| 内閣府 | 原子力災害対策事業 | 2019 | 放射線防護対策の実施 | 475 |
| 内閣府 | 大学等における修学支援に必要な経費 | 2020 | 大学等における修学支援 | 384 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（難病克服プロジェクト） | 2016 | - | 259 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（難病克服プロジェクト） | 2017 | - | 249 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（疾病克服に向けたゲノム医療実現プロジェクト） | 2018 | 認知症臨床ゲノム情報データベース構築に関する開発研究 | 221 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（難病克服プロジェクト） | 2016 | 自己免疫性肺胞蛋白症に対する酵母由来組換えGM-CSF吸入の多施設共同医師主導治験 | 203 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（難病克服プロジェクト） | 2017 | 自己免疫性肺胞蛋白症に対する酵母由来組換えGM-CSF吸入の多施設共同医師主導治験 | 175 |
| 文部科学省 | 国立大学法人における設備等の整備 | 2016 | 脳病理標本バーチャルシステム | 121 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（脳とこころの健康大国実現プロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金等を含む） | 2019 | | 105 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（脳とこころの健康大国実現プロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金等を含む） | 2019 | 網羅的ゲノム解析とインフォマティクス統合解析による認知症の新規病態解析 | 96 |
| 内閣府 | 原子力発電施設等緊急時安全対策交付金 | 2020 | 原子力災害拠点病院等の整備 | 93 |
| 文部科学省 | スーパーグローバル大学等事業 | 2015 | 経済社会の発展をけん引するグローバル人材育成支援 | 72 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（疾病克服に向けたゲノム医療実現プロジェクト） | 2017 | 認知症臨床ゲノム情報データベース構築に関する開発研究 | 58 |
| 文部科学省 | 先端研究基盤共用促進事業 | 2020 | 新たな共用システムの導入 | 52 |
| 文部科学省 | 先端研究基盤共用促進事業 | 2019 | 新たな共用システムの導入 | 52 |
| 文部科学省 | 先端研究基盤共用促進事業 | 2018 | 新たな共用システムの導入 | 52 |
| 農林水産省 | 「知」の集積と活用の場によるイノベーション創出推進事業 | 2019 | 成長に優れた無花粉スギ苗を短期間で作出・普及する技術の開発 | 50 |
| 文部科学省 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 2018 | 実践的災害医療ロジスティクス専門家の養成 | 50 |
| 文部科学省 | 知識集約型社会を支える人材育成事業 | 2020 | メニューⅠ：文理横断・学修の幅を広げる教育プログラム | 49 |
| 経済産業省 | 環境アセスメント手続きの迅速化に向けた環境影響調査の前倒し方法の実証事業（旧：環境アセスメント調査早期実施実証事業） | 2015 | 順応的管理手法の開発 | 44 |
| 文部科学省 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 2019 | 実践的災害医療ロジスティクス専門家の養成 | 41 |
| 農林水産省 | 「知」の集積と活用の場によるイノベーション創出推進事業 | 2018 | 無花粉スギの普及拡大に向けたDNAマーカー育種技術と効率的な苗木生産技術の開発 | 41 |
| 文部科学省 | 科学技術に関する人材の養成・活躍促進 | 2017 | 研究と出産・育児・介護等との両立や女性研究者の研究力の向上を一体的に推進するなど、研究環境のダイバーシティ実現を図る取組を行う。 | 41 |
| 経済産業省 | 健康・医療情報を活用したヘルスケア・イノベーション基盤整備事業 | 2018 | “噛む”を測ることによるヘルスプロモーションの開発に関する研究 | 38 |
| 文部科学省 | 科学技術に関する人材の養成・活躍促進 | 2016 | 研究と出産・育児・介護等との両立や女性研究者の研究力の向上を一体的に推進するなど、研究環境のダイバーシティ実現を図る取組を行う | 36 |
| 文部科学省 | 首都圏を中心としたレジリエンス総合力向上プロジェクト | 2018 | 関連機関に共通する行動、役割の分析、フィールド実験において対応課題を解消できるかの検証業務。 | 32 |
| 文部科学省 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 2017 | 発災～復興まで支援する災害医療人材育成 | 32 |
| 文部科学省 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 2020 | 実践的災害医療ロジスティクス専門家の養成 | 31 |
| 文部科学省 | 多様な新ニーズに対応する「がん専門医療人材（がんプロフェッショナル）」養成プラン | 2017 | 東北次世代がんプロ養成プラン（分担金） | 29 |
| 文部科学省 | 首都圏を中心としたレジリエンス総合力向上プロジェクト | 2019 | 首都圏を中心としたレジリエンス総合力向上プロジェクト①プロジェクト総括とデータ利活用協議会の設置・運営 | 27 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（難病克服プロジェクト） | 2016 | 重症薬疹における特異的細胞死誘導受容体をターゲットにした新規治療薬開発 | 27 |
| 文部科学省 | 首都圏を中心としたレジリエンス総合力向上プロジェクト | 2020 | 首都圏を中心としたレジリエンス総合力向上プロジェクト（プロジェクト総括とデータ利活用協議会の設置・運営） | 26 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（難病克服プロジェクト） | 2017 | ゲノム編集を用いた優性遺伝性中枢神経疾患の治療方法の開発 | 26 |
| 国土交通省 | Living History（生きた歴史体感プログラム）事業（国際観光旅客税財源） | 2020 | 新潟大学旭町学術資料展示館 | 25 |
| 文部科学省 | イノベーションシステム整備事業 | 2020 | 「生物多様性と農業技術革新が共存するエコロジカル・コミュニティの実装に向けて：里山創生「佐渡モデル」の構築」 | 25 |
| 文部科学省 | がんプロフェッショナル養成基盤推進プラン | 2015 | 東北がんプロフェッショナル養成推進プラン | 25 |
| 経済産業省 | 環境アセスメント手続の迅速化に向けた環境影響調査の前倒し方法の実証事業 | 2016 | 順応的管理手法の開発 | 24 |
| 文部科学省 | 首都圏を中心としたレジリエンス総合力向上プロジェクト | 2018 | プロジェクト総括とデータ利活用協議会の設置・運営の研究開発業務 | 23 |
| 文部科学省 | 大学教育再生加速プログラム「高大接続改革推進事業」 | 2016 | Ⅳ長期学外学修プログラム（ギャップイヤー） | 23 |
| 文部科学省 | 多様な新ニーズに対応する「がん専門医療人材（がんプロフェッショナル）」養成プラン | 2018 | 東北次世代がんプロ養成プラン（分担金） | 22 |
| 文部科学省 | がんプロフェッショナル養成基盤推進プラン | 2016 | 東北がんプロフェッショナル養成推進プラン(分担金) | 22 |
| 文部科学省 | 首都圏を中心としたレジリエンス総合力向上プロジェクト | 2017 | 参加者の最適な研究活動を推進するためのプロジェクト・協議会のマネジメント業務 | 20 |
| 文部科学省 | 首都圏を中心としたレジリエンス総合力向上プロジェクト | 2017 | 参加者の最適な研究活動を推進するためのプロジェクト・協議会のマネジメント業務 | 20 |
| 文部科学省 | 大学教育再生加速プログラム「高大接続改革推進事業」 | 2018 | Ⅳ 長期学外学修プログラム（ギャップイヤー） | 20 |
| 文部科学省 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 2018 | 発災～復興まで支援する災害医療人材の養成 | 19 |
| 文部科学省 | 多様な新ニーズに対応する「がん専門医療人材（がんプロフェッショナル）」養成プラン | 2019 | 東北次世代がんプロ養成プラン | 19 |
| 厚生労働省 | 総合的な診療能力を持つ医師養成の推進事業 | 2020 | 総合的な診療能力を持つ医師養成の推進事業に対する補助 | 19 |
| 文部科学省 | 地震防災研究戦略プロジェクト | 2015 | 津波堆積物の調査 | 17 |
| 文部科学省 | 地震防災研究戦略プロジェクト | 2016 | 津波堆積物の調査 | 16 |
| 文部科学省 | 地震防災研究戦略プロジェクト | 2016 | 津波堆積物の調査 | 16 |
| 文部科学省 | 大学教育再生加速プログラム「高大接続改革推進事業」 | 2019 | Ⅳ 長期学外学修プログラム（ギャップイヤー） | 15 |
| 経済産業省 | 健康・医療情報を活用したヘルスケア・イノベーション基盤整備事業 | 2019 | ウェアラブルデバイスを用いて“噛む”を行動変容することによる食生活の適正化 | 15 |
| 文部科学省 | 地震防災研究戦略プロジェクト | 2017 | 津波堆積物の調査 | 15 |
| 文部科学省 | 地震防災研究戦略プロジェクト | 2018 | 津波堆積物の調査 | 15 |
| 文部科学省 | 多様な新ニーズに対応する「がん専門医療人材（がんプロフェッショナル）」養成プラン | 2020 | 東北次世代がんプロ養成プラン（分担金） | 14 |
| 文部科学省 | 地震防災研究戦略プロジェクト | 2019 | 津波堆積物の調査 | 12 |
| 文部科学省 | 北極域研究推進プロジェクト | 2020 | 国際共同研究の実施 | 12 |
| 文部科学省 | 首都圏を中心としたレジリエンス総合力向上プロジェクト | 2019 | 災害時における標準的な対応手順等の可視化のニーズに基づく研究開発 | 12 |
| 文部科学省 | 首都圏を中心としたレジリエンス総合力向上プロジェクト | 2020 | 災害時における標準的な対応手順等の可視化のニーズに基づく研究開発 | 11 |
| 文部科学省 | 科学技術に関する人材の養成・活躍促進及び理解増進 | 2015 | リサーチ・アドミニストレータ人材の育成・確保や体制整備を支援する。 | 11 |
| 文部科学省 | 科学技術に関する人材の養成・活躍促進及び理解増進 | 2015 | リサーチ・アドミニストレータ人材の育成・確保や体制整備を支援する。 | 11 |
| 文部科学省 | 科学技術に関する人材の養成・活躍促進 | 2016 | リサーチ・アドミニストレータ人材の育成・確保や体制整備を支援する | 11 |
| 文部科学省 | 科学技術に関する人材の養成・活躍促進 | 2016 | リサーチ・アドミニストレータ人材の育成・確保や体制整備を支援する | 11 |
| 総務省 | 仮想空間における電波模擬システム技術の高度化 | 2020 | 仮想空間における電波模擬システム技術の高度化に向けた研究開発（課題ア） | 10 |
| 環境省 | 水俣病総合対策関係経費 | 2020 | 公害医療事業 | 10 |
| 文部科学省 | イノベーションシステム整備事業 | 2019 | 生物多様性と農業技術革新が共存するエコロジカル・コミュニティの実装に向けて：里山創生
「佐渡モデル」の構築 | 10 |
| 環境省 | 水俣病総合対策関係経費 | 2019 | 公害医療事業 | 10 |
| 経済産業省 | 健康・医療情報を活用した行動変容促進事業 | 2017 | “噛む”を測ることによるヘルスプロモーションの開発に関する研究 | 10 |
| 文部科学省 | 特別支援教育就学奨励費負担等 | 2015 | 特別支援学校及び小・中学校の特別支援学級等の児童生徒等の保護者等の経済的負担を軽減するために必要な援助を行う。 | 10 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（脳とこころの健康大国実現プロジェクト）（保健衛生医療調査等推進事業費補助金等を含む） | 2019 | 血液バイオマーカーを用いた認知症と精神・神経疾患の簡易鑑別診断システムの構築 | 9 |
| 文部科学省 | 特別支援教育就学奨励費負担等 | 2017 | 特別支援学校及び小・中学校の特別支援学級等の児童生徒等の保護者等の経済的負担を軽減するために必要な援助を行う。 | 9 |
| 文部科学省 | 独立行政法人日本学術振興会運営費交付金に必要な経費 | 2017 | 日中韓フォーサイト事業（オートファジー、代謝と神経変性疾患） | 9 |
| 文部科学省 | 特別支援教育就学奨励費負担等 | 2018 | 特別支援学校及び小・中学校の特別支援学級等の児童生徒等の保護者等の経済的負担を軽減するために必要な援助を行う。 | 9 |
| 文部科学省 | 特別支援教育就学奨励費負担等 | 2019 | 特別支援学校及び小・中学校の特別支援学級等の児童生徒等の保護者等の経済的負担を軽減するために必要な援助を行う。 | 9 |
| 環境省 | 水俣病総合対策関係経費 | 2018 | 公害医療事業 | 9 |
| 環境省 | 水俣病総合対策関係経費 | 2017 | 公害医療事業（水俣病研究委託事業） | 9 |
| 文部科学省 | 独立行政法人日本学術振興会運営費交付金に必要な経費 | 2016 | 日中韓フォーサイト事業（オートファジー、代謝と神経変性疾患） | 9 |
| 文部科学省 | 特別支援教育就学奨励費負担等 | 2016 | 特別支援学校及び小・中学校の特別支援学級等の児童生徒等の保護者等の経済的負担を軽減するために必要な援助を行う。 | 9 |
| 経済産業省 | カーボンリサイクル・次世代火力発電の技術開発事業 | 2020 | ＣＯ２分離・回収型ポリジェネレーションシステム技術開発(ケミカルルーピング燃焼ポリジェネレーション技術開発) | 8 |
| 復興庁 | 国立大学法人運営費交付金に必要な経費 | 2015 | 東日本大震災により被災した学生に対する授業料減免を実施するための経費 | 8 |
| 文部科学省 | 地震防災研究戦略プロジェクト | 2015 | マイクロメディアサービス開発のためのアプリケーション環境の提案・整備等 | 8 |
| 文部科学省 | 地震防災研究戦略プロジェクト | 2016 | マイクロメディアサービス開発のためのアプリケーション環境の提案・整備等 | 8 |
| 環境省 | 水俣病総合対策関係経費 | 2016 | 公害医療事業 | 7 |
| 経済産業省 | 国内石油天然ガスに係る地質調査・メタンハイドレートの研究開発等委託費
国内石油天然ガスに係る地質調査事業費補助金 | 2020 | 膜構造物の利活用に関する技術開発 | 7 |
| 農林水産省 | 農林水産政策研究調査委託費 | 2017 | 農村活性化事業が農村高齢者の健康維持と地域の健康と豊かなソーシャルキャピタルの醸成につながることを実証する研究を実施。 | 7 |
| 農林水産省 | 農林水産政策研究調査委託費 | 2016 | 農村活性化事業が農村高齢者の健康維持と地域の健康と豊かなソーシャルキャピタルの醸成につながることを実証する研究を実施。 | 7 |
| 農林水産省 | 国際農業協力等委託・補助事業 | 2015 | 我が国の民間企業が有する農業インフラの技術・ノウハウのODAを活用した海外展開手法を検討するための調査を実施 | 7 |
| 文部科学省 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 2015 | 東京医科歯科大学と連携して、優れた医療人材を養成 | 7 |
| 文部科学省 | 大学間連携共同教育推進事業 | 2016 | 産学協働教育による主体的学修の確立と中核的・中堅職業人の育成(分担金) | 7 |
| 文部科学省 | 地震防災研究戦略プロジェクト | 2020 | 津波堆積物の調査 | 6 |
| 経済産業省 | 環境アセスメント手続の迅速化に向けた環境影響調査の前倒し方法の実証事業 | 2017 | 既設風力発電施設等における環境影響実態把握Ⅰ | 6 |
| 文部科学省 | 独立行政法人日本学術振興会運営費交付金に必要な経費 | 2015 | 日中韓フォーサイト事業（オートファジー、代謝と神経変性疾患） | 6 |
| 環境省 | 水俣病総合対策関係経費 | 2015 | 公害医療事業 | 5 |
| 農林水産省 | 農林水産政策研究調査委託費 | 2018 | 農村活性化事業が農村高齢者の健康維持と地域の健康と豊かなソーシャルキャピタルの醸成につながることを実証する研究を実施。 | 4 |
| 経済産業省 | エネルギー・環境分野の中長期的課題解決に資する新技術先導研究プログラム | 2018 | 天然ガス低温改質による低ＣＯ２排出水素・化学品革新製造 | 4 |
| 農林水産省 | 戦略的国際共同研究推進事業（国益に直結した国際連携の推進に要する経費） | 2017 | ロシア極東における高蛋白大豆の探索と大区画圃場に対応した高速深層施肥播種機の開発 | 4 |
| 農林水産省 | 戦略的国際共同研究推進事業（国益に直結した国際連携の推進に要する経費） | 2018 | ロシア極東における高蛋白大豆の探索と大区画圃場に対応した高速深層施肥播種機の開発 | 3 |
| 文部科学省 | 学校保健特別対策事業 | 2020 | 修学旅行のキャンセル料等の追加的費用 | 3 |
| 文部科学省 | 北極域研究推進プロジェクト | 2019 | 国際共同研究の実施 | 3 |
| 文部科学省 | 独立行政法人教員研修センター運営費交付金に必要な経費 | 2015 | 「教員研修モデルカリキュラム開発」に関する業務の委嘱 | 3 |
| 文部科学省 | 独立行政法人教員研修センター運営費交付金に必要な経費 | 2015 | 「教員研修モデルカリキュラム開発」に関する業務の委嘱 | 3 |
| 文部科学省 | 北極域研究推進プロジェクト | 2018 | 国際共同研究の実施 | 3 |
| 文部科学省 | 北極域研究推進プロジェクト | 2017 | 国際共同研究の実施 | 3 |
| 文部科学省 | 北極域研究推進プロジェクト | 2015 | 国際共同研究の実施 | 3 |
| 国土交通省 | 砂防事業 | 2016 | 小規模流域の風化・侵食速度推定に関する調査・検討 | 3 |
| 経済産業省 | クリーンエネルギー分野における革新的技術の国際共同研究開発事業 | 2020 | 炭酸ガス分解用ソーラー集熱反応器の国際共同研究開発 | 3 |
| 文部科学省 | 新学習指導要領の着実な実施に向けた取組の推進 | 2019 | 教科等の本質的な学びを踏まえたアクティブ・ラーニングの視点からの学習・指導方法の改善のための実践研究 | 2 |
| 文部科学省 | 社会教育を推進するための指導者の資質向上等 | 2019 | 社会教育主事の資格付与のための講習の実施 | 2 |
| 文部科学省 | 小・中・高等学校を通じた英語教育強化事業 | 2016 | 小学校の専科指導の講座及び免許法認定講習の開発 | 2 |
| 農林水産省 | 海外農業・貿易投資環境調査分析事業 | 2019 | 土壌採取・分析、ポリゴン図作成 | 2 |
| 農林水産省 | 技術でつなぐバリューチェーン構築のための研究開発 | 2015 | デンプン代謝の改変による乳白粒低減高品質イネの開発 | 2 |
| 文部科学省 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 2018 | 健康長寿を育む歯学教育コンソーシアム | 2 |
| 文部科学省 | 現職教員の新たな免許状取得を促進する講習等開発事業 | 2016 | 更新講習との相互活用による講習の開発・実施、通信・放送・インターネット等を活用した講習の開発・実施 | 2 |
| 文部科学省 | 北極域研究推進プロジェクト | 2016 | 国際共同研究の実施 | 2 |
| 厚生労働省 | 慢性疼痛診療システム構築モデル事業 | 2018 | 慢性疼痛診療研修会の実施等 | 2 |
| 文部科学省 | 新学習指導要領の円滑な実施に向けた取組の推進 | 2018 | 教科等の本質的な学びを踏まえたアクティブ・ラーニングの視点からの学習・指導方法の改善のための実践研究 | 2 |
| 厚生労働省 | 慢性疼痛診療システム構築モデル事業 | 2019 | 同上 | 2 |
| 文部科学省 | 現職教員の新たな免許状取得を促進する講習等開発事業 | 2015 | 更新講習との相互活用による講習及び通信・放送・インターネット等を活用した講習の開発・実施 | 2 |
| 文部科学省 | 基礎・臨床を両輪とした医学教育改革によるグローバルな医師養成 | 2015 | 国際基準に対応した医学教育認証制度の確立 | 2 |
| 文部科学省 | 基礎・臨床を両輪とした医学教育改革によるグローバルな医師養成 | 2015 | 歯学教育認証制度等の実施に関する調査研究 | 2 |
| 農林水産省 | 技術でつなぐバリューチェーン構築のための研究開発 | 2017 | デンプン代謝の改変による乳白粒低減高品質イネの開発 | 1 |
| 文部科学省 | 課題解決型高度医療人材養成プログラム | 2018 | 国内初の、肝臓移植を担う高度医療人養成 | 1 |
| 文部科学省 | 現職教員の新たな免許状取得を促進する講習等開発事業 | 2017 | 更新講習との相互活用による講習の開発・実施、通信・放送・インターネット等を活用した講習の開発・実施 | 1 |
| 文部科学省 | HPCI戦略プログラム | 2015 | 大規模並列化地震シナリオと都市の自然災害応答シミュレーションのための耐震解析手法の開発 | 1 |
| 国土交通省 | 砂防事業 | 2017 | 小規模流域の風化・侵食速度推定に関する調査・検討 | 1 |
| 文部科学省 | 特別支援教育充実事業 | 2015 | 総合大学の附属校内にある発達障害通級指導教室の利点を生かした、学習障害児への効果的な指導法の追究。 | 1 |
| 厚生労働省 | エイズ予防対策事業委託費 | 2019 | HIV感染者等保健福祉相談事業 | 1 |
| 国土交通省 | 砂防事業 | 2018 | 砂防関係検討 | 1 |
| 厚生労働省 | エイズ予防対策事業委託費 | 2018 | HIV感染者等保健福祉相談事業 | 1 |
| 厚生労働省 | エイズ予防対策事業委託費 | 2017 | HIV感染者等保健福祉相談事業 | 1 |
| 厚生労働省 | エイズ予防対策事業委託費 | 2016 | HIV感染者等保健福祉相談事業 | 1 |
| 厚生労働省 | エイズ予防対策事業委託費 | 2015 | HIV感染者等保健福祉相談事業 | 1 |
| 農林水産省 | 技術でつなぐバリューチェーン構築のための研究開発 | 2016 | デンプン代謝の改変による乳白粒低減高品質イネの開発 | 1 |
| 厚生労働省 | 口腔保健推進事業費 | 2018 | 歯科口腔保健調査研究事業 | 0 |
| 経済産業省 | 環境アセスメント手続の迅速化に向けた環境影響調査の前倒し方法の実証事業 | 2016 | 既設風力発電施設等における環境影響実態把握１ | 0 |
| 文部科学省 | 小・中・高等学校を通じた英語教育強化事業 | 2017 | 小学校の専科指導の講座及び免許法認定講習の開発 | 0 |
