| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2020 | ヘリコプター搭載型（6,500トン型）巡視船1隻建造 | 12,096 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2019 | ヘリコプター2機搭載型（6,000トン型）巡視船2隻建造 | 8,690 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2020 | 大型測量船1隻建造 | 7,668 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2020 | 大型測量船1隻建造 | 7,668 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2017 | 海底熱水鉱床の採鉱・揚鉱パイロット試験及び技術・コスト課題抽出等
| 5,989 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2020 | 大型巡視船（練習船）1隻建造 | 3,776 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2020 | 大型巡視船（練習船）1隻建造 | 3,776 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人海洋研究開発機構船舶建造に必要な経費 | 2019 | 地球深部探査船「ちきゅう」の整備 | 3,099 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2017 | ヘリコプター搭載型（6,500トン型）巡視船1隻建造 | 2,964 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2020 | ヘリコプター搭載型（6,500トン型）巡視船1隻建造 | 2,835 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2020 | ヘリコプター搭載型（6,500トン型）巡視船1隻建造 | 2,835 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2019 | ヘリコプター搭載型（6,000トン型）巡視船1隻建造 | 2,673 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2018 | ヘリコプター搭載型（６，０００トン型）巡視船１隻建造 | 2,673 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2019 | ヘリコプター2機搭載型巡視船1隻建造 | 2,066 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2018 | ヘリコプター2機搭載型巡視船1隻建造 | 2,065 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2019 | 大型測量船１隻建造 | 2,025 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2018 | 大型測量船1隻建造 | 2,025 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2020 | 大型測量船1隻建造 | 1,986 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2020 | 大型測量船1隻建造 | 1,917 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2019 | 大型測量船１隻建造 | 1,902 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人海洋研究開発機構船舶建造に必要な経費 | 2020 | 「白鳳丸」の改造【令和２年度～令和３年度】 | 1,888 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2018 | 大型測量船1隻建造 | 1,863 |
| 防衛省 | 艦船修理費（海自） | 2019 | 護衛艦定期検査等 | 1,810 |
| 防衛省 | 艦船修理費(海自) | 2018 | 【歳出化】護衛艦定期検査等 | 1,351 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2018 | ヘリコプター搭載型（6,500トン型）巡視船１隻建造 | 1,124 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2020 | 海底熱水鉱床に係る採鉱・揚鉱全体システム検討 | 887 |
| 財務省 | 税関監視艇整備運航経費 | 2020 | 監視艇建造（令和元年度国庫債務負担行為） | 820 |
| 財務省 | 税関監視艇整備運航経費 | 2019 | 監視艇建造（令和元年度国庫債務負担行為） | 820 |
| 防衛省 | 艦船修理費（海自） | 2020 | 補給艦定検 | 641 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2020 | 船の修繕、艤装・艤装解除、調査機器修繕等 | 584 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2018 | 海底熱水鉱床採鉱・揚鉱パイロット試験に関する追加検証 | 570 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2020 | ヘリコプター搭載型（6,500トン型）巡視船1隻建造 | 520 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2019 | 海底熱水鉱床採鉱・揚鉱パイロット試験に関する追加検証 | 519 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2019 | 海底熱水鉱床に係る採鉱・揚鉱全体システム検討 | 478 |
| 防衛省 | 艦船修理費(海自) | 2018 | 【歳出】護衛艦定期検査等 | 346 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2019 | コバルトリッチクラスト掘削性能効率化検討 | 314 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2020 | コバルトリッチクラスト掘削性能効率化検討 | 224 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2019 | コバルトリッチクラスト掘削性能効率化検討 | 175 |
| 経済産業省 | 福島沖での浮体式洋上風力発電システムの実証研究事業委託費 | 2018 | 7MW風車（浮体）保守・管理 | 136 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2018 | 海底熱水鉱床開発計画の総合評価支援（採鉱・揚鉱） | 79 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2020 | 遠隔監視採証装置1式ほか4点買入 | 64 |
| 経済産業省 | 国内石油天然ガスに係る地質調査・メタンハイドレートの研究開発等委託費
国内石油天然ガスに係る地質調査事業費補助金 | 2020 | 採掘機と分離装置を用いた回収システムの検討 | 59 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2018 | 海底熱水鉱床採鉱・揚鉱システム最適化検討① | 49 |
| 国土交通省 | 海洋産業の戦略的育成のための総合対策（海洋資源開発関連技術研究開発費補助金関係経費） | 2017 | FLNG用舶用天然ガス液化設備の開発 | 41 |
| 国土交通省 | 海洋開発市場の獲得に向けた海事生産性革命の前進に必要な経費 | 2020 | 洋上におけるCO2回収装置検証のための小型デモプラント試験搭載と装置コンパクト化の研究開発 | 36 |
| 経済産業省 | 福島沖での浮体式洋上風力発電システムの実証研究事業委託費 | 2017 | 7MW風車（浮体）保守・管理 | 30 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2020 | 海洋資源調査船「白嶺」に係る大型調査機器保管業務 | 28 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2019 | 海洋資源調査船「白嶺」に係る大型調査機器保管業務 | 26 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2018 | 海洋資源調査船「白嶺」に係る大型調査機器保管業務 | 26 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2017 | 海洋資源調査船「白嶺」に係る大型調査機器保管業務 | 23 |
| 国土交通省 | 海洋開発市場の獲得に向けた海事生産性革命の前進に必要な経費 | 2020 | FSRU等のガスハンドリング設備の高度モジュール化と関連技術の研究開発 | 17 |
| 国土交通省 | 海上輸送の安全性向上のための総合対策 | 2020 | アクティブソナーによる衝突回避の検証のための調査 | 13 |
| 国土交通省 | 船舶の建造・運航における生産性向上（情報技術等の活用によるコスト競争力・品質・サービスの革新） | 2019 | 水中障害物探知センサシステムの研究開発 | 11 |
| 防衛省 | 製造中止部品対策（水中武器の部） | 2018 | 機器の改修 | 11 |
| 国土交通省 | 海洋開発市場の獲得に向けた海事生産性革命の前進に必要な経費 | 2019 | FSRU等のガスハンドリング設備の高度モジュール化と関連技術の研究開発 | 10 |
| 国土交通省 | 船舶の建造・運航における生産性向上（情報技術等の活用によるコスト競争力・品質・サービスの革新） | 2017 | アルミ高速船NC原図への３D-CAD適用に関する研究開発 | 10 |
| 防衛省 | 製造中止部品対策（水中武器の部） | 2018 | 代替品の製造 | 5 |
| 防衛省 | 製造中止部品対策（水中武器の部） | 2018 | 代替品の製造 | 5 |
| 経済産業省 | 質の高いインフラの海外展開に向けた事業実施可能性調査事業 | 2020 | コンテナターミナル及び物流に関する調査の一部 | 4 |
| 経済産業省 | 福島沖での浮体式洋上風力発電システムの実証研究事業委託費 | 2019 | 7MW風車（浮体）保守・管理 | 4 |
| 国土交通省 | 海上輸送の安全性向上のための総合対策 | 2019 | 高速船における水中物体との衝突回避策に関する基礎調査 | 3 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2020 | 艤装員待機施設提供等 | 2 |
| 国土交通省 | 船舶の安全確保、海洋汚染の防止等に必要な経費 | 2019 | 高速船における水中物体との衝突回避策に関する基礎調査 | 1 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2020 | 宿泊所借入れ | 1 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2020 | 宿泊所借入れ | 1 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2020 | 遠隔監視採証装置1式ほか9 点買入 | 1 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2020 | 遠隔監視採証装置1式ほか7点買入 | 1 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2020 | 遠隔監視採証装置1式ほか7点買入 | 1 |
| 国土交通省 | 海洋開発市場の獲得に向けた海事生産性革命の前進に必要な経費 | 2018 | 造船・海運の技術を活かしたマージナルガス田の開発 | 1 |
| 経済産業省 | 福島沖での浮体式洋上風力発電システムの実証研究事業委託費 | 2020 | 設計作業（委託先での選定による） | 1 |
