| 文部科学省 | 国立大学法人運営費交付金に必要な経費 | 2015 | 本法人が行う教育研究活動等の業務 | 28,809 |
| 文部科学省 | 国立大学法人の運営に必要な経費 | 2016 | 本法人が行う教育研究活動等の業務 | 28,657 |
| 文部科学省 | 国立大学法人の運営に必要な経費 | 2018 | 本法人が行う教育研究活動等の業務 | 28,181 |
| 文部科学省 | 国立大学法人の運営に必要な経費 | 2017 | 本法人が行う教育研究活動等の業務 | 27,801 |
| 文部科学省 | 国立大学法人の運営に必要な経費 | 2019 | 本法人が行う教育研究活動等の業務 | 27,040 |
| 文部科学省 | 国立大学法人の運営に必要な経費 | 2020 | 本法人が行う教育研究活動等の業務 | 26,345 |
| 文部科学省 | 国立大学法人施設整備（大型特別機械整備費等（最先端等）） | 2015 | 30ｍ光学赤外線望遠鏡（TMT）計画の推進 | 1,882 |
| 文部科学省 | 国立大学法人施設整備（大型特別機械整備費等（最先端等）） | 2019 | 30m光学赤外線望遠鏡（TMT）計画の推進 | 1,746 |
| 文部科学省 | 国立大学法人における先端研究の推進 | 2019 | 大型電波望遠鏡「アルマ」による国際共同利用研究の推進 | 1,412 |
| 文部科学省 | 国立大学法人における先端研究の推進 | 2020 | 大型電波望遠鏡「アルマ」による国際共同利用研究の推進 | 1,412 |
| 文部科学省 | 国立大学法人における先端研究の推進 | 2018 | 大型電波望遠鏡「アルマ」による国際共同利用研究の推進 | 1,269 |
| 文部科学省 | 国立大学法人における先端研究の推進 | 2017 | 大型電波望遠鏡「アルマ」による国際共同利用研究の推進 | 1,262 |
| 文部科学省 | 国立大学法人施設整備（大型特別機械整備費等（最先端等）） | 2016 | 30ｍ光学赤外線望遠鏡（TMT）計画の推進 他 | 1,033 |
| 文部科学省 | 国立大学法人施設整備（大型特別機械整備費等（最先端等）） | 2020 | 30m光学赤外線望遠鏡（TMT）計画の推進 | 650 |
| 文部科学省 | 国立大学法人施設整備（大型特別機械整備費等（最先端等）） | 2020 | 遺伝子改変モデル動物研究基盤設備 | 480 |
| 文部科学省 | 国立大学法人施設整備（大型特別機械整備費等（最先端等）） | 2017 | ３０ｍ光学赤外線望遠鏡（ＴＭＴ）計画の推進 | 462 |
| 文部科学省 | ナノテクノロジー・材料科学技術の戦略的研究開発・基盤整備 | 2018 | ナノテクノロジープラットフォーム分子・物質合成プラットフォーム代表機関 | 451 |
| 文部科学省 | 国立大学法人施設整備（大型特別機械整備費等（最先端等）） | 2017 | ３０ｍ光学赤外線望遠鏡（ＴＭＴ）計画の推進 | 400 |
| 文部科学省 | ナノテクノロジー・材料科学技術の戦略的研究開発・基盤整備 | 2015 | ナノテクノロジープラットフォーム分子・物質合成プラットフォーム代表機関 | 357 |
| 文部科学省 | ナノテクノロジー・材料科学技術の戦略的研究開発・基盤整備 | 2016 | ナノテクノロジープラットフォーム分子・物質合成プラットフォーム代表機関 | 337 |
| 文部科学省 | ナノテクノロジー・材料科学技術の戦略的研究開発・基盤整備 | 2019 | ナノテクノロジープラットフォーム分子・物質合成プラットフォーム代表機関 | 334 |
| 文部科学省 | ナノテクノロジープラットフォーム | 2020 | ナノテクノロジープラットフォーム分子・物質合成プラットフォーム代表機関 | 330 |
| 文部科学省 | ナノテクノロジー・材料科学技術の戦略的研究開発・基盤整備 | 2017 | ナノテクノロジープラットフォーム分子・物質合成プラットフォーム代表機関 | 327 |
| 文部科学省 | 国立大学法人施設整備（大型特別機械整備費等（最先端等）） | 2018 | ３０ｍ光学赤外線望遠鏡（ＴＭＴ）計画の推進 | 310 |
| 文部科学省 | 研究大学強化促進事業 | 2016 | 研究支援人材群の確保・活用と集中的な研究環境改革を組み合わせた研究力強化の取組 | 291 |
| 文部科学省 | 研究大学強化促進事業 | 2017 | 研究支援人材群の確保・活用と集中的な研究環境改革を組み合わせた研究力強化の取組 | 290 |
| 文部科学省 | 研究大学強化促進事業 | 2018 | 研究支援人材群の確保・活用と集中的な研究環境改革を組み合わせた研究力強化の取組 | 283 |
| 文部科学省 | スーパーコンピュータ「富岳」（ポスト「京」）の開発 | 2018 | 重点課題⑤「エネルギーの高効率な創出、変換・貯蔵、利用の新規基盤技術の開発」の研究開発 | 250 |
| 文部科学省 | ポスト「京」の開発 | 2016 | 重点課題⑤「エネルギーの高効率な創出、変換・貯蔵、利用の新規基盤技術の開発」の研究開発 | 250 |
| 文部科学省 | 研究大学強化促進事業 | 2019 | 研究支援人材群の確保・活用と集中的な研究環境改革を組み合わせた研究力強化の取組 | 240 |
| 文部科学省 | ポスト「京」の開発 | 2017 | 重点課題⑤「エネルギーの高効率な創出、変換・貯蔵、利用の新規基盤技術の開発」の研究開発 | 240 |
| 文部科学省 | 国立大学法人施設整備（大型特別機械整備費等（最先端等）） | 2019 | 30m光学赤外線望遠鏡（TMT）計画の推進 | 235 |
| 文部科学省 | 研究大学強化促進事業 | 2020 | 研究支援人材群の確保・活用と集中的な研究環境改革を組み合わせた研究力強化の取組 | 233 |
| 文部科学省 | スーパーコンピュータ「富岳」の開発 | 2019 | 重点課題⑤「エネルギーの高効率な創出、変換・貯蔵、利用の新規基盤技術の開発」の研究開発 | 221 |
| 文部科学省 | 国立大学改革基盤強化促進事業 | 2017 | 共同利用・共同研究による国立大学等の機能強化基盤改革構想を実現するための異分野融合・イノベーション促進に資する「分子系の合理的デザイン・微細加工システム」 | 80 |
| 文部科学省 | HPCI戦略プログラム | 2015 | 「密度汎関数法によるナノ構造時空場での電子機能予測とその実現」の研究推進、計算科学技術推進体制構築 | 66 |
| 経済産業省 | エネルギー・環境分野の中長期的課題解決に資する新技術先導研究プログラム（旧：エネルギー・環境新技術先導プログラム） | 2015 | ｐｎ制御有機半導体単結晶太陽電池の開発 | 52 |
| 文部科学省 | 光・量子科学研究拠点形成に向けた基盤技術開発等 | 2015 | 融合光新創生ネットワーク（施設供用・人材育成・光源開発）等 | 47 |
| 文部科学省 | ポスト「京」の開発 | 2015 | 重点課題⑤「エネルギーの高効率な創出、変換・貯蔵、利用の新規基盤技術の開発」の研究開発 | 47 |
| 文部科学省 | ナノテクノロジー・材料科学技術の戦略的研究開発・基盤整備 | 2018 | 分子・物質合成プラットフォーム実施機関 | 46 |
| 文部科学省 | 光・量子科学研究拠点形成に向けた基盤技術開発等 | 2016 | 融合光新創生ネットワーク（施設供用・人材育成・光源開発）等 | 44 |
| 文部科学省 | 光・量子科学研究拠点形成に向けた基盤技術開発等 | 2017 | 融合光新創生ネットワーク | 36 |
| 文部科学省 | 幅広いアプローチ（ＢＡ）活動の推進に必要な経費 | 2020 | 大学等を対象とする先進的核融合研究開発への参画を促すための共同研究 | 30 |
| 文部科学省 | 幅広いアプローチ（ＢＡ）活動の推進に必要な経費 | 2019 | 大学等を対象とする先進的核融合研究開発への参画を促すための共同研究 | 30 |
| 文部科学省 | ナノテクノロジー・材料科学技術の戦略的研究開発・基盤整備 | 2015 | 固体表面の電子論の開発と固体触媒・電極・金属微粒子触媒の理論研究 | 24 |
| 文部科学省 | 科学技術に関する人材の養成・活躍促進 | 2019 | 複数の機関と連携してコンソーシアムを形成し、若手研究者の育成プログラムを開発する。 | 23 |
| 文部科学省 | ナノテクノロジー・材料科学技術の戦略的研究開発・基盤整備 | 2018 | 理論計算科学による触媒・電池の元素戦略 | 22 |
| 文部科学省 | ナノテクノロジー・材料科学技術の戦略的研究開発・基盤整備 | 2016 | 固体表面の電子論の開発と固体触媒・電極・金属微粒子触媒の理論研究 | 21 |
| 経済産業省 | 戦略的次世代バイオマスエネルギー利用技術開発事業 | 2015 | 海洋性緑藻による油脂生産技術の研究開発 | 20 |
| 文部科学省 | HPCI戦略プログラム | 2015 | 「ダークマターの密度ゆらぎから生まれる第１世代天体形成」に関する研究開発並びに計算科学技術推進体制構築 | 20 |
| 経済産業省 | エネルギー・環境分野の中長期的課題解決に資する新技術先導研究プログラム | 2018 | ヒドリドを利用した新規エネルギーデバイスの開発 | 13 |
| 文部科学省 | 大学発グリーンイノベーション創出事業 | 2015 | スーパーバイオマス育種研究における、光化学系エネルギー転換調節と効率向上 | 12 |
| 文部科学省 | 独立行政法人日本学術振興会運営費交付金に必要な経費 | 2015 | 日中韓フォーサイト事業（高性能プラズマの定常保持に必要な物理基盤の形成） | 9 |
| 文部科学省 | 独立行政法人日本学術振興会運営費交付金に必要な経費 | 2016 | 日中韓フォーサイト事業（高性能プラズマの定常保持に必要な物理基盤の形成） | 8 |
| 文部科学省 | 独立行政法人日本学術振興会運営費交付金に必要な経費 | 2017 | 日中韓フォーサイト事業（高性能プラズマの定常保持に必要な物理基盤の形成） | 5 |
| 環境省 | 環境汚染等健康影響基礎調査費 | 2015 | EXTEND2010に係る研究 | 4 |
| 環境省 | 環境汚染等健康影響基礎調査費 | 2015 | EXTEND2010に係る研究 | 3 |
| 文部科学省 | 国立大学法人施設整備（大型特別機械整備費等（最先端等）） | 2020 | 大型光学赤外線望遠鏡「すばる」の共同利用研究 | 1 |
