| 経済産業省 | ウイルス等感染症対策技術開発事業 | 2020 | 実証・改良研究支援 | 1,080 |
| 文部科学省 | 先端融合領域イノベーション創出拠点形成プログラム | 2015 | 拠点翻訳後修飾プロテオミクス医療研究拠点の形成 | 431 |
| 文部科学省 | 先端融合領域イノベーション創出拠点形成プログラム | 2017 | 拠点翻訳後修飾プロテオミクス医療研究拠点の形成 | 422 |
| 文部科学省 | 先端融合領域イノベーション創出拠点形成プログラム | 2016 | 拠点翻訳後修飾プロテオミクス医療研究拠点の形成 | 422 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（難病克服プロジェクト） | 2019 | - | 308 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（難病克服プロジェクト） | 2019 | 希少難病の高精度診断と病態解明のためのオミックス拠点の構築 | 274 |
| 経済産業省 | ウイルス等感染症対策技術開発事業 | 2020 | 実証・改良研究支援 | 151 |
| 文部科学省 | 共用プラットフォーム形成支援プログラム | 2017 | 臨床質量分析共用プラットフォームに係る | 68 |
| 文部科学省 | 先端研究基盤共用促進事業 | 2018 | 臨床質量分析共用プラットフォームに係る | 67 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（オールジャパンでの医療機器開発） | 2015 | 磁性抗がん剤を用いた医療機器の開発 | 57 |
| 厚生労働省 | 臨床研修費 | 2020 | 臨床研修費 | 52 |
| 文部科学省 | 先端研究基盤共用促進事業 | 2016 | 臨床質量分析共用プラットフォームに係る | 47 |
| 経済産業省 | 次世代治療・診断実現のための創薬基盤技術開発事業 | 2020 | 患者層別化マーカー探索技術の開発／医療ニーズの高い特定疾患・薬剤に対する患者層別化基盤技術の開発 | 44 |
| 文部科学省 | 未来価値創造人材育成プログラム | 2019 | 超スマート社会の実現に向けたデータサイエンティスト育成事業 | 41 |
| 文部科学省 | 新型感染症対策高度先端医療人材養成事業 | 2020 | 新型感染症対策高度先端医療人材養成事業 | 38 |
| 文部科学省 | 未来価値創造人材育成プログラム | 2018 | 超スマート社会の実現に向けたデータサイエンティスト育成事業 | 35 |
| 経済産業省 | 予防・健康づくりの社会実装に向けた研究開発基盤整備事業（旧名称：認知症等対策官民イノベーション実証基盤整備事業） | 2020 | 認知症予防を目指した多因子介入によるランダム化比較研究(分担研究機関) | 34 |
| 文部科学省 | 未来価値創造人材育成プログラム | 2020 | 超スマート社会の実現に向けたデータサイエンティスト育成事業 | 34 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（難病克服プロジェクト） | 2019 | ファロー四徴症の根治治療を可能にする血管パッチの開発 | 26 |
| 文部科学省 | 特色ある共同研究拠点の整備の推進事業 | 2018 | マルチオミックスによる遺伝子発現制御の先端的医学共同研究拠点の整備 | 25 |
| 文部科学省 | 先端研究基盤共用促進事業 | 2020 | NMR共用プラットフォーム | 22 |
| 経済産業省 | 再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業 | 2020 | 階層的共培養を基礎とするLiver/Gut on-a-chipの開発：インビトロ腸肝循環評価を目指した高度な代謝と極性輸送の再現 | 22 |
| 文部科学省 | 先端研究基盤共用促進事業 | 2019 | NMR共用プラットフォーム | 22 |
| 文部科学省 | 先端研究基盤共用促進事業 | 2018 | NMR共用プラットフォーム | 22 |
| 文部科学省 | 共用プラットフォーム形成支援プログラム | 2017 | NMR共用プラットフォーム | 22 |
| 文部科学省 | 先端研究基盤共用促進事業 | 2016 | NMR共用プラットフォーム | 22 |
| 文部科学省 | 特色ある共同研究拠点の整備の推進事業 | 2019 | マルチオミックスによる遺伝子発現制御の先端的医学共同研究拠点の整備 | 20 |
| 文部科学省 | 基礎研究医養成活性化プログラム | 2017 | 実践力と研究力を備えた法医学者育成事業 | 20 |
| 文部科学省 | 特色ある共同研究拠点の整備の推進事業 | 2020 | マルチオミックスによる遺伝子発現制御の先端的医学共同研究拠点の整備 | 16 |
| 文部科学省 | 基礎研究医養成活性化プログラム | 2019 | 実践力と研究力を備えた法医学者育成事業 | 15 |
| 文部科学省 | 基礎研究医養成活性化プログラム | 2018 | 実践力と研究力を備えた法医学者育成事業 | 15 |
| 文部科学省 | 基礎研究医養成活性化プログラム | 2020 | 実践力と研究力を備えた法医学者育成事業 | 11 |
| 文部科学省 | HPCI戦略プログラム | 2015 | 核内ＤＮＡ結合タンパク質の機能ダイナミクス研究 | 8 |
| 総務省 | 消防防災分野の研究開発に必要な経費 | 2015 | 緊急度判定体系の市民への普及・利用促進ツールの開発（委託費） | 8 |
| 総務省 | 消防防災分野の研究開発に必要な経費 | 2016 | 緊急度判定体系の市民への普及・利用促進ツールの開発 | 7 |
| 厚生労働省 | がんのゲノム医療・集学的治療推進事業等 | 2017 | がんのゲノム医療・集学的治療推進事業の実施 | 7 |
| 農林水産省 | 戦略的プロジェクト研究推進事業のうち蚕業革命による新産業創出プロジェクト | 2018 | ヒト用医薬品等の有効性・安全性向上技術の開発 | 4 |
| 農林水産省 | 戦略的プロジェクト研究推進事業のうち蚕業革命による新産業創出プロジェクト | 2017 | ヒト用医薬品等の有効性・安全性向上技術の開発 | 4 |
| 農林水産省 | 戦略的プロジェクト研究推進事業のうち蚕業革命による新産業創出プロジェクト | 2019 | ヒト用医薬品等の有効性・安全性向上技術の開発 | 3 |
| 文部科学省 | 科学技術に関する人材の養成・活躍促進 | 2016 | ポストドクターを育成し、多様なキャリアパスを開拓する | 3 |
| 農林水産省 | 農林水産研究推進事業 | 2020 | ヒト用医薬品等の有効性・安全性向上技術の開発 | 3 |
| 内閣府 | 食品健康影響評価技術の研究に必要な経費 | 2020 | 食品用器具・容器包装に用いられるビスフェノールAのリスク評価に資する科学的知見の検討に関する研究 | 2 |
| 経済産業省 | 次世代治療・診断実現のための創薬基盤技術開発事業 | 2020 | 糖鎖利用による革新的創薬技術開発事業 | 2 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2017 | 低侵襲がん診療装置 | 2 |
| 厚生労働省 | 慢性疼痛診療システム構築モデル事業 | 2018 | 慢性疼痛診療研修会の実施等 | 2 |
| 厚生労働省 | 慢性疼痛診療システム構築モデル事業 | 2019 | 慢性疼痛診療研修会の実施等 | 2 |
| 文部科学省 | ＥＢＰＭをはじめとした統計改革を推進するための調査研究 | 2020 | 社会教育調査を活用した地方公共団体のEBPM推進に関する調査研究 | 2 |
| 経済産業省 | クリーンエネルギー分野における革新的技術の国際共同研究開発事業 | 2020 | 革新的アポミクシス誘導技術の国際共同研究開発 | 1 |
| 厚生労働省 | 精神障害者保健福祉対策 | 2015 | 自殺未遂者再企図防止に係るケースマネージメント及び研修の開催等 | 1 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2016 | 低侵襲がん診断装置 | 0 |
