| 厚生労働省 | 国立研究開発法人国立循環器病研究センター運営費 | 2016 | 国立循環器病研究センターの運営 | 4,486 |
| 厚生労働省 | 国立研究開発法人国立循環器病研究センター運営費 | 2017 | 国立循環器病研究センターの運営 | 4,251 |
| 厚生労働省 | 国立研究開発法人国立循環器病研究センター運営費 | 2018 | 国立循環器病研究センターの運営 | 3,997 |
| 厚生労働省 | 国立研究開発法人国立循環器病研究センター運営費 | 2020 | 国立循環器病研究センターの運営 | 3,984 |
| 厚生労働省 | 国立研究開発法人国立循環器病研究センター運営費 | 2019 | 国立循環器病研究センターの運営 | 3,978 |
| 厚生労働省 | 国立研究開発法人国立循環器病研究センター設備整備費補助金 | 2018 | 国立循環器病研究センターの運営 | 2,408 |
| 厚生労働省 | 国立研究開発法人国立循環器病研究センター設備整備費補助金 | 2019 | 国立循環器病研究センターの運営 | 1,929 |
| 厚生労働省 | 国立研究開発法人国立循環器病研究センター施設整備費 | 2018 | 研究施設等の整備 | 1,024 |
| 内閣府 | 総合特区の推進調整に必要な経費 | 2015 | 国立循環器病研究センター施設整備費 | 800 |
| 厚生労働省 | 国立研究開発法人国立循環器病研究センター施設整備費 | 2017 | 研究施設等の整備 | 718 |
| 経済産業省 | ウイルス等感染症対策技術開発事業 | 2020 | 実証・改良研究支援 | 657 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（その他）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 2015 | - | 397 |
| 厚生労働省 | 国立研究開発法人国立循環器病研究センター施設整備費 | 2016 | 研究施設等の整備 | 358 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（オールジャパンでの医薬品創出） | 2015 | - | 244 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（疾患基礎研究プロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 2020 | | 170 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（その他）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 2015 | 脳卒中急性期治療に関する国内臨床拠点施設を適切に活用した国際共同試験の円滑な企画・遂行を目指した基盤整備研究 | 158 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（オールジャパンでの医薬品創出プロジェクト） | 2019 | | 155 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（革新的医療技術創出拠点プロジェクト） | 2015 | - | 148 |
| 厚生労働省 | 医薬品・医療機器産業海外展開推進事業 | 2018 | 日露医療協力推進事業
| 107 |
| 厚生労働省 | 医薬品・医療機器産業海外展開推進事業 | 2017 | 日露国際協力推進事業 | 100 |
| 厚生労働省 | 国立研究開発法人国立循環器病研究センター設備整備費補助金 | 2016 | 研究機器の整備 | 99 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（その他）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 2015 | 先天性心疾患の長期予後の視点に基づいた介入のあり方に関する研究 | 90 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（革新的医療技術創出拠点プロジェクト） | 2015 | 世界に先駆けた革新的新薬・医療機器創出のための臨床試験拠点整備事業 | 83 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（オールジャパンでの医薬品創出） | 2015 | PCSK9をターゲットとした核酸医薬の薬事申請を目指した治験に橋渡しするための非臨床試験 | 77 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（疾病克服に向けたゲノム医療実現化プロジェクト） | 2015 | メディカル・ゲノムセンター等におけるゲノム医療実施体制の構築と人材育成に関する研究 | 66 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（革新的医療技術創出拠点プロジェクト） | 2015 | 臨床試験支援機能構築事業 | 66 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（オールジャパンでの医薬品創出プロジェクト） | 2019 | 多階層データの統合モデリングによる薬物動態予測システムの構築 | 65 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（疾患基礎研究プロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 2020 | 東アジア特有の高血圧・脳梗塞リスクRNF213p.R4810K多型の迅速判定法の確立と判定拠点の構築 | 52 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（オールジャパンでの医薬品創出） | 2015 | アポC3をターゲットとした高中性脂肪血症、動脈硬化症に対する革新的核酸医薬の開発 | 48 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（疾患基礎研究プロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 2020 | 循環器疾患領域における多剤併用（polypharmacy）の実態とその問題把握に関する研究 | 46 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2015 | 低侵襲がん診断装置 | 45 |
| 厚生労働省 | 循環器病対策費 | 2020 | 診療情報の収集・活用に関する検討等 | 39 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（疾病克服に向けたゲノム医療実現プロジェクト） | 2019 | 致死性不整脈の原因心筋イオンチャネル遺伝子に同定されるVUSのハイスループット機能評価法に関する研究開発 | 39 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（オールジャパンでの医薬品創出プロジェクト） | 2019 | 患者レジストリを活用した筋萎縮性側索硬化症治療薬開発のための医師主導治験 | 39 |
| 経済産業省 | 医療機器等における先進的研究開発・開発体制強靱化事業(旧:先進的医療機器・システム等技術開発事業) | 2020 | 共通基盤的技術開発 | 16 |
| 厚生労働省 | 医薬品・医療機器産業海外展開推進事業 | 2019 | セミナー、講師派遣等 | 9 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（オールジャパンでの医療機器開発プロジェクト） | 2017 | 国産医療機器創出促進基盤整備等事業 | 9 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（オールジャパンでの医療機器開発プロジェクト） | 2018 | 国産医療機器創出促進基盤整備等事業 | 9 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2018 | 革新的医療機器創出支援プロジェクト | 2 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2016 | 低侵襲がん診断装置 | 0 |
