| 復興庁 | 道路整備事業 | 2020 | トンネル工事 | 7,640 |
| 防衛省 | 米軍再編関係経費 | 2019 | 埋立工事 | 5,824 |
| 国土交通省 | 道路事業（直轄・改築等） | 2015 | 道路改良工事 | 4,790 |
| 国土交通省 | 道路事業（直轄・改築等） | 2017 | トンネル工事 | 3,497 |
| 国土交通省 | 首都圏空港整備事業 | 2019 | 地盤改良工事 | 2,773 |
| 文部科学省 | 独立行政法人日本スポーツ振興センター運営費交付金に必要な経費 | 2020 | 国立代々木競技場耐震改修工事（第二体育館） | 2,343 |
| 防衛省 | 米軍再編関係経費 | 2017 | 埋立工事 | 2,000 |
| 国土交通省 | 道路事業（直轄・交通安全対策） | 2016 | 道路改良工事 | 1,850 |
| 国土交通省 | 河川・ダムの維持管理事業 | 2019 | ダム周辺部補強 | 1,332 |
| 国土交通省 | 河川改修事業 | 2020 | 築堤工事 | 1,298 |
| 法務省 | 官署施設の整備充実 | 2016 | 国際法務総合センター（仮称）A-3工区新営（建築）工事 | 1,291 |
| 財務省 | 特定国有財産の整備（財政投融資特別会計特定国有財産整備勘定） | 2016 | 国際法務総合センター（仮称）A-3工区新営（建築）工事 | 1,234 |
| 国土交通省 | 河川・ダムの維持管理事業 | 2020 | ダム周辺部補強 | 1,149 |
| 国土交通省 | 河川・ダムの維持管理事業 | 2020 | ダム周辺部補強 | 1,123 |
| 農林水産省 | 農業用用排水施設の整備・保全（直轄） | 2019 | 中央排水機場建設工事 | 1,034 |
| 国土交通省 | 官庁営繕費 | 2017 | 国立京都国際会館展示施設建築工事 | 898 |
| 文部科学省 | 独立行政法人日本スポーツ振興センター運営費交付金に必要な経費 | 2019 | 国立代々木競技場耐震改修工事（第二体育館） | 849 |
| 国土交通省 | 官庁営繕費 | 2018 | 国立京都国際会館展示施設建築工事 | 813 |
| 法務省 | 官署施設の整備充実 | 2015 | 国際法務総合センター(仮称)A-3工区新営（建築）工事 | 715 |
| 財務省 | 特定国有財産の整備（財政投融資特別会計特定国有財産整備勘定） | 2015 | 国際法務総合センター（仮称）A-3工区新営（建築）工事 | 709 |
| 農林水産省 | 農業用用排水施設の整備・保全（直轄） | 2018 | 鎧潟第４排水機場建設工事 | 646 |
| 法務省 | 官署施設の整備充実 | 2016 | 国際法務総合センター外構等新営工事 | 614 |
| 国土交通省 | ダム建設事業 | 2015 | ダム本体関連工事 | 504 |
| 経済産業省 | 未利用エネルギーを活用した水素サプライチェーン構築実証事業 | 2017 | 水素ＣＧＳ活用スマートコミュニティ技術開発事業 | 488 |
| 経済産業省 | 地熱発電の資源量調査・理解促進事業費補助金 | 2020 | 地熱発電の資源量調査事業（ルスツ地域） | 377 |
| 国土交通省 | 官庁営繕費 | 2015 | 国立京都国際会館展示施設建築工事 | 371 |
| 環境省 | エネルギー起源CO2排出削減技術評価・検証事業費 | 2015 | 施設・空調機間間熱カスケード融通と利用者参加型のコントロールによる地域グリーン化推進事業 | 345 |
| 経済産業省 | 地熱資源量の把握のための調査事業費補助金 | 2016 | 地熱資源量の調査事業 | 328 |
| 文部科学省 | 独立行政法人国立文化財機構施設整備に必要な経費 | 2019 | 東京国立博物館防水他改修工事 | 275 |
| 復興庁 | 中間貯蔵施設の整備等 | 2015 | 平成２７年度中間貯蔵に係る双葉町土壌等保管場設置等工事（その２） | 266 |
| 文部科学省 | 独立行政法人国立文化財機構運営費交付金に必要な経費 | 2019 | 東京国立博物館本館防水他改修工事 | 236 |
| 警察庁 | 都道府県警察施設災害復旧費補助金 | 2017 | 運転免許センター天井梁災害復旧工事 | 168 |
| 環境省 | 脱炭素社会構築に向けた再エネ等由来水素活用推進事業（一部経済産業省、国土交通省連携事業） | 2020 | 水素需給量・搬送状況を考慮した最適搬送管理システムを構築し、低コストな水素サプライチェーンの全体管理・最適化の実証試験を実施 | 168 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構施設整備に必要な経費 | 2020 | 令和２年度 高崎量子応用研究所コバルト６０照射棟ほか３棟耐震改修工事 | 145 |
| 国土交通省 | 集約促進景観・歴史的風致形成推進事業 | 2016 | 鎌倉歴史文化交流センター改修工事業務 | 125 |
| 環境省 | CO2排出削減対策強化誘導型技術開発・実証事業 | 2017 | 新たな地熱発電方式となる「熱水循環型発電」の実証 | 120 |
| 経済産業省 | 地熱資源量の把握のための調査事業費補助金（旧：地熱資源開発調査事業費補助金） | 2015 | 地熱資源開発に係る調査事業 | 115 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2019 | 深度500m研究アクセス北坑道におけるボーリング調査 | 102 |
| 環境省 | CO2排出削減対策強化誘導型技術開発・実証事業 | 2018 | 新たな地熱発電方式となる「熱水循環型発電」の実証 | 100 |
| 国土交通省 | 都市開発資金貸付事業 | 2017 | 【総合評価方式】
施設建築物建設費 | 100 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2018 | 深度500m研究アクセス北坑道におけるボーリング調査 | 98 |
| 文部科学省 | 独立行政法人国立文化財機構施設整備に必要な経費 | 2015 | 法隆寺宝物館展示ケース改修・修繕 | 97 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構施設整備に必要な経費 | 2020 | 令和2年度 那珂核融合研究所第1工学試験棟ほか1棟耐震改修工事 | 92 |
| 経済産業省 | インフラ維持管理・更新等の社会課題対応システム開発プロジェクト | 2015 | インフラ維持管理用ロボット技術・非破壊検査装置開発 | 77 |
| 原子力規制委員会 | 原子力の安全研究体制の充実・強化事業 | 2019 | 廃棄物埋設における坑道掘削に伴う掘削損傷領域等の水理特性調査 | 64 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2018 | 処分坑道のガス移行解析モデルの検討 | 61 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2019 | 処分坑道のガス移行解析モデルの検討 | 58 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2019 | 坑道シーリング技術の性能確認 緩衝材と埋め戻し材の力学的相互作用を考慮した緩衝材の膨出挙動の把握 | 58 |
| 経済産業省 | 未利用エネルギーを活用した水素サプライチェーン構築実証事業 | 2020 | ドライ低ＮＯｘ 水素専焼ガスタービン技術開発・実証事業 | 54 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2020 | 処分坑道のガス移行解析モデルの検討 | 52 |
| 国土交通省 | 科学技術イノベーション創造推進に必要な経費
（官民研究開発投資拡大プログラム） | 2019 | 「冠山峠道路第２号トンネル工事」施工現場における品質管理の高度化等を図る技術の試行業務 | 48 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2020 | 埋め戻し材との相互作用を考慮した緩衝材の膨潤挙動評価試験 | 45 |
| 経済産業省 | 未利用エネルギーを活用した水素サプライチェーン構築実証事業 | 2016 | 水素ＣＧＳ活用スマートコミュニティ技術開発事業 | 43 |
| 経済産業省 | 未利用エネルギーを活用した水素サプライチェーン構築実証事業 | 2018 | 水素ＣＧＳ活用スマートコミュニティ技術開発事業 | 42 |
| 経済産業省 | インフラ維持管理・更新等の社会課題対応システム開発プロジェクト | 2016 | インフラ維持管理用ロボット技術・非破壊検査装置開発 | 41 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2020 | 地質環境モデル構築の高度化に関わる情報整理 | 40 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2019 | 地質環境モデル構築の高度化に関わる情報整理 | 35 |
| 経済産業省 | 再生可能エネルギーの大量導入に向けた次世代型の電力制御技術開発事業（旧 次世代型の洋上直流送電システムの開発事業） | 2018 | 要素技術開発の洋上架台・基礎の開発【委託】 | 35 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2018 | 坑道シーリング技術の性能確認 膨潤挙動相互作用試験（室内試験） | 34 |
| 経済産業省 | 次世代型の洋上直流送電システムの開発事業 | 2016 | 要素技術開発の洋上架台・基礎の開発 | 33 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2020 | 隙間充填装置の整備 | 28 |
| 農林水産省 | 木材産業・木造建築活性化対策 | 2019 | CLTを使った建築実証の実施 | 27 |
| 環境省 | 土壌汚染対策費 | 2016 | 低コスト・低負荷型土壌汚染調査対策技術に関する実証事業 | 25 |
| 文部科学省 | 独立行政法人日本スポーツ振興センター運営費交付金に必要な経費 | 2018 | 国立代々木競技場耐震改修工事（第二体育館） | 24 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2017 | パラワン島調査（ナチュラルアナログ調査） | 23 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2016 | ナチュラルアナログ調査（パラワン島調査） | 23 |
| 復興庁 | 除去土壌等の適正管理・搬出等の実施 | 2015 | 除染・減容等技術実証事業 | 22 |
| 経済産業省 | 未利用エネルギーを活用した水素サプライチェーン構築実証事業 | 2019 | 水素ＣＧＳ活用スマートコミュニティ技術開発事業 | 21 |
| 経済産業省 | 洋上風力発電等のコスト低減に向けた研究開発事業（旧：洋上風力発電等技術研究開発） | 2015 | 洋上風況観測技術開発 | 20 |
| 経済産業省 | 洋上風力発電等のコスト低減に向けた研究開発事業 | 2017 | 洋上風力発電システム実証研究（ガンパイル工法に係わる低コスト施工技術調査研究） | 20 |
| 原子力規制委員会 | バックエンド分野の規制高度化研究事業 | 2020 | 廃棄物埋設における坑道掘削に伴う掘削影響領域の試験計画の検討 | 17 |
| 経済産業省 | 地域共生型再生可能エネルギー等普及促進事業費補助金 | 2020 | マスタープラン作成事業の実施 | 17 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2020 | スクリュー工法による埋め戻し材の要素試験 | 17 |
| 文部科学省 | 独立行政法人国立文化財機構運営費交付金に必要な経費 | 2019 | 東京国立博物館本館防水他改修工事 | 16 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2017 | 人工バリアシステムのガス移行連成挙動評価に関する検討 | 16 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2019 | 亀裂性岩盤の透水不均質性のモデル化に係わる検討 | 15 |
| 経済産業省 | 次世代型の洋上直流送電システムの開発事業 | 2017 | 要素技術開発の洋上架台・基礎の開発 | 15 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2018 | 都市部の施設に対する降灰影響評価試験 | 14 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2017 | 都市部の施設に対する降灰影響評価試験 | 13 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2020 | 埋め戻し材の施工品質確認のための計測技術の高度化 | 13 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2016 | ガス移行連成挙動評価手法の開発（人工バリアシステムのガス移行連成挙動評価に関する検討） | 13 |
| 環境省 | CO2排出削減対策強化誘導型技術開発・実証事業 | 2016 | 新たな地熱発電方式となる「熱水循環型発電」の実証研究 | 13 |
| 原子力規制委員会 | 原子力施設における外部事象等に係る安全規制研究事業 | 2019 | 砂礫土の遠心力模型実験 | 12 |
| 経済産業省 | 原子力の安全性向上に資する技術開発事業 | 2020 | 先進工法検討、構造安全性評価（１） | 11 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2019 | プラグの設計に関する解析的検討 | 11 |
| 国土交通省 | 巨大地震に対する中低層建築物の地震被害軽減技術に関する研究 | 2015 | 上部構造－基礎－地盤連成系の縮小模型の作成及び遠心振動実験業務 | 10 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2020 | 都市部の施設に対する降灰影響評価試験 | 10 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2020 | 緩衝材の塩水による化学影響に関するデータの取得 | 9 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2019 | 施工装置の概念設計の検討 | 9 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2018 | 沿岸部における亀裂性媒体の特徴を考慮した地下水環境変化の解析評価および核種移行解析 | 9 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2017 | 電磁波による給電技術の検討 | 9 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2017 | 核種移行評価に必要な地下水環境変化の評価に向けた沿岸部における亀裂性媒体の特徴を考慮した解析評価 | 9 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2017 | 沿岸部における亀裂性媒体の特徴を考慮した地下水環境変化の解析および物質移動解析 | 9 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2016 | 電磁波による給電技術の検討 | 9 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2016 | 検討会の運営 | 9 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2019 | 都市部の施設に対する降灰影響評価試験 | 9 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2019 | 地下環境における無線給電技術の高度化 | 8 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2018 | 地下環境における無線給電技術の高度化 | 8 |
| 農林水産省 | 海外農業・貿易投資環境調査分析事業 | 2019 | インドネシアの植物工場におけるトマトなどの高品質農産物生産及び販売の事業化のための調査 | 8 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2017 | 瑞浪超深地層研究所でのプレグラウト領域の岩石を対象とした室内分析 | 7 |
| 文部科学省 | 独立行政法人国立文化財機構運営費交付金に必要な経費 | 2020 | 本館特別3室模様替え工事（壁面塗装塗直し） | 6 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2020 | 地下環境における無線給電技術の高度化 | 6 |
| 文部科学省 | 地震防災研究戦略プロジェクト | 2016 | RC造建物の崩壊余裕度定量化 | 6 |
| 文部科学省 | 地震防災研究戦略プロジェクト | 2015 | RC造建物の崩壊余裕度定量化 | 5 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2019 | ナチュラルアナログ試料の鉱物・化学特性評価 | 5 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2018 | ナチュラルアナログ試料の鉱物・化学特性評価 | 5 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2018 | 使用済燃料直接処分システムの成立性の多角的検討のための調査 | 5 |
| 経済産業省 | 次世代型の洋上直流送電システムの開発事業（旧：次世代洋上直流送電システム開発事業） | 2015 | 要素技術開発の洋上架台・基礎の開発 | 5 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2016 | ガス移行連成挙動評価手法の開発（ガス移行評価シナリオの拡張に関する検討） | 5 |
| 国土交通省 | 地理地殻活動の研究に必要な経費 | 2018 | 東京スカイツリーにおけるGNSS観測及び水準測量作業の安全管理業務 | 5 |
| 厚生労働省 | 原爆死没者追悼平和祈念館運営委託費 | 2015 | 外壁修繕業務委託他 | 5 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2016 | 降下火山灰に関する文献調査、情報収集 | 4 |
| 原子力規制委員会 | 原子力施設における外部事象等に係る安全規制研究事業 | 2020 | 砂質土の遠心力模型実験 | 4 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2020 | ナチュラルアナログ試料の鉱物・化学特性評価 | 4 |
| 文部科学省 | 独立行政法人国立文化財機構運営費交付金に必要な経費 | 2019 | 表慶館屋根ガラリ修繕他7件 | 4 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2019 | 瑞浪超深地層研究所におけるプレグラウチング領域の岩石試料採取 | 4 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2018 | 瑞浪超深地層研究所でのプレグラウチング領域を対象としたグラウト材と岩盤の相互作用に関する室内試験 | 4 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2017 | 海陸境界付近の断層調査評価技術に関する知見の整理 | 4 |
| 経済産業省 | 新エネルギー等の保安規制高度化事業 | 2017 | 発電用風力設備の風車に係る審査マニュアルの改訂に係る調査補助 | 4 |
| 厚生労働省 | 原爆死没者追悼平和祈念館運営委託費 | 2019 | ラウンジ電動ブラインド取替修理 | 3 |
| 原子力規制委員会 | 原子力施設における外部事象等に係る安全規制研究事業 | 2018 | 遠心力載荷模型型実験に係わる業務 | 3 |
| 文部科学省 | 独立行政法人国立文化財機構運営費交付金に必要な経費 | 2019 | 東京国立博物館表慶館1階ガラス扉修繕他 | 2 |
| 文部科学省 | 独立行政法人国立文化財機構施設整備に必要な経費 | 2015 | 法隆寺宝物館内装修繕工事 | 2 |
| 文部科学省 | 独立行政法人国立文化財機構施設整備に必要な経費 | 2015 | 法隆寺宝物館鍵交換工事 | 2 |
| 文部科学省 | 独立行政法人国立文化財機構施設整備に必要な経費 | 2015 | 法隆寺宝物館1階トイレ洗面台交換工事 | 2 |
| 経済産業省 | 未利用エネルギーを活用した水素サプライチェーン構築実証事業（旧：未利用エネルギー由来水素サプライチェーン構築実証事業） | 2015 | 電気・熱・水素の統合型エネルギー運用管理システムの開発 | 1 |
| 文部科学省 | 独立行政法人国立文化財機構施設整備に必要な経費 | 2016 | 法隆寺宝物館廊下壁塗装 | 1 |
| 経済産業省 | 高レベル放射性廃棄物等の地層処分に関する技術開発委託費 | 2019 | 瑞浪超深地層研究所でのプレグラウチング領域から採取した岩石試料分析 | 1 |
| 経済産業省 | 洋上風力発電等のコスト低減に向けた研究開発事業 | 2016 | 着床式洋上ウィンドファーム開発支援事業（秋田県秋田港・能代港） | 0 |
| 経済産業省 | 洋上風力発電等のコスト低減に向けた研究開発事業（旧：洋上風力発電等技術研究開発） | 2015 | 着床式洋上ウィンドファーム開発支援事業（秋田県秋田港・能代港） | 0 |
