| 文部科学省 | 私立大学等経常費補助 | 2016 | 当該大学の教育研究等の実施 | 9,071 |
| 文部科学省 | 私立大学等経常費補助 | 2015 | 当該大学の教育研究等の実施 | 6,675 |
| 文部科学省 | 私立大学等経常費補助 | 2018 | 当該大学の教育研究等の実施 | 6,514 |
| 文部科学省 | 私立大学等経常費補助 | 2017 | 当該大学の教育研究等の実施 | 6,284 |
| 文部科学省 | 私立大学等経常費補助 | 2019 | 当該大学の教育研究等の実施 | 6,278 |
| 文部科学省 | 私立大学等経常費補助 | 2020 | 当該大学の教育研究等の実施 | 5,920 |
| 文部科学省 | 私立大学等経常費補助 | 2019 | 当該大学の教育研究等の実施 | 5,719 |
| 文部科学省 | 私立学校施設災害復旧 | 2017 | 被災した学校の校舎等施設の復旧 | 412 |
| 文部科学省 | 私立学校教育研究装置等施設整備費補助 | 2016 | 教育基盤の強化や学校施設の防災安全機能強化のための装置及び施設の整備費 | 304 |
| 文部科学省 | 私立学校教育研究装置等施設整備費補助 | 2015 | 教育基盤の強化や学校施設の防災安全機能強化のための装置及び施設の整備費 | 224 |
| 文部科学省 | 私立学校教育研究装置等施設整備費補助 | 2019 | 教育基盤の強化や学校施設の防災安全機能強化のための施設及びこれに伴い必要となる装置の整備費 | 199 |
| 経済産業省 | ロボット・ドローンが活躍する省エネルギー社会の実現プロジェクト | 2018 | 無人航空機の運航管理システム及び衝突回避技術の開発 | 89 |
| 厚生労働省 | 臨床研修費 | 2015 | 医師臨床研修の実施 | 65 |
| 経済産業省 | 再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業 | 2019 | 創薬における高次in vitro評価系としてのKidney-on-a-chipの開発 | 63 |
| 厚生労働省 | 臨床研修費 | 2019 | 臨床研修費 | 58 |
| 文部科学省 | 私立大学等研究設備整備等 | 2015 | 教育基盤の強化のための研究設備整備費 | 55 |
| 厚生労働省 | 臨床研修費 | 2020 | 臨床研修費 | 54 |
| 厚生労働省 | 臨床研修費 | 2018 | 臨床研修費 | 51 |
| 文部科学省 | 私立大学等研究設備整備等 | 2017 | 教育基盤の強化のための研究設備整備費 | 46 |
| 経済産業省 | 天然ガスの環境調和等に資する利用促進事業費補助金 | 2018 | 災害時にも対応可能な天然ガス利用設備の導入 | 44 |
| 経済産業省 | ロボット・ドローンが活躍する省エネルギー社会の実現プロジェクト | 2019 | 無人航空機の運航管理システム及び衝突回避技術の開発 | 38 |
| 文部科学省 | 新型感染症対策高度先端医療人材養成事業 | 2020 | 新型感染症対策高度先端医療人材養成事業 | 33 |
| 文部科学省 | 私立大学等研究設備整備等 | 2018 | 教育基盤設備、研究設備の整備費 | 32 |
| 文部科学省 | 私立大学等研究設備整備等 | 2016 | 教育基盤設備、研究設備の整備費 | 31 |
| 経済産業省 | ロボット・ドローンが活躍する省エネルギー社会の実現プロジェクト | 2017 | 無人航空機の運航管理システム及び衝突回避技術の開発 | 30 |
| 厚生労働省 | 造血幹細胞移植医療体制整備事業 | 2019 | 積極的な骨髄採取や地域の医療機関への研修等を実施 | 28 |
| 厚生労働省 | 造血幹細胞移植医療体制整備事業 | 2018 | 積極的な骨髄採取や地域の医療機関への研修等を実施 | 28 |
| 厚生労働省 | 造血幹細胞移植医療体制整備事業 | 2016 | 積極的な骨髄採取や地域の医療機関への研修等を実施 | 28 |
| 文部科学省 | 大学の世界展開力強化事業 | 2018 | ライフケア分野における日露ブリッジ人材育成 | 27 |
| 厚生労働省 | 造血幹細胞移植医療体制整備事業 | 2017 | 積極的な骨髄採取や地域の医療機関への研修等を実施 | 27 |
| 復興庁 | 東北マリンサイエンス拠点の形成 | 2020 | 漁場における瓦礫マッピングと分布プロセスの解明 | 25 |
| 厚生労働省 | 造血幹細胞移植医療体制整備事業 | 2015 | 積極的な骨髄採取や地域の医療機関への研修等を実施 | 24 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2016 | ニューロリハビリシステム | 23 |
| 文部科学省 | 大学の世界展開力強化事業 | 2020 | ライフケア分野における日露ブリッジ人材育成－主に極東地域の経済発展を目的として－ | 22 |
| 復興庁 | 東北マリンサイエンス拠点の形成 | 2015 | 漁場におけるがれきマッピングと分解プロセスの解明 | 22 |
| 経済産業省 | 地中熱などの再生可能エネルギー熱利用のコスト低減に向けた技術開発事業 | 2017 | 太陽熱を利用した熱音響冷凍機による雪室冷却装置の開発 | 21 |
| 経済産業省 | 再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業 | 2017 | 同種軟骨細胞シートのための有効性品質評価手法の開発 | 20 |
| 復興庁 | 東北マリンサイエンス拠点の形成 | 2016 | 漁場における瓦礫マッピングと分布プロセスの解明 | 20 |
| 復興庁 | 東北マリンサイエンス拠点の形成 | 2017 | 漁場における瓦礫マッピングと分布プロセスの解明 | 20 |
| 経済産業省 | 再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業 | 2020 | 階層的共培養を基礎とするLiver/Gut on-a-chipの開発：インビトロ腸肝循環評価を目指した高度な代謝と極性輸送の再現 | 18 |
| 復興庁 | 東北マリンサイエンス拠点の形成 | 2019 | 漁場における瓦礫マッピングと分布プロセスの解明 | 18 |
| 復興庁 | 東北マリンサイエンス拠点の形成 | 2018 | 漁場における瓦礫マッピングと分布プロセスの解明 | 18 |
| 文部科学省 | 私立大学等研究設備整備等 | 2015 | 教育基盤の強化のための研究設備整備費 | 18 |
| 文部科学省 | 地震調査研究推進本部 | 2018 | 富士川河口断層帯における重点的な調査観測の共同研究 | 18 |
| 経済産業省 | 戦略的国際標準化加速事業 | 2020 | Ｓｍａｒｔ Ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ Ｉｎｆｒａｓｔｒｕｃｔｕｒｅ 活用した防災に関する国際標準化 | 17 |
| 経済産業省 | 再生医療の産業化に向けた評価基盤技術開発事業 | 2016 | 自己軟骨細胞シートのための統合的評価手法の開発 | 17 |
| 経済産業省 | 迅速ウイルス検出機器導入実証事業（先進的医療機器・システム等技術開発事業） | 2019 | 基盤技術開発プロジェクト | 16 |
| 文部科学省 | 成長分野を支える情報技術人材の育成拠点の形成（enPiT） | 2019 | 成長分野を支える情報技術人材の育成拠点の形成 | 15 |
| 文部科学省 | 成長分野を支える情報技術人材の育成拠点の形成（enPiT） | 2020 | 成長分野を支える情報技術人材の育成拠点の形成（分配金） | 14 |
| 経済産業省 | 原子力発電の制度整備のための国際協力事業費補助金（旧：原子力発電導入基盤整備事業補助金） | 2015 | ベトナム向け研修 | 14 |
| 文部科学省 | 成長分野を支える情報技術人材の育成拠点の形成（enPiT) | 2017 | 成長分野を支える情報技術人材の育成拠点の形成 | 14 |
| 文部科学省 | 成長分野を支える情報技術人材の育成拠点の形成（enPiT） | 2018 | 成長分野を支える情報技術人材の育成拠点の形成 | 13 |
| 経済産業省 | 再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業 | 2017 | 再生医療技術を応用した創薬支援基盤技術の開発 項目2-1、創薬における高次in vitro評価系としてのKidney-on-a-chipの開発 | 13 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2015 | ニューロリハビリシステム | 12 |
| 経済産業省 | 地中熱などの再生可能エネルギー熱利用のコスト低減に向けた技術開発事業 | 2018 | 太陽熱を利用した熱音響冷凍機による雪室冷却装置の開発 | 12 |
| 経済産業省 | 原子力発電の制度整備のための国際協力事業費補助金 | 2016 | ベトナム向け研修 | 12 |
| 文部科学省 | 私立学校施設災害復旧 | 2016 | 被災学校等の校舎等施設の復旧 | 12 |
| 国土交通省 | 災害時拠点強靱化緊急促進事業 | 2016 | 災害時拠点強靱化緊急促進事業（災害時拠点病院整備事業） | 12 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2019 | 活火山の地球化学的モニタリング | 12 |
| 経済産業省 | 再生医療の産業化に向けた評価基盤技術開発事業 | 2015 | 再生医療等の産業化に向けた評価手法等の開発／自己軟骨細胞シートのための統合的評価手法の開発 | 11 |
| 文部科学省 | 国際文化交流・協力推進事業 | 2018 | エクアドルの博物館復興支援に係るシンポジウム等実施業務 | 11 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2017 | ニューロリハビリシステム | 10 |
| 経済産業省 | 原子力発電の制度整備のための国際協力事業費補助金（旧：原子力発電導入基盤整備事業補助金） | 2015 | ベトナム向け研修 | 10 |
| 経済産業省 | 原子力発電の制度整備のための国際協力事業費補助金 | 2017 | ﾍﾞﾄﾅﾑ向け研修事業 | 10 |
| 文部科学省 | 私立大学等研究設備整備等 | 2018 | 教育基盤設備、研究設備の整備費 | 10 |
| 総務省 | 戦略的情報通信研究開発推進事業 | 2017 | 総務省との委託契約に基づく研究の実施（「アクティブ骨導音センシングを用いた次世代インタフェース技術の研究開発」） | 9 |
| 厚生労働省 | ＮＩＣＵ等からの退院の促進 | 2020 | NICU等に長期入院している小児を在宅へ移行するための補助 | 8 |
| 総務省 | 戦略的情報通信研究開発推進事業 | 2018 | アクティブ骨導音センシングを用いた次世代インタフェース技術の研究開発 | 8 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2018 | ニューロリハビリシステム | 8 |
| 国土交通省 | 治安及び救難体制の整備に関する経費 | 2019 | 委託料 | 7 |
| 環境省 | 化学物質複合影響評価等調査費 | 2015 | 環境中の微量な化学物質による健康影響に関する調査研究 | 7 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2020 | 活火山の地球化学的モニタリング | 6 |
| 農林水産省 | 漁業資源調査に要する経費 | 2019 | クロマグロ卵仔稚魚サンプルのDNA同定と効率的分析技術の検討 | 6 |
| 経済産業省 | 再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業 | 2019 | 階層的共培養を基礎とするLiver/Gut on-a-chipの開発：インビトロ腸肝循環評価を目指した高度な代謝と極性輸送の再現 | 6 |
| 経済産業省 | 再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業 | 2017 | 再生医療技術を応用した創薬支援基盤技術の開発 項目2-1、階層的共培養を基礎とするLiver/Gut on-a-chipの開発 | 6 |
| 農林水産省 | 漁業資源調査に要する経費 | 2017 | マグロ類卵・仔魚種査定等 | 6 |
| 経済産業省 | 地中熱などの再生可能エネルギー熱利用のコスト低減に向けた技術開発事業 | 2016 | 太陽熱を利用した熱音響冷凍機による雪室冷却装置の開発 | 5 |
| 総務省 | 戦略的情報通信研究開発推進事業 | 2017 | 総務省との委託契約に基づく研究の実施（「データ特性に応じて組み替え可能なモジュラー型エッジコンピューティング基盤に関する研究開発」） | 5 |
| 経済産業省 | 原子力発電の制度整備のための国際協力事業費補助金 | 2016 | ベトナム向け研修 | 5 |
| 文部科学省 | HPCI戦略プログラム | 2015 | 抗血小板薬薬効予測を可能とする階層統合シミュレータの開発に向けたモデリング | 5 |
| 農林水産省 | 包括的な国際資源管理体制構築事業 | 2015 | DNA抽出作業 | 4 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2019 | 流体特性調査 | 4 |
| 農林水産省 | 包括的な国際資源管理体制構築事業 | 2017 | DNA分析高度化 | 4 |
| 文部科学省 | 私立学校施設災害復旧 | 2018 | 被災した学校の校舎等施設の復旧 | 4 |
| 農林水産省 | 包括的な国際資源管理体制構築事業 | 2016 | ＤＮＡ抽出作業 | 4 |
| 農林水産省 | 包括的な国際資源管理体制構築事業 | 2019 | DNA分析の技術開発 | 3 |
| 農林水産省 | 包括的な国際資源管理体制構築事業 | 2018 | DNA分析高度化 | 3 |
| 文部科学省 | 地震調査研究推進本部 | 2017 | 富士川河口断層帯における重点的な調査観測の共同研究 | 3 |
| 文部科学省 | 地震調査研究推進本部 | 2017 | 富士川河口断層帯における重点的な調査観測の共同研究 | 3 |
| 文部科学省 | 宇宙・航空科学技術推進の調整に必要な経費 | 2020 | PI機器の設計・製作を通した教育等を行う。 | 3 |
| 経済産業省 | 地域で自立したバイオマスエネルギーの活用モデルを確立するための実証事業 | 2016 | 地域自立システム化実証事業 里山エコリゾートのためのスローテクノロジー統合型の地域木質熱利用システムの事業性評価（ＦＳ） | 3 |
| 厚生労働省 | 遺骨伝達等事業 | 2018 | 戦没者遺骨のDNA鑑定等 | 3 |
| 厚生労働省 | 保健衛生施設等施設・設備整備費補助金 （保健衛生施設等災害復旧費補助金含む） | 2018 | 施設・整備費の支出 | 3 |
| 農林水産省 | 漁業資源調査に要する経費 | 2020 | 小型鯨類の詳細な食性分析 | 2 |
| 農林水産省 | 漁業資源調査に要する経費 | 2019 | 小型鯨類の詳細な食性分析 | 2 |
| 文部科学省 | 科学技術に関する人材の養成・活躍促進 | 2018 | テニュアトラック制を導入・活用し、若手研究者が自立して研究に専念できる環境を整備する等制度の定着を図る。 | 2 |
| 厚生労働省 | 遺骨伝達等事業 | 2016 | 戦没者遺骨のDNA鑑定等 | 2 |
| 文部科学省 | 宇宙・航空科学技術推進の調整に必要な経費 | 2019 | PI機器の設計・製作を通した教育等を行う。 | 2 |
| 農林水産省 | 国際的水産資源管理等促進事業 | 2020 | ＤＮＡ検査の効率化と精度向上に係る技術開発 | 1 |
| 文部科学省 | 地震調査研究推進本部 | 2019 | 富士川河口断層帯における重点的な調査観測の共同研究 | 1 |
| 環境省 | 日本の国立公園と世界遺産を活かした地域活性化推進費 | 2020 | 痔西表石垣国立公園（西表地区）アオウミガメ生息状況等調査業務 | 1 |
| 総務省 | 戦略的情報通信研究開発推進事業 | 2018 | データ特性に応じて組み替え可能なモジュラー型エッジコンピューティング基盤に関する研究開発 | 1 |
| 経済産業省 | 太陽光発電システム維持管理及びリサイクル技術開発 | 2015 | 太陽電池屋根設置型ビニールハウス植物工場化プロジェクト | 1 |
| 文部科学省 | 英知を結集した原子力科学技術・人材育成推進事業 | 2018 | 廃止措置工学高度人材育成と基盤研究の深化 | 1 |
| 文部科学省 | 英知を結集した原子力科学技術・人材育成推進事業 | 2018 | 廃止措置工学高度人材育成と基盤研究の深化 | 1 |
| 文部科学省 | 気候変動適応戦略イニシアチブ | 2016 | 要素技術（CAPCOM）の技術的先進性検証 | 1 |
| 環境省 | 日本の国立公園と世界遺産を活かした地域活性化推進費 | 2020 | 石垣島におけるカンムリワシ保全方針検討業務 | 1 |
| 環境省 | 日本の国立公園と世界遺産を活かした地域活性化推進費 | 2020 | 西表島におけるカンムリワシ生息状況等調査業務 | 1 |
| 環境省 | 原生的な自然環境の危機対策事業 | 2019 | 崎山湾・網取湾及びその周辺のウミショウブ等の海草群落の生育状況調査 | 1 |
| 環境省 | 日本の国立公園と世界遺産を活かした地域活性化推進費 | 2019 | 令和元年度西表島におけるカンムリワシ生息状況等調査業務 | 1 |
| 環境省 | 国指定鳥獣保護区対策費 | 2017 | 国指定仲の上島鳥獣保護区更新等に関する情報収集業務 | 1 |
| 環境省 | 原生的な自然環境の危機対策事業 | 2018 | ウミショウブ減少要因等対策検討に係る会議開催 | 1 |
| 環境省 | 原生的な自然環境の危機対策事業 | 2016 | 崎山湾・網取湾のウミショウブの減少要因等の調査 | 1 |
| 文部科学省 | 日本／ユネスコパートナーシップ事業 | 2016 | ユネスコスクール加盟申請支援、活動支援 | 1 |
| 文部科学省 | 日本／ユネスコパートナーシップ事業 | 2017 | ユネスコスクール加盟申請支援、活動支援 | 1 |
| 文部科学省 | 地（知）の拠点大学による地方創生推進事業 | 2018 | “オール熊本”で取り組む熊本産業創生と雇用創出のための教育プログラム（分担金） | 1 |
| 文部科学省 | 宇宙・航空科学技術推進の調整に必要な経費 | 2016 | フライト関連教育・ミニ実験の推進等を実施する。 | 1 |
| 環境省 | 原生的な自然環境の危機対策事業 | 2020 | 令和2年度西表島﨑山湾・網取湾自然環境保全地域におけるウミショウブに減少要因等対策検討業務 | 1 |
| 環境省 | 原生的な自然環境の危機対策事業 | 2015 | 崎山湾・網取湾自然環境保全地域ウミショウブ減少要因等調査 | 1 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2018 | 活火山の地球化学的モニタリング | 1 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2017 | 活火山の地球化学的モニタリング | 1 |
| 文部科学省 | 日本／ユネスコパートナーシップ事業 | 2015 | ユネスコスクール加盟申請支援、活動支援 | 1 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2016 | 活火山の地球化学的モニタリング | 0 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2016 | 活火山の地球化学的モニタリング | 0 |
| 文部科学省 | 日本／ユネスコパートナーシップ事業 | 2018 | ユネスコスクール加盟申請支援、活動支援 | 0 |
| 環境省 | 国指定鳥獣保護区対策費 | 2016 | 国指定仲の神島鳥獣保護区更新にかかる調査検討業務 | 0 |
| 環境省 | 地域循環共生圏構築事業 | 2018 | 阿蘇地域の創造的復興に向けた地域循環共生圏構築方針検討業務 | 0 |
