林・山村多面的機能発揮対策 | 2015 | 森林・山村多面的機能発揮対策交付金の活動の評価検証 | 8 |
| 環境省 | 鳥獣保護管理強化総合対策事業 | 2018 | 平成３０年度出水市における新たなツルとの共生に向けた地域づくり支援検討業務 | 8 |
| 環境省 | 鳥獣保護管理強化総合対策事業 | 2018 | 平成30年度出水市における新たなツルとの共生に向けた地域づくり支援検討業務 | 8 |
| 農林水産省 | 食料・農業・農村基本政策企画調査費 | 2016 | 続未登記農地の解消に係るボトルネックや実情等の実態把握業務 | 7 |
| 国土交通省 | 河川・ダムの維持管理事業 | 2019 | 遊水地周辺利活用検討 | 6 |
| 環境省 | 鳥獣保護管理強化総合対策事業 | 2019 | 出水市における新たなツルとの共生に向けた地域づくり支援検討業務 | 6 |
| 環境省 | サンゴ礁生態系保全対策推進費 | 2019 | サンゴ礁生態系保全行動計画フォローアップ会議及びシンポジウム実施業務 | 5 |
| 環境省 | 鳥獣保護管理強化総合対策事業 | 2020 | 令和2年度出水におけるツル類の分散化等に関する検討業務 | 5 |
| 環境省 | 中間評価をふまえた愛知目標達成方策検討調査費 | 2016 | COP13に向けた生物多様性主流化事例収集 | 5 |
| 環境省 | 鳥獣保護管理強化総合対策事業 | 2017 | 出水市における新たなツルとの共生に向けた地域づくり支援検討業務 | 4 |
| 環境省 | 鳥獣保護管理強化総合対策事業 | 2016 | ナベヅル等の新越冬地形成等に関わる合意形成検討業務 | 4 |
| 環境省 | 鳥獣保護管理強化総合対策事業 | 2015 | ナベヅル等の新越冬地形成等に関わる合意形成検討調査 | 4 |
| 環境省 | 鳥獣保護管理強化総合対策事業 | 2016 | くじゅう地域ニホンジカ影響調査等業務 | 3 |
| 環境省 | 希少種保護推進費 | 2018 | タンチョウ生息地分布に向けた普及啓発業務 | 2 |
| 環境省 | 希少種保護推進費 | 2016 | タンチョウ生息地分散基礎調査業務 | 2 |
| 環境省 | 希少種保護推進費 | 2017 | タンチョウ生息地分散基礎調査業務 | 2 |
| 環境省 | 希少種保護推進費 | 2019 | タンチョウ生息地分散に向けた生息状況把握等業務 | 1 |
| 環境省 | 希少種保護推進費 | 2015 | タンチョウ生息地分散基礎調査業務 | 1 |
| 国土交通省 | 国立研究開発法人土木研究所（運営費交付金） | 2015 | 氾濫原水域動態整理業務 | 1 |
| 環境省 | 自然再生活動推進費 | 2019 | 海外における自然再生に関する基礎情報等調査業務 | 1 |
| 環境省 | 自然再生活動推進費 | 2018 | 生態系ネットワーク事例収集等業務 | 1 |
| 環境省 | 「国連生物多様性の10年」推進事業費 | 2016 | 生物多様性主流化事例パンフレット印刷及びパネル作成業務 | 1 |
| 環境省 | 希少種保護推進費 | 2017 | タンチョウ保護収容等研修会開催業務 | 1 |
| 国土交通省 | 河川・ダムの維持管理事業 | 2015 | 検討業務 | 1 |
| 環境省 | 中間評価をふまえた愛知目標達成方策検討調査費
(「愛知目標の実現に向けたCOP10主要課題検討調査費」より名称変更） | 2015 | 地域連携促進法自治体意見交換会開催に係る補助業務 | 0 |
