| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2018 | 広域海底地形調査 | 390 |
| 経済産業省 | 延伸大陸棚等資源開発促進事業費補助金 | 2015 | 広域海底地形調査 | 227 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費
（旧：深海底資源基礎調査委託費） | 2015 | コバルトリッチクラスト賦存状況調査 | 206 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2019 | 洋上調査他 | 153 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2016 | 海底熱水鉱床の賦存状況調査 | 144 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2019 | 試料採取作業（沖合海域） | 143 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2020 | 試料採取作業（沖合海域） | 130 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業委託費 | 2016 | 試料採取作業（沖合海域） | 129 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源研究調査事業 | 2015 | 広域海底地形調査 | 129 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2018 | 試料採取作業（沖合海域） | 124 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2017 | 試料採取作業（沖合海域） | 124 |
| 農林水産省 | 有明海のアサリ等の生産性向上実証事業 | 2019 | 有明海における漁場環境改善技術の開発 | 90 |
| 環境省 | 洋上風力発電実証事業 | 2015 | 実証機の海域における気象海象調査、環境影響評価等 | 84 |
| 農林水産省 | 有明海のアサリ等の生産性向上実証事業 | 2020 | 有明海における漁場環境改善技術の開発 | 80 |
| 農林水産省 | 有明海のアサリ等の生産性向上実証事業 | 2020 | 有明海における漁場環境改善技術の開発 | 80 |
| 農林水産省 | 有明海漁場環境改善技術開発事業 | 2015 | 有明海における漁場環境改善技術の開発 | 78 |
| 農林水産省 | 有明海のアサリ等の生産性向上実証事業 | 2018 | 有明海における漁場環境改善技術の開発 | 73 |
| 農林水産省 | 有明海のアサリ等の生産性向上実証事業 | 2017 | 有明海における漁場環境改善技術の開発 | 71 |
| 農林水産省 | 有明海漁場環境改善技術開発事業 | 2016 | 有明海における漁場環境改善技術の開発 | 71 |
| 農林水産省 | 有明海のアサリ等の生産性向上実証事業 | 2017 | 有明海における漁場環境改善技術の開発 | 69 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2019 | 試料採取作業（北日本海域） | 66 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2020 | 試料採取作業（北日本海域） | 60 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業委託費 | 2016 | 試料採取作業（北日本海域） | 59 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2018 | 試料採取作業（北日本海域） | 58 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2017 | 試料採取作業（北日本海域） | 58 |
| 国土交通省 | 海洋情報に関する経費 | 2020 | モニタリングポスト海上測定局復旧作業 | 44 |
| 経済産業省 | 国立研究開発法人産業技術総合研究所運営費交付金 | 2018 | 宮古島・石垣島周辺海洋地質調査傭船 | 41 |
| 経済産業省 | 国立研究開発法人産業技術総合研究所運営費交付金 | 2020 | 2020年度トカラ列島周辺海域の海洋地質構造研究に係わる運航及び調査支援等に関する業務 | 38 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2017 | 海底熱水鉱床の賦存量の調査 | 33 |
| 環境省 | 風力発電等に係る地域主導型の戦略的適地抽出手法の構築事業 | 2016 | 地域主導型の戦略的適地抽出の実践（モデル地域）（岩手県） | 33 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業委託費 | 2016 | 試料採取作業（外洋海域） | 31 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2017 | 試料採取作業（外洋海域） | 28 |
| 環境省 | 風力発電等に係る地域主導型の戦略的適地抽出手法の構築事業 | 2015 | 地域主導型の戦略的適地抽出の実践（モデル地域）（岩手県） | 28 |
| 経済産業省 | 福島沖での浮体式洋上風力発電システムの実証研究事業委託費 | 2020 | 漁業共存調査助勢（委託先での選定による） | 26 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2019 | 試料採取作業（日本海海域） | 24 |
| 農林水産省 | 有害生物漁業被害防止総合対策事業 | 2016 | 有害生物出現情報収集・解析及び情報提供（大型クラゲ） | 24 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2019 | 試料採取作業（東日本海域） | 23 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2017 | 試料採取作業（日本海海域） | 23 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業委託費 | 2016 | 試料採取作業（日本海海域） | 23 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2020 | 試料採取作業（日本海海域） | 22 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2020 | 環境調査、調査に係る資器材調達、遺伝子分析等 | 22 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2019 | 試料採取作業（西日本海域） | 22 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2018 | 試料採取作業（日本海海域） | 22 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2020 | 試料採取作業（東日本海域） | 21 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2018 | 試料採取作業（東日本海域） | 21 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2017 | 試料採取作業（西日本海域） | 21 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2017 | 試料採取作業（東日本海域） | 21 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2020 | 試料採取作業（西日本海域） | 20 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業 | 2018 | 試料採取作業（西日本海域） | 19 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業委託費 | 2016 | 試料採取作業（西日本海域） | 18 |
| 国土交通省 | 海洋調査に関する経費 | 2018 | 海洋調査資料整理作業 | 15 |
| 原子力規制委員会 | 海洋環境放射能総合評価事業委託費 | 2016 | 試料採取作業（東日本海域） | 15 |
| 国土交通省 | 海洋調査に関する経費 | 2015 | 調査データの解析 | 11 |
| 経済産業省 | 洋上風力発電等のコスト低減に向けた研究開発事業（旧：洋上風力発電等技術研究開発） | 2015 | 洋上風況観測システム実証研究（環境影響評価手法の確立等） | 10 |
| 経済産業省 | 洋上風力発電等のコスト低減に向けた研究開発事業 | 2016 | 洋上風況観測システム実証研究（環境影響評価手法の確立等） | 10 |
| 農林水産省 | 捕鯨対策 | 2019 | 乗船調査業務 | 7 |
| 文部科学省 | 海底地震・津波観測網の運用 | 2017 | 地動センサーパッケージの埋設作業 | 6 |
| 農林水産省 | 赤潮・貧酸素水塊対策事業 | 2015 | ⑤ | 5 |
| 農林水産省 | 赤潮・貧酸素水塊対策事業 | 2016 | ⑤ | 5 |
| 農林水産省 | 赤潮・貧酸素水塊対策事業 | 2017 | ⑤ | 5 |
| 農林水産省 | 漁場環境改善推進事業 | 2019 | -2 | 4 |
| 農林水産省 | 漁場環境改善推進事業 | 2020 | (2) | 4 |
| 環境省 | 総量削減及び閉鎖性海域管理推進費 | 2017 | 分析業務 | 3 |
| 環境省 | 総量削減及び閉鎖性海域管理推進費 | 2016 | 分析業務 | 2 |
| 環境省 | 総量削減及び閉鎖性海域管理推進費 | 2015 | 分析業務 | 2 |
| 国土交通省 | 海洋情報に関する経費 | 2018 | モニタリングポスト修理 | 2 |
| 国土交通省 | 海洋情報に関する経費 | 2016 | モニタリングポスト保守点検作業 | 2 |
| 農林水産省 | 漁場環境・生物多様性評価手法関連事業 | 2015 | 干潟マクロベントス分析業務 | 0 |
| 農林水産省 | 漁場環境・生物多様性評価手法関連事業 | 2016 | 干潟マクロベントス分析業務
底質微細藻類種分類業務 | 0 |
| 農林水産省 | 漁場環境・生物多様性評価手法関連事業 | 2017 | マクロベントス分析 | 0 |
