| 国土交通省 | ハイジャック・テロ対策 | 2019 | 保安検査業務等委託費分担金 | 3,920 |
| 国土交通省 | ハイジャック・テロ対策 | 2016 | 保安検査員等委託費用分担金 | 3,790 |
| 国土交通省 | ハイジャック・テロ対策 | 2018 | 保安検業務等委託費用分担金 | 3,564 |
| 防衛省 | 航空機修理費（空自） | 2016 | 航空機の修理、航空機の維持に係る技術活動 他 | 3,497 |
| 国土交通省 | ハイジャック・テロ対策 | 2017 | 保安検査業務等委託費用分担金 | 3,443 |
| 国土交通省 | ハイジャック・テロ対策 | 2015 | 保安検査員等委託費用分担金 | 3,076 |
| 防衛省 | 航空機修理費（空自） | 2017 | 航空機の改修及び修理 他 | 3,003 |
| 防衛省 | 航空機修理費（空自） | 2015 | 航空機用部品の修理 他 | 2,985 |
| 国土交通省 | ハイジャック・テロ対策 | 2020 | 保安検査業務等委託費分担金 | 2,004 |
| 防衛省 | 航空機修理費（空自） | 2018 | 機体の検査・修理 | 1,679 |
| 防衛省 | 航空機修理費（空自） | 2017 | 航空機の維持に係る技術活動等 他 | 1,670 |
| 防衛省 | エンジン・オーバーホール経費 | 2020 | エンジンのオーバーホール等 | 1,405 |
| 防衛省 | 航空機修理費（空自） | 2017 | 航空機の維持に係る技術活動等 他 | 1,147 |
| 防衛省 | 航空機修理費（空自） | 2015 | 航空機用部品の修理 他 | 1,141 |
| 防衛省 | エンジン・オーバーホール経費 | 2019 | エンジンのオーバーホール等 | 1,022 |
| 防衛省 | エンジン・オーバーホール経費 | 2020 | エンジンのオーバーホール等 | 995 |
| 防衛省 | ｴﾝｼﾞﾝ･ｵｰﾊﾞｰﾎｰﾙ経費 | 2016 | ｴﾝｼﾞﾝのｵｰﾊﾞｰﾎｰﾙ等 | 946 |
| 国土交通省 | ハイジャック・テロ対策 | 2019 | 先進的な保安検査機器の購入費補助 | 940 |
| 防衛省 | ｴﾝｼﾞﾝ･ｵｰﾊﾞｰﾎｰﾙ経費 | 2015 | ｴﾝｼﾞﾝのｵｰﾊﾞｰﾎｰﾙ等 | 691 |
| 厚生労働省 | 検疫業務等に必要な事業 | 2020 | 検疫業務に係る支援業 | 658 |
| 国土交通省 | ハイジャック・テロ対策 | 2018 | 先進的な保安検査機器の購入補助 | 619 |
| 国土交通省 | ハイジャック・テロ対策 | 2017 | 先進的な保安検査機器の購入補助 | 476 |
| 農林水産省 | 農林水産物・輸出力維持・強化緊急対策事業のうち食品等輸出物流ルート確保緊急対策事業 | 2020 | 航空輸送業務 | 415 |
| 防衛省 | 航空機修理費（空自） | 2019 | 機体の検査・修理 | 213 |
| 国土交通省 | 空港等維持運営（空港） | 2015 | 飛行検査機保守点検整備作業 等 | 191 |
| 国土交通省 | ハイジャック・テロ対策 | 2015 | Ｘ線検査装置の購入補助 | 150 |
| 環境省 | 温室効果ガス観測技術衛星等による排出量検証に向けた技術高度化事業 | 2020 | ボーイング787型機に二酸化炭素連続測定装置（CME）と自動大気サンプリング装置（ASE）を搭載するための機体改修 | 111 |
| 国土交通省 | 空港等維持運営（空港） | 2016 | 飛行検査機保守点検整備作業 等（再委託） | 99 |
| 法務省 | 被収容者等の処遇 | 2016 | 集団送還に係る航空機貸切 | 63 |
| 国土交通省 | 空港等維持運営（空港） | 2017 | 【再委託】飛行検査機保守点検整備作業（平成２９年度ＳＡＡＢ型機） | 54 |
| 総務省 | 参議院議員通常選挙に必要な経費 | 2019 | 候補者用無料乗車券の発行（実績払） | 37 |
| 総務省 | 参議院議員通常選挙に必要な経費 | 2016 | 候補者用無料乗車券（航空券）の発行（実績払） | 32 |
| 環境省 | 温室効果ガス観測技術衛星「いぶき」（GOSAT）による地球環境観測事業 | 2015 | 温室効果気体観測装置をボーイング777-300ER型機に搭載するための機体改修 | 32 |
| 国土交通省 | 離島振興に必要な経費 | 2020 | 令和２年度 スマートアイランドアイランド推進実証調査業務（新上五島町） | 26 |
| 外務省 | 北米諸国との政治分野での協力推進 | 2020 | チャーター機借り上げ | 14 |
| 国土交通省 | ハイジャック・テロ対策 | 2020 | 先進的な保安検査機器の購入費補助 | 14 |
| 厚生労働省 | 慰霊巡拝事業 | 2020 | 硫黄島慰霊巡拝の実施に係る航空機の借上及び貸切運航 | 13 |
| 外務省 | 北米諸国との政治分野での協力推進 | 2018 | チャーター機 | 13 |
| 外務省 | 北米諸国との政治分野での協力推進 | 2017 | チャーター機 | 13 |
| 国土交通省 | ハイジャック・テロ対策 | 2016 | Ｘ線検査装置の購入補助 | 13 |
| 厚生労働省 | 慰霊巡拝事業 | 2019 | 硫黄島慰霊巡拝の実施に係る航空機の借上及び貸切運航 | 12 |
| 外務省 | 北米諸国との政治分野での協力推進 | 2016 | チャーター機 | 12 |
| 外務省 | 北米諸国との政治分野での協力推進 | 2015 | チャーター機 | 12 |
| 厚生労働省 | 慰霊巡拝事業 | 2017 | 第２次硫黄島慰霊巡拝に係るチャーター機借上 | 12 |
| 厚生労働省 | 慰霊巡拝事業 | 2017 | 第１次硫黄島慰霊巡拝実施に係るチャーター機借上 | 11 |
| 厚生労働省 | 慰霊巡拝事業 | 2016 | 硫黄島慰霊巡拝実施に係るチャーター機借上 | 11 |
| 厚生労働省 | 慰霊巡拝事業 | 2015 | 硫黄島慰霊巡拝実施に伴うチャーター機借上げ | 10 |
| 環境省 | 温室効果ガス観測技術衛星「いぶき」（GOSAT）シリーズによる排出量検証に向けた技術高度化事業 | 2017 | 次世代航空機であるボーイング787型機に二酸化炭素連続測定装（CME）と自動大気サンプリング装置（ASE）を搭載するための環境試験を行う。 | 9 |
| 国土交通省 | 航空機の運航に関する経費 | 2019 | 野外整備における作業場支援 | 9 |
| 環境省 | 地球環境保全試験研究費 | 2015 | 航空機による二酸化炭素濃度の観測ならびに大気サンプリング業務 | 9 |
| 外務省 | 領事業務啓発に係る経費（広報資料の作成・配布事業） | 2016 | 機内誌への広告作成・掲載 | 7 |
| 環境省 | 温室効果ガス観測技術衛星（GOSAT）による排出量監視に向けた技術高度化事業 | 2016 | 次世代航空機にCMEを搭載するための調査 | 6 |
| 環境省 | 地球環境保全試験研究費 | 2020 | 航空機による二酸化炭素濃度の観測・大気サンプリング業務一式 | 6 |
| 環境省 | 地球環境保全試験研究費 | 2019 | 航空機による二酸化炭素濃度の観測・大気サンプリング業務一式 | 6 |
| 環境省 | 地球環境保全試験研究費 | 2018 | 航空機による二酸化炭素濃度の観測・大気サンプリング業務一式 | 6 |
| 環境省 | 地球環境保全試験研究費 | 2017 | 航空機による二酸化炭素濃度の観測・大気サンプリング業務一式 | 6 |
| 環境省 | 地球環境保全試験研究費 | 2016 | 航空機による二酸化炭素濃度の観測ならびに大気サンプリング業務 | 6 |
| 文部科学省 | スポーツによる地域の価値向上プロジェクト | 2020 | 地域資源を活用したインバウンド拡大のためのモデル事業の実施（武道②） | 6 |
| 環境省 | 社会変革と物流脱炭素化を同時実現する先進技術導入促進事業（国土交通省連携事業） | 2020 | 計画策定 | 4 |
| 環境省 | 温室効果ガス観測技術衛星等による排出量検証に向けた技術高度化事業 | 2019 | 次世代航空機にCMEとASEを搭載するための実機調査 | 2 |
| 環境省 | 温室効果ガス観測技術衛星「いぶき」（GOSAT）シリーズによる排出量検証に向けた技術高度化事業 | 2018 | 次世代航空機にCMEとASEを搭載するための実機調査 | 2 |
| 国土交通省 | 一般空港等整備事業（直轄）（耐震対策事業） | 2016 | 共同溝耐震対策に伴う物件補償金 | 2 |
| 厚生労働省 | 障害者テレワーク（在宅勤務）導入のための総合支援事業 | 2017 | テレワークを導入して障害者を雇用し、そのノウハウを蓄積する | 2 |
| 環境省 | 温室効果ガス観測技術衛星等による排出量検証に向けた技術高度化事業 | 2020 | 次世代航空機にCMEとASEを搭載するための実機調査 | 1 |
| 国土交通省 | 航空機の運航に関する経費 | 2019 | ラバトリーサービス（汚物排出処理） | 1 |
| 外務省 | 海外における文化事業等 | 2015 | 現代日本文化フェスティバル「J-FEST２０１６」 (ロシア) | 1 |
| 国土交通省 | 航空従事者の技能証明試験 | 2020 | 航空従事者試験官（操縦士）及び運航審査官の技量拡張訓練（Ｂ７３７－８００・模擬飛行装置） | 1 |
| 国土交通省 | 航空従事者の技能証明試験 | 2018 | 航空従事者試験官（操縦士）及び運航審査官の技量拡張訓練（B737-800・模擬飛行装置） | 1 |
| 国土交通省 | 国産旅客機開発に伴う安全性審査方式の導入 | 2018 | 型式証明審査に係る研修 | 1 |
| 国土交通省 | 国産旅客機開発に伴う安全性審査方式の導入 | 2018 | 型式証明審査に係る研修 | 1 |
| 経済産業省 | 化石燃料のゼロ・エミッション化に向けたバイオジェット燃料・燃料アンモニア生産・利用技術開発事業 | 2020 | 複数年度契約：バイオジェット燃料のサプライチェーンの課題抽出と検証 | 0 |
| 国土交通省 | 航空輸送安全対策 | 2015 | ＪＣＺ－ＪＣＡＢ－１５１０ | 0 |
| 国土交通省 | 航空輸送安全対策 | 2016 | ＪＣＺ－ＪＣＡＢ－１６１０ | 0 |
| 国土交通省 | 国産旅客機開発に伴う安全性審査方式の導入 | 2015 | 航空英語に関する知識及び能力についての判定 | 0 |
| 国土交通省 | 航空輸送安全対策 | 2016 | ＪＣＺ－ＪＣＡＢ－１７０３ | 0 |
| 国土交通省 | 国産旅客機開発に伴う安全性審査方式の導入 | 2017 | 飛行試験審査に係る研修 | 0 |
| 国土交通省 | 国産旅客機開発に伴う安全性審査方式の導入 | 2019 | 型式証明審査に係る研修 | 0 |
| 国土交通省 | 国産旅客機開発に伴う安全性審査方式の導入 | 2018 | 型式証明審査に係る研修 | 0 |
| 国土交通省 | 国産旅客機開発に伴う安全性審査方式の導入 | 2016 | 指定航空英語能力判定航空運送事業者による能力判定 | 0 |
| 経済産業省 | 化石燃料のゼロ・エミッション化に向けたバイオジェット燃料・燃料アンモニア生産・利用技術開発事業 | 2020 | 複数年度契約：多様なバイオマス適用性の研究 | 0 |
| 外務省 | 中米カリブ諸国との協力強化 | 2016 | 会議飲料 | 0 |
| 外務省 | 2025年万博誘致活動推進経費 | 2018 | 空港貴賓室飲料代 | 0 |
