| 経済産業省 | 独立行政法人製品評価技術基盤機構運営費交付金 | 2020 | 製品評価技術基盤機構が行う業務の実施 | 7,426 |
| 経済産業省 | 独立行政法人製品評価技術基盤機構運営費交付金 | 2019 | 製品評価技術基盤機構が行う業務の実施 | 7,284 |
| 経済産業省 | 独立行政法人製品評価技術基盤機構運営費交付金 | 2018 | 製品評価技術基盤機構が行う業務の実施 | 7,243 |
| 経済産業省 | 独立行政法人製品評価技術基盤機構運営費交付金 | 2016 | 製品評価技術基盤機構が行う業務の実施 | 7,030 |
| 経済産業省 | 独立行政法人製品評価技術基盤機構運営費交付金 | 2017 | 製品評価技術基盤機構が行う業務の実施 | 6,927 |
| 経済産業省 | 独立行政法人製品評価技術基盤機構運営費交付金 | 2015 | 製品評価技術基盤機構が行う業務の実施 | 6,908 |
| 経済産業省 | 製品評価技術基盤機構施設整備費補助金 | 2015 | 製品評価技術基盤機構の施設整備 | 6,130 |
| 経済産業省 | 独立行政法人製品評価技術基盤機構施設整備費補助金 | 2019 | 製品評価技術基盤機構の施設整備 | 1,291 |
| 経済産業省 | 独立行政法人製品評価技術基盤機構施設整備費補助金 | 2016 | 製品評価技術基盤機構の施設整備 | 1,000 |
| 経済産業省 | 独立行政法人製品評価技術基盤機構施設整備費補助金 | 2017 | 製品評価技術基盤機構の施設整備 | 633 |
| 経済産業省 | ＮＩＴＥバイオテクノロジーセンター災害対応強化事業 | 2020 | 製品評価技術基盤機構の施設整備 | 548 |
| 経済産業省 | 独立行政法人製品評価技術基盤機構施設整備費補助金 | 2020 | 製品評価技術基盤機構の施設整備 | 311 |
| 経済産業省 | 特許微生物寄託等業務委託費 | 2017 | 特許微生物の寄託等業務、保管微生物の研究 | 145 |
| 経済産業省 | 特許微生物寄託等業務委託費 | 2016 | 特許微生物の寄託等業務、保管微生物の研究 | 132 |
| 経済産業省 | 特許微生物寄託等業務委託費 | 2015 | 特許微生物の寄託等業務、保管微生物の研究 | 130 |
| 経済産業省 | 特許微生物寄託等業務委託費 | 2019 | 特許微生物の寄託等業務、保管微生物の研究 | 126 |
| 経済産業省 | 特許微生物寄託等業務委託費 | 2018 | 特許微生物の寄託等業務、保管微生物の研究 | 123 |
| 経済産業省 | 特許微生物寄託等業務委託費 | 2020 | 特許微生物の寄託等業務、保管微生物の研究 | 118 |
| 経済産業省 | プラスチック有効利用高度化事業 | 2020 | 材料構造による生分解メカニズムの解明 | 57 |
| 経済産業省 | 植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発事業 | 2019 | 高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発 | 51 |
| 経済産業省 | 植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発事業 | 2017 | 高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発 | 47 |
| 経済産業省 | 植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発事業 | 2018 | 高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発 | 44 |
| 経済産業省 | 植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発事業 | 2020 | 高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発 | 28 |
| 経済産業省 | 新エネルギーに関する国際標準の獲得・普及促進事業委託費 | 2016 | 国際標準原案の開発・提案等（大型蓄電池システムの安全性に関する国際標準化・普及基盤構築） | 28 |
| 環境省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行経費 | 2017 | 化学物質情報基盤システム委託 | 27 |
| 環境省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行経費 | 2018 | 化学物質情報基盤システム委託 | 26 |
| 環境省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行経費 | 2016 | 化学物質情報基盤システム委託業務 | 25 |
| 環境省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行経費 | 2020 | 化学物質情報基盤システム委託 | 24 |
| 環境省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行経費 | 2019 | 化学物質情報基盤システム委託 | 24 |
| 環境省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行経費 | 2015 | 化学物質情報基盤システム委託業務 | 24 |
| 厚生労働省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行費 | 2017 | 平成29年度化学物資情報基盤システム事業委託費 | 23 |
| 厚生労働省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行費 | 2018 | 平成30年度化学物資情報基盤システム事業委託費 | 23 |
| 経済産業省 | 新エネルギーに関する国際標準の獲得・普及促進事業委託費 | 2017 | 国際標準原案の開発・提案等（大型蓄電池システムの安全性に関する国際標準化・普及基盤構築） | 23 |
| 経済産業省 | 省エネルギー等に関する国際標準の獲得・普及促進事業委託費 | 2019 | 国際標準原案の開発・提案等（大型蓄電システムの運用期間における安全性に関する国際標準化） | 22 |
| 経済産業省 | バイオ燃料製造の有用要素技術開発事業 | 2015 | 糖化酵素の高機能化へ向けての成分酵素の強化 | 22 |
| 厚生労働省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行費 | 2016 | 平成28年度化学物資情報基盤システム事業委託費 | 22 |
| 厚生労働省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行費 | 2015 | 化学物質情報基盤システム運営費 | 21 |
| 厚生労働省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行費 | 2019 | 平成31年度化学物資情報基盤システム事業委託費 | 21 |
| 厚生労働省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行費 | 2020 | 化学物資情報基盤システム事業委託費 | 20 |
| 経済産業省 | 省エネルギー等に関する国際標準の獲得・普及促進事業委託費 | 2018 | 国際標準原案の開発・提案等（大型蓄電システムの運用期間における安全性に関する国際標準化） | 20 |
| 経済産業省 | 省エネルギー等に関する国際標準の獲得・普及促進事業委託費 | 2020 | 国際標準原案の開発・提案等（大型蓄電システムの運用期間における安全性に関する国際標準化） | 19 |
| 経済産業省 | バイオ燃料製造の有用要素技術開発事業 | 2016 | 糖化酵素の高機能化へ向けての成分酵素の強化 | 17 |
| 環境省 | PRTR制度運用・データ活用事業 | 2020 | PRTRデータ管理・公表・開示システム等改良 | 15 |
| 環境省 | ＰＲＴＲ制度運用・データ活用事業 | 2017 | ＰＲＴＲ届出データ記録・集計用電子計算機の維持管理事業委託 | 13 |
| 環境省 | ＰＲＴＲ制度運用・データ活用事業 | 2016 | ＰＲＴＲ届出データ記録・集計用電子計算機の維持管理事業委託 | 13 |
| 環境省 | ＰＲＴＲ制度運用・データ活用事業 | 2015 | ＰＲＴＲ届出データ記録・集計用電子計算機の維持管理事業委託 | 13 |
| 環境省 | PRTR制度運用・データ活用事業 | 2018 | ＰＲＴＲ届出データ記録・集計用電子計算機の維持管理事業委託 | 12 |
| 環境省 | PRTR制度運用・データ活用事業 | 2020 | ＰＲＴＲ届出データ記録・集計用電子計算機の維持管理事業委託 | 10 |
| 環境省 | PRTR制度運用・データ活用事業 | 2019 | ＰＲＴＲ届出データ記録・集計用電子計算機の維持管理事業委託 | 10 |
| 経済産業省 | 新エネルギーに関する国際標準の獲得・普及促進事業委託費
（旧：新エネルギー等国際標準化・普及基盤事業） | 2015 | 国際標準案作成・提案等 | 10 |
| 環境省 | 廃棄物処理等に係る情報提供経費等 | 2016 | 一般廃棄物処理業等ＰＲＴＲ届出データ電子化等業務 | 9 |
| 環境省 | 廃棄物処理等に係る情報提供経費等 | 2020 | 一般廃棄物処理業等ＰＲＴＲ届出データ電子化等業務 | 9 |
| 環境省 | 廃棄物処理等に係る情報提供経費等 | 2019 | 一般廃棄物処理業等ＰＲＴＲ届出データ電子化等業務 | 9 |
| 環境省 | 廃棄物処理等に係る情報提供経費等 | 2018 | 一般廃棄物処理業等ＰＲＴＲ届出データ電子化等業務 | 9 |
| 環境省 | 廃棄物処理等に係る情報提供経費等 | 2017 | 一般廃棄物処理業等ＰＲＴＲ届出データ電子化等業務 | 9 |
| 環境省 | 廃棄物処理等に係る情報提供経費等 | 2015 | 一般廃棄物処理業等ＰＲＴＲ届出データ電子化等業務 | 9 |
| 環境省 | PRTR制度運用・データ活用事業 | 2020 | PRTRデータ管理･公表･開示システムの保守・運用等補助 | 6 |
| 経済産業省 | 新産業創出・マテリアル革新に向けた新技術先導研究プログラム（旧：新産業創出に向けた新技術先導研究プログラム） | 2019 | ヒトマイクロバイオームの産業利用に向けた、解析技術及び革新的制御技術の開発 | 5 |
| 経済産業省 | 新産業創出に向けた新技術先導研究プログラム | 2018 | ヒトマイクロバイオームの産業利用に向けた、解析技術及び革新的制御技術の開発 | 3 |
| 環境省 | 土壌汚染対策費 | 2019 | 大量培養 | 2 |
| 環境省 | 土壌汚染対策費 | 2018 | 大量培養 | 2 |
| 経済産業省 | 新産業創出・マテリアル・バイオ革新に向けた新技術先導研究プログラム（旧：新産業創出・マテリアル革新に向けた新技術先導研究プログラム） | 2020 | ヒトマイクロバイオームの産業利用に向けた、解析技術及び革新的制御技術の開発 | 1 |
| 国土交通省 | 独立行政法人自動車技術総合機構運営費交付金 | 2016 | ASNITE製品認証機関認定に係る契約検査手数料 | 1 |
| 環境省 | 市街地土壌汚染対策費 | 2015 | RHA1菌遺伝子数の分析 | 1 |
| 厚生労働省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行費 | 2015 | ＰＲＴＲ対象化学物質に係る届出内容の内容確認及び電子化等業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行費 | 2019 | PRTR法対象化学物質情報電子化等業務 | 1 |
| 国土交通省 | 独立行政法人自動車技術総合機構運営費交付金 | 2017 | ASNITE製品認証機関認定に係る契約検査手数料 | 1 |
| 厚生労働省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行費 | 2018 | PRTR法対象化学物質情報電子化等業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行費 | 2017 | PRTR法対象化学物質情報電子化等業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行費 | 2016 | 化学物質に係る届出内容の内容確認及び電子化等業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行費 | 2020 | PRTR法対象化学物質情報電子化等業務 | 1 |
| 厚生労働省 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律施行費 | 2020 | ＰＲＴＲ対象化学物質に係る届出内容確認及び電子化業務 | 1 |
| 環境省 | 土壌汚染対策費 | 2020 | 微生物叢の解析 | 0 |
