| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（ジャパン・キャンサーリサーチ・プロジェクト） | 2019 | | 209 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（ジャパン・キャンサーリサーチ・プロジェクト） | 2018 | - | 204 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（再生医療実現プロジェクト） | 2018 | - | 152 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（再生医療実現プロジェクト） | 2019 | | 136 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（ジャパン・キャンサーリサーチ・プロジェクト） | 2018 | EPHB4受容体陽性悪性軟部腫瘍を標的とした非ウイルス遺伝子改変キメラ抗原受容体T細胞療法の非臨床試験 | 91 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（再生医療実現プロジェクト） | 2018 | 培養角膜内皮細胞を用いた水疱性角膜症に対する革新的再生医療の早期薬事承認による社会還元 | 86 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（ジャパン・キャンサーリサーチ・プロジェクト） | 2019 | EPHB4受容体陽性悪性軟部腫瘍を標的とした非ウイルス遺伝子改変キメラ抗原受容体T細胞療法の非臨床試験 | 85 |
| 厚生労働省 | 臨床研修費 | 2019 | 臨床研修費 | 74 |
| 経済産業省 | 再生医療の産業化に向けた評価基盤技術開発事業 | 2016 | 均質な培養ヒト角膜内皮細胞による安全な再生医療の確立のための革新的評価法の開発 | 73 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（再生医療実現プロジェクト） | 2019 | 培養角膜内皮細胞を用いた水疱性角膜症に対する革新的再生医療の社会還元 | 71 |
| 厚生労働省 | 臨床研修費 | 2018 | 臨床研修費 | 70 |
| 厚生労働省 | 臨床研修費 | 2015 | 医師臨床研修の実施 | 70 |
| 厚生労働省 | 臨床研修費 | 2020 | 臨床研修費 | 69 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（ジャパン・キャンサーリサーチ・プロジェクト） | 2018 | がん化学予防薬の実用化をめざした大規模臨床研究 | 67 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（再生医療実現プロジェクト） | 2018 | 重症虚血肢に対し、筋組織酸素飽和度（StO2）をモニタリングする近赤外線分光装置（NIRS）を使用した至適運動療法を確立する研究 | 66 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（再生医療実現プロジェクト） | 2019 | 重症虚血肢に対し、筋組織酸素飽和度（StO2）をモニタリングする近赤外線分光装置（NIRS）を使用した至適運動療法を確立する研究 | 65 |
| 厚生労働省 | 臨床研修費 | 2016 | 医師臨床研修の実施 | 62 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人日本医療研究開発機構運営費交付金に必要な経費 | 2017 | 研究データの信頼性確保を中心としたモデル教材開発並びに教育機能と評価尺度を備えた履修管理システムの構築他 | 60 |
| 文部科学省 | 国立研究開発行政法人日本医療研究開発機構運営費交付金に必要な経費 | 2018 | 研究データの信頼性確保を中心としたモデル教材開発並びに教育機能と評価尺度を備えた履修管理システムの構築 他 | 60 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（ジャパン・キャンサーリサーチ・プロジェクト） | 2019 | がん化学予防薬の実用化をめざした大規模臨床研究 | 58 |
| 厚生労働省 | 臨床研修費 | 2017 | 医師臨床研修の実施 | 58 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（脳とこころの健康大国実現プロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 2017 | アルツハイマー病の既存髄液バイオマーカーの血液および脳由来エクソソームへの展開とそれらを応用した多項目血液マーカーによる診断システムの実用化 | 40 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人日本医療研究開発機構運営費交付金に必要な経費 | 2016 | 研究データの信頼性確保を中心としたモデル教材開発並びに教育機能と評価尺度を備えた履修管理システムの構築 他 | 39 |
| 文部科学省 | 新型感染症対策高度先端医療人材養成事業 | 2020 | 新型感染症対策高度先端医療人材養成事業 | 33 |
| 厚生労働省 | 特定疾患治療研究費補助金 | 2019 | 特定疾患の医療費補助等の実施 | 32 |
| 文部科学省 | 大学間連携共同教育推進事業 | 2016 | 時代が求める新たな教養教育の京都三大学共同（モデル）推進事業 | 30 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（脳とこころの健康大国実現プロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 2018 | アルツハイマー病の既存髄液バイオマーカーの血液および脳由来エクソソームへの展開とそれらを応用した多項目血液マーカーによる診断システムの実用化 | 30 |
| 文部科学省 | 独立行政法人日本学術振興会運営費交付金に必要な経費 | 2017 | 研究拠点形成事業（国際ゲノム研究を基盤とした難治性眼疾患病態解明と治療戦略構築のための研究拠点形成 他） | 25 |
| 文部科学省 | 独立行政法人日本学術振興会運営費交付金に必要な経費 | 2016 | 研究拠点形成事業（エジプト・アジアと連携した人獣共通感染症研究の拠点形成と次世代リーダー育成 他） | 25 |
| 文部科学省 | 独立行政法人日本学術振興会運営費交付金に必要な経費 | 2015 | 研究拠点形成事業（国際ゲノム研究を基盤とした難治性眼疾患病態解明と治療戦略構築のための研究拠点形成） | 16 |
| 経済産業省 | 再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業 | 2020 | 先端的な遺伝子・細胞治療技術開発 | 9 |
| 経済産業省 | 再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業 | 2018 | 遺伝子・細胞治療研究開発基盤事業 | 7 |
| 農林水産省 | 戦略的国際共同研究推進事業（国益に直結した国際連携の推進に要する経費） | 2019 | コムギいもち病に対する圃場抵抗性遺伝子の探索 | 4 |
| 農林水産省 | 食品の安全性と動物衛生の向上のためのプロジェクト | 2015 | 新規ウィルスベクターを用いた鳥インフルエンザワクチンの開発 | 4 |
| 復興庁 | 食料生産地域再生のための先端技術展開事業 | 2020 | 非交換性カリによる放射性セシウムの移行抑制の評価等 | 3 |
| 経済産業省 | 再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業 | 2019 | 遺伝子・細胞治療研究開発基盤事業 | 3 |
| 農林水産省 | 食品の安全性と動物衛生の向上のためのプロジェクト | 2017 | 新規ウィルスベクターを用いた鳥インフルエンザワクチンの開発 | 3 |
| 農林水産省 | 食品の安全性と動物衛生の向上のためのプロジェクト | 2016 | 新規ウィルスベクターを用いた鳥インフルエンザワクチンの開発 | 3 |
| 復興庁 | 食料生産地域再生のための先端技術展開事業 | 2018 | 非交換性カリによる放射性セシウムの移行抑制の評価等 | 3 |
| 復興庁 | 食料生産地域再生のための先端技術展開事業 | 2019 | 非交換性カリによる放射性セシウムの移行抑制の評価等 | 2 |
| 厚生労働省 | 管理栄養士専門分野別人材育成事業費 | 2019 | 活用支援ガイドの検討 | 0 |
