| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2016 | 交付対象事業の実施 | 53,361 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2015 | 交付対象事業の実施 | 52,108 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2017 | 交付対象事業の実施 | 43,419 |
| 厚生労働省 | 生活困窮者就労準備支援事業費等補助金 | 2020 | 地域の要援護者の福祉の向上に資することを目的とする業務 | 37,755 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2018 | 交付対象事業の実施 | 36,132 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2019 | 交付対象事業の実施 | 35,606 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金推進事業 | 2020 | 交付対象事業の実施 | 32,950 |
| 内閣府 | 社会資本総合整備事業に必要な経費
（社会資本整備総合交付金） | 2017 | 幹線道路ネットワークを構築・保管する道路整備 他 | 11,595 |
| 内閣府 | 社会資本総合整備事業に必要な経費
（社会資本整備総合交付金） | 2016 | 幹線道路ネットワークを構築・補完する道路整備 他 | 11,584 |
| 内閣府 | 社会資本総合整備事業に必要な経費
（社会資本整備総合交付金） | 2020 | 幹線道路ネットワークを構築・補完する道路整備 他 | 10,752 |
| 内閣府 | 社会資本総合整備事業に必要な経費
（社会資本整備総合交付金） | 2019 | 幹線道路ネットワークを構築・補完する道路整備 他 | 10,239 |
| 内閣府 | 社会資本総合整備事業に必要な経費
（社会資本整備総合交付金） | 2015 | 幹線道路ネットワークを構築・補完する道路整備 他 | 9,990 |
| 内閣府 | 公立文教施設整備に必要な経費 | 2019 | 学校施設整備事業の実施 | 9,469 |
| 内閣府 | 公立文教施設整備に必要な経費 | 2016 | 学校施設整備事業の実施 | 9,054 |
| 内閣府 | 公立文教施設整備に必要な経費 | 2018 | 学校施設整備事業の実施 | 9,012 |
| 内閣府 | 農業農村整備事業に必要な経費 | 2020 | 農業生産基盤整備事業に係る事業費・補助金 | 8,990 |
| 内閣府 | 社会資本総合整備事業に必要な経費
（社会資本整備総合交付金） | 2018 | 幹線道路ネットワークを構築・補完する道路整備 他 | 8,975 |
| 内閣府 | 公立文教施設整備に必要な経費 | 2017 | 学校施設整備事業の実施 | 8,089 |
| 内閣府 | 農業農村整備事業に必要な経費 | 2020 | 農業生産基盤整備事業に係る事業費・補助金 | 7,623 |
| 内閣府 | 農業生産基盤整備事業に必要な経費 | 2019 | 農業生産基盤整備事業に係る事業費・補助金 | 7,281 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2018 | 那覇空港に航空機整備用の格納庫施設等を整備 | 7,191 |
| 内閣府 | 農業生産基盤整備事業に必要な経費 | 2019 | 農業生産基盤整備事業に係る事業費・補助金 | 6,377 |
| 内閣府 | 農業生産基盤整備事業に必要な経費 | 2016 | 農業生産基盤整備事業に係る事業費・補助金 | 6,275 |
| 内閣府 | 農業生産基盤整備事業に必要な経費 | 2015 | 農業生産基盤整備事業に係る事業費・補助金等 | 5,750 |
| 内閣府 | 農業生産基盤整備事業に必要な経費 | 2018 | 農業生産基盤整備事業に係る事業費・補助金 | 5,727 |
| 厚生労働省 | 障害者医療費 | 2015 | 自立支援医療制度の実施主体 | 5,671 |
| 内閣府 | 公立文教施設整備に必要な経費 | 2020 | 学校施設整備事業の実施 | 5,254 |
| 内閣府 | 農業生産基盤整備事業に必要な経費 | 2016 | 農地・農業水利施設の整備等に係る経費 | 5,253 |
| 内閣府 | 農業生産基盤整備事業に必要な経費 | 2017 | 農業生産基盤整備事業に係る事業費・補助金 | 5,238 |
| 内閣府 | 沖縄開発事業費（旧社会資本整備事業特別会計計上分） | 2020 | 工事及び工事に係る調査・設計・用地補償等 | 5,196 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2015 | 海底光ケーブルネットワークの構築のための整備 | 5,184 |
| 内閣府 | 農業生産基盤整備事業に必要な経費 | 2018 | 農業生産基盤整備事業に係る事業費・補助金 | 5,111 |
| 内閣府 | 沖縄開発事業費（旧社会資本整備事業特別会計計上分） | 2019 | 工事及び工事に係る調査・設計・用地補償等 | 4,882 |
| 内閣府 | 農業生産基盤整備事業に必要な経費 | 2017 | 農地・農業水利施設の整備等に係る経費 | 4,488 |
| 内閣府 | 水産基盤整備に必要な経費 | 2015 | 南大東漁港等の漁港や浮魚礁（パヤオ）の整備、市町村が行う漁港・浮魚礁の整備に対する補助、市町村に対する指導監督 | 4,343 |
| 厚生労働省 | 障害者医療費 | 2020 | 自立支援医療制度の実施主体 | 4,205 |
| 厚生労働省 | 障害者医療費 | 2017 | 自立支援医療制度の実施主体 | 3,999 |
| 内閣府 | 水産基盤整備に必要な経費 | 2017 | 渡名喜漁港等の漁港や浮魚礁（パヤオ）の整備、市町村が行う漁港・浮魚礁の整備に対する補助、市町村に対する指導監督 | 3,542 |
| 内閣府 | 水産基盤整備に必要な経費 | 2020 | 水産基盤整備事業に係る事業費・補助金 | 3,519 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2017 | 那覇空港に航空機整備事業用の格納庫施設等を整備 | 3,294 |
| 内閣府 | 水産基盤整備に必要な経費 | 2019 | 渡名喜漁港等の漁港施設や浮魚礁（パヤオ）の整備、市町村が行う漁港・浮魚礁の整備に対する補助、市町村に対する指導監督 | 3,278 |
| 内閣府 | 沖縄開発事業費（旧社会資本整備事業特別会計計上分） | 2018 | 工事及び工事に係る調査・設計・用地補償等 | 3,223 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2020 | 不発弾等処理交付金 | 2,932 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2017 | 不発弾等処理交付金 | 2,832 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2018 | 不発弾等処理交付金 | 2,771 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2019 | 不発弾等処理交付金 | 2,686 |
| 内閣府 | 沖縄開発事業費（旧社会資本整備事業特別会計計上分） | 2017 | 工事の実施及び工事に係る調査設計・用地補償等 | 2,539 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2016 | 那覇空港に航空機整備事業用の格納庫施設等のための整備 | 2,524 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2015 | 不発弾等処理交付金 | 2,518 |
| 内閣府 | 水産基盤整備に必要な経費 | 2020 | 漁港漁場施設の整備等に係る経費 | 2,490 |
| 内閣府 | 社会資本総合整備事業に必要な経費
（防災・安全社会資本整備交付金） | 2020 | 県民が安全・安心に暮らせる総合的な浸水対策の推進（防災・安全） 他 | 2,428 |
| 内閣府 | 沖縄開発事業（旧社会資本整備事業特別会計計上分） | 2016 | 工事の実施及び工事に係る調査設計・用地取得等 | 2,393 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2015 | データセンターのサーバ数増大に伴う設備の設計を実施 | 2,392 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2016 | 離島地区における安定的かつ高度な情報通信基盤構築のための整備 | 2,386 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2016 | 不発弾等処理交付金 | 2,316 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2019 | 離島航路運航安定化支援事業 | 2,278 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2017 | 農林水産物出荷団体に対する輸送費補助 | 2,167 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2015 | 農林水産物出荷団体に対する輸送費補助 | 2,140 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2018 | 農林水産物出荷団体に対する輸送費補助 | 2,136 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金推進事業 | 2020 | 農林水産物流通条件不利性解消事業 | 2,133 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2019 | 農林水産物流通条件不利性解消事業 | 2,110 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2016 | 農林水産物出荷団体に対する輸送費補助 | 2,101 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2019 | 沖縄離島住民等交通コスト負担軽減事業 | 2,085 |
| 内閣府 | 沖縄北部連携促進特別振興対策特定開発事業費 | 2016 | | 2,060 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金推進事業 | 2020 | 離島航路運航安定化支援事業 | 2,030 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2015 | 離島地区における安定的かつ高度な情報通信基盤構築のための整備 | 1,967 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2018 | 離党住民等の交通コストの低減のための補助 | 1,931 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2017 | 離島住民等の交通コストの低減のための補助 | 1,843 |
| 内閣府 | 社会資本総合整備事業に必要な経費
（防災・安全社会資本整備交付金） | 2017 | 県民が安全・安心に暮らせる総合的な浸水対策の推進（防災・安全） 他 | 1,827 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2019 | 食鳥処理施設整備事業 | 1,809 |
| 内閣府 | 社会資本総合整備事業に必要な経費
（防災・安全社会資本整備交付金） | 2019 | 県民が安全・安心に暮らせる総合的な浸水対策の推進（防災・安全） 他 | 1,782 |
| 内閣府 | 社会資本総合整備事業に必要な経費
（防災・安全社会資本整備交付金） | 2015 | 県民が安全・安心に暮らせる総合的な浸水対策の推進（防災・安全） 他 | 1,749 |
| 内閣府 | 社会資本総合整備事業に必要な経費
（防災・安全社会資本整備交付金） | 2018 | 県民が安全・安心に暮らせる総合的な浸水対策の推進（防災・安全） 他 | 1,688 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2016 | 離島住民等の交通コストの低減のための補助 | 1,683 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2016 | 航空路線の誘致や知名度向上に向けてプロモーション等への補助 | 1,650 |
| 内閣府 | 沖縄開発事業（旧社会資本整備事業特別会計計上分） | 2015 | 工事の実施及び工事に係る調査設計・用地取得等 | 1,630 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2015 | 国際物流拠点産業集積地域において賃貸工場の整備 | 1,614 |
| 警察庁 | 国境離島警備部隊費等 | 2020 | 補助金交付（福岡県警察及沖縄県警察国境離島警備隊費補助金） | 1,485 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2015 | 離島住民等の交通コストの低減のための補助 | 1,459 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2015 | 航空路線の誘致や知名度向上に向けたプロモーション等への補助 | 1,435 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2016 | 地域の基幹産業の持続的振興を図るため、製造コスト低減、品質向上等のための施設整備等への支援 | 1,420 |
| 内閣府 | 沖縄北部連携促進特別振興対策特定開発事業費 | 2015 | | 1,398 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2016 | 認可外保育施設の認可化促進による待機児童の解消及び同施設の質の向上を図るための補助 | 1,395 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2015 | 地域の基幹産業の持続的振興を図るため、製造コスト低減、品質向上等のための施設整備等への支援 | 1,379 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2019 | 含蜜糖振興対策事業費 | 1,363 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2018 | 生涯学習の機会の確保及び充実を図るための設備等を整備 | 1,349 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2015 | 地域の基幹産業の持続的振興を図るため、製造コスト低減、品質向上等のための施設整備等への支援 | 1,336 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金推進事業 | 2020 | 沖縄離島住民等交通コスト負担軽減事業 | 1,321 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2015 | 認可外保育施設の認可化促進による待機児童の解消及び同施設の質の向上を図るための補助 | 1,314 |
| 厚生労働省 | 子育て支援対策臨時特例交付金 | 2016 | 基金の造成 | 1,311 |
| 内閣府 | 社会資本総合整備事業に必要な経費
（防災・安全社会資本整備交付金） | 2016 | 県民が安全・安心に暮らせる総合的な浸水対策の推進 （防災・安全） 他 | 1,275 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2017 | 企業誘致を促進するための賃貸控除運の整備 | 1,248 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2017 | 航空路線の誘致や知名度向上に向けてプロモーション等への補助 | 1,244 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2016 | 地域の基幹産業の持続的振興を図るため、製造コスト低減、品質向上等のための施設整備等への支援 | 1,202 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金推進事業 | 2020 | 配合飼料製造基盤整備事業 | 1,171 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金推進事業 | 2020 | 含蜜糖振興対策事業 | 1,156 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2017 | 県産鶏肉の衛生管理・品質管理の高度化に必要な施設を整備 | 1,142 |
| 厚生労働省 | 令和２年度新型コロナウイルス感染症緊急包括支援交付金（児童福祉施設等分） | 2020 | 新型コロナウイルス感染症の感染拡大防止 | 1,138 |
| 農林水産省 | 産地生産基盤パワーアップ事業 | 2020 | 取組主体に対する補助金交付事務、指導監督業務 | 1,128 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金推進事業 | 2020 | アジアITビジネスセンター（仮称）整備事業 | 1,113 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2018 | 地域の基幹産業の持続的振興を図るため、製造コスト低減、品質向上等のための施設整備等への支援 | 1,110 |
| 国土交通省 | 一般空港等整備事業（補助） | 2018 | 久米島、宮古、新石垣、与那国、南大東空港における空港整備事業費 | 1,108 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2016 | 地域の基幹産業の持続的振興を図るため、製造コスト低減、品質向上等のための施設整備等への支援 | 1,082 |
| 農林水産省 | 農業水路等長寿命化・防災減災事業 | 2019 | 補助金等の交付事務 | 1,068 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2017 | 地域の基幹産業の持続的振興を図るため、製造コスト低減、品質向上等のための施設整備等への支援 | 1,046 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2016 | 地域の基幹産業の持続的振興を図るため、製造コスト低減、品質向上等のための施設整備等への支援 | 1,039 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2017 | 地域の基幹産業の持続的振興を図るため、製造コスト低減、品質向上等のための施設整備等への支援 | 1,038 |
| 農林水産省 | 農業水路等長寿命化・防災減災事業 | 2020 | 補助金等の交付事務 | 1,019 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2017 | 国際物流拠点の形成等を図るため、那覇港総合物流センターの整備等を実施 | 1,002 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2018 | 国際物流拠点の形成等を図るため、那覇港総合物流センターの整備等を実施 | 944 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2017 | 特殊病害虫の侵入防止、根絶防止等のための調査及び防除等を実施 | 935 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2019 | 本部港立体駐車場整備事業 | 893 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2018 | 特殊病害虫の侵入防止、根絶防止等のための調査及び防除等を実施 | 878 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2019 | 含みつ糖製糖施設近代化事業 | 868 |
| 農林水産省 | 中山間地域所得向上支援事業 | 2017 | 市村への交付事務等 | 843 |
| 国土交通省 | 一般空港等整備事業（補助） | 2019 | 久米島、宮古、新石垣、与那国空港における空港整備事業費 | 827 |
| 国土交通省 | 地域居住機能再生推進事業 | 2019 | 地域居住機能再生推進事業 | 814 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2019 | 分蜜糖振興対策支援事業費 | 803 |
| 厚生労働省 | 保育対策総合支援事業費補助金（保育環境改善等事業を除く） | 2020 | 保育対策総合支援事業費補助金 | 792 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2019 | 沖縄観光国際化ビッグバン事業 | 792 |
| 内閣府 | 公立文教施設整備に必要な経費 | 2019 | 学校施設整備事業の実施 | 777 |
| 農林水産省 | 特定地域経営支援対策事業 | 2016 | 市町村への補助金事務、事業推進に必要な事務等 | 775 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金推進事業 | 2020 | 含みつ糖製糖施設近代化事業 | 771 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2018 | 外国人入域観光客数を増やすため、航空路線の誘致や知名度向上等を実施 | 763 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2018 | 地域の基幹産業の持続的振興を図るため、製造コスト低減、品質向上等のための施設整備等への支援 | 762 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金推進事業 | 2020 | 分蜜糖振興対策支援事業費 | 747 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2018 | 国際物流拠点の形成頭を図るため、那覇港総合物流センターの整備等を実施（H29繰） | 716 |
| 農林水産省 | 特定地域経営支援対策事業 | 2018 | 市町村等への補助金事務、事業推進に必要な事務等 | 715 |
| 文部科学省 | 高校生等への修学支援 | 2020 | 奨学のための給付金、学び直し支援金、家計急変世帯への支援、専攻科の生徒への修学支援 | 689 |
| 文部科学省 | 国宝・重要文化財等の保存整備等 | 2016 | 支出委任 | 683 |
| 厚生労働省 | 保育対策総合支援事業費補助金 | 2015 | 保育対策総合支援事業費補助金 | 677 |
| 文部科学省 | 国宝・重要文化財等の保存整備等 | 2015 | 支出委任 | 665 |
| 国土交通省 | 一般空港等整備事業（補助） | 2017 | 南大東、宮古、新石垣、与那国空港における空港整備事業費 | 643 |
| 内閣府 | 公立文教施設整備に必要な経費 | 2020 | 学校施設整備事業の実施 | 637 |
| 内閣府 | 沖縄北部連携促進特別振興対策特定開発事業費 | 2020 | 対象事業の実施 | 626 |
| 厚生労働省 | 生活困窮者就労準備支援事業費等補助金 | 2018 | 地域の要援護者の福祉の向上に資することを目的とする | 616 |
| 農林水産省 | 強い水産業づくり交付金 | 2015 | 市町村等に対する交付金の交付事務、指導監督等 | 595 |
| 厚生労働省 | 精神障害者措置入院等 | 2015 | 措置入院の実施主体及び医療保護入院の実施主体 | 548 |
| 国土交通省 | 一般空港等整備事業（補助） | 2015 | 粟国、伊江島、下地島、与那国空港における空港整備事業 | 536 |
| 農林水産省 | 漁港関係等災害復旧事業 | 2015 | 漁港施設、海岸保全施設等の災害復旧、市町村事業に対する指導監督 | 504 |
| 農林水産省 | 特定地域経営支援対策事業 | 2020 | 市町村等への補助金事務、事業推進に必要な事務等 | 497 |
| 警察庁 | 都道府県警察施設整備費補助金（交通安全施設） | 2016 | 補助金交付 | 495 |
| 防衛省 | 騒音防止事業（一般防音） | 2017 | 学校の防音工事 | 489 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金推進事業 | 2020 | 県立病院医師派遣補助事業 | 487 |
| 内閣府 | 大学等における修学支援に必要な経費 | 2020 | 大学等における修学支援 | 485 |
| 農林水産省 | 特定地域経営支援対策事業 | 2015 | 市町村への補助金事務、事業推進に必要な事務等 | 483 |
| 農林水産省 | 農業人材力強化総合支援事業（旧新規就農・経営継承総合支援事業） | 2018 | （公財）沖縄県農業振興公社及び市町村への補助金等交付 | 478 |
| 文部科学省 | 高校生等への修学支援 | 2018 | 高校生等奨学給付金、学び直し支援金、家計急変世帯への支援 | 471 |
| 防衛省 | 騒音防止事業（一般防音） | 2015 | 学校の防音工事等 | 470 |
| 厚生労働省 | 精神障害者措置入院等 | 2016 | 措置入院の実施主体及び
医療保護入院の実施主体 | 470 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金推進事業 | 2020 | 沖縄観光国際化ビックバン事業 | 468 |
| 内閣府 | 沖縄振興交付金事業推進費 | 2019 | 災害に強い高機能型栽培施設の導入推進事業 | 466 |
| 厚生労働省 | 精神障害者措置入院等 | 2017 | 措置入院の実施主体及び
医療保護入院の実施主体 | 463 |
| 農林水産省 | 特定地域経営支援対策事業 | 2017 | 市町村への補助金事務、事業推進に必要な事務等 | 462 |
| 農林水産省 | 漁港関係等災害復旧事業 | 2015 | 漁港施設、海岸保全施設等の災害復旧 | 451 |
| 厚生労働省 | 精神障害者措置入院等 | 2018 | 措置入院の実施主体及び | 446 |
| 文部科学省 | 高校生等への修学支援 | 2017 | 高校生等奨学給付金、学び直し支援金、家計急変世帯への支援 | 439 |
| 農林水産省 | 農業人材力強化総合支援事業
（旧新規就農・経営継承総合支援事業） | 2019 | 就農希望者及び市町村への補助金等交付 | 425 |
| 農林水産省 | 農業人材力強化総合支援事業 | 2020 | （公財）沖縄県農業振興公社及び市町村への補助金等交付 | 423 |
| 警察庁 | 機動隊等警察施設の整備 | 2020 | 予算配分 | 419 |
| 農林水産省 | 中山間地域所得向上支援事業 | 2020 | 市村への交付事務 | 415 |
| 文部科学省 | 高校生等への修学支援 | 2016 | 高校生等奨学給付金、学び直し支援金、家計急変世帯への支援 | 414 |
| 文部科学省 | 高校生等への修学支援 | 2019 | 高校生等奨学給付金、学び直し支援金、家計急変世帯への支援 | 404 |
| 厚生労働省 | 精神障害者措置入院等 | 2019 | 措置入院及び医療保護入院の実施主体 | 397 |
| 厚生労働省 | 精神障害者措置入院等 | 2020 | 措置入院及び医療保護入院の実施主体 | 380 |
| 農林水産省 | 農業人材力強化総合支援事業（旧新規就農・経営継承総合支援事業） | 2016 | 就農希望者及び市町村への補助金等交付 | 377 |
| 内閣府 | 治山事業に必要な経費 | 2020 | 治山施設の整備等に係る経費 | 372 |
| 農林水産省 | 浜の活力再生・成長促進交付金 | 2019 | 市町村等に対する交付金の交付事務、指導監督等 | 363 |
| 警察庁 | 警察署等都道府県警察施設の整備 | 2019 | 補助金交付 | 363 |
| 国土交通省 | 港湾関係災害復旧事業費 | 2015 | 港湾関係災害復旧事業 | 359 |
| 防衛省 | 騒音防止事業（一般防音） | 2020 | 学校の防音工事 補助金等交付 | 354 |
| 農林水産省 | 家畜伝染病予防費 | 2020 | 患畜処理手当等交付金
（豚熱） | 354 |
| 厚生労働省 | 生活困窮者就労準備支援事業費等補助金
（うち生活保護適正化等事業） | 2018 | 地域の要援護者の福祉の向上に資することを目的とする | 352 |
| 内閣府 | 治山事業に必要な経費 | 2019 | 治山事業費補助 | 333 |
| 内閣府 | 森林整備事業に必要な経費 | 2016 | 市町村有林の森林整備に関する経費等 | 332 |
| 内閣府 | 森林整備事業に必要な経費 | 2015 | 市町村有林の森林整備に関する経費等 | 325 |
| 厚生労働省 | 小児慢性特定疾病医療費負担金 | 2015 | 同上 | 315 |
| 農林水産省 | 漁港関係等災害復旧事業 | 2016 | 漁港施設、海岸保全施設等の災害復旧 | 312 |
| 農林水産省 | 漁港関係等災害復旧事業 | 2016 | 漁港施設、海岸保全施設等の災害復旧、市町村事業に対する指導監督 | 312 |
| 内閣府 | 森林整備事業に必要な経費 | 2017 | 市町村有林の森林整備に関する経費等 | 311 |
| 厚生労働省 | 生活困窮者就労準備支援事業費等補助金
（うち生活保護適正化等事業） | 2019 | 地域の要援護者の福祉の向上に資することを目的とする | 309 |
| 内閣府 | 森林整備事業に必要な経費 | 2018 | 市町村有林の森林整備に関する経費等 | 307 |
| 国土交通省 | 港湾関係災害復旧事業費 | 2016 | 港湾関係災害復旧事業 | 305 |
| 厚生労働省 | 小児慢性特定疾病医療費負担金 | 2018 | 同上 | 301 |
| 防衛省 | 騒音防止事業（一般防音） | 2016 | 学校の防音工事等 | 298 |
| 厚生労働省 | 小児慢性特定疾病医療費負担金 | 2017 | 同上 | 293 |
| 厚生労働省 | 小児慢性特定疾病医療費負担金 | 2020 | 同上 | 292 |
| 内閣府 | 治山事業に必要な経費 | 2015 | 治山事業費補助 | 290 |
| 防衛省 | 騒音防止事業（一般防音） | 2018 | 学校の防音工事 | 290 |
| 内閣府 | 森林整備事業に必要な経費 | 2020 | 森林整備事業に関する事業費・補助金 | 286 |
| 内閣府 | 森林整備事業に必要な経費 | 2019 | 市町村有林の森林整備に関する経費等 | 284 |
| 内閣府 | 治山事業に必要な経費 | 2016 | 治山事業費補助 | 276 |
| 国土交通省 | 一般空港等整備事業（補助） | 2020 | 与那国、下地島、宮古、多良間、南大東、北大東、久米島空港における空港整備事業費 | 264 |
| 内閣府 | 沖縄北部連携促進特別振興対策特定開発事業費 | 2019 | 対象事業の実施 | 264 |
| 厚生労働省 | 小児慢性特定疾病医療費負担金 | 2016 | 同上 | 262 |
| 厚生労働省 | 生活困窮者就労準備支援事業費等補助金
（うち生活保護適正化等事業） | 2020 | 地域の要援護者の福祉の向上に資することを目的とする | 261 |
| 農林水産省 | 中山間地域所得向上支援事業 | 2018 | 村への交付事務 | 260 |
| 文部科学省 | 高校生等への修学支援 | 2015 | 高校生等奨学給付金、学び直しへの支援、家計急変世帯への支援 | 258 |
| 文部科学省 | 歴史活き活き！史跡等総合活用整備事業 | 2016 | 文化財等保存整備費補助金（支出委任） | 252 |
| 農林水産省 | 中山間地域所得向上支援事業 | 2019 | 区画整理、農業用用排水施設等の整備を実施 | 251 |
| 経済産業省 | 石油貯蔵施設立地対策等交付金
石油貯蔵施設立地対策等交付金事務等交付金 | 2018 | 公共用施設の整備に係る事業、間接交付事業の交付事務 | 243 |
| 経済産業省 | 石油貯蔵施設立地対策等交付金
石油貯蔵施設立地対策等交付金事務等交付金 | 2015 | 公共用施設の整備に係る事業
間接交付事業の交付事務 | 243 |
| 経済産業省 | 石油貯蔵施設立地対策等交付金
石油貯蔵施設立地対策等交付金事務等交付金 | 2019 | 公共用施設の整備に係る事業、間接交付事業の交付事務 | 242 |
| 経済産業省 | 石油貯蔵施設立地対策等交付金
石油貯蔵施設立地対策等交付金事務等交付金 | 2017 | 公共用施設の整備に係る事業、間接交付事業の交付事務 | 241 |
| 経済産業省 | 石油貯蔵施設立地対策等交付金
石油貯蔵施設立地対策等交付金事務等交付金 | 2020 | 公共用施設の整備に係る事業、間接交付事業の交付事務 | 240 |
| 厚生労働省 | 保育対策総合支援事業費補助金（保育環境改善等事業を除く） | 2019 | 保育対策総合支援事業費補助金 | 237 |
| 内閣府 | 治山事業に必要な経費 | 2017 | 治山事業費補助 | 230 |
| 経済産業省 | 石油貯蔵施設立地対策等交付金
石油貯蔵施設立地対策等交付金事務等交付金 | 2016 | 公共用施設の整備に係る事業、間接交付事業の交付事務 | 230 |
| 警察庁 | 機動隊等警察施設の整備 | 2019 | 予算配分 | 225 |
| 厚生労働省 | 児童虐待・DV対策等総合支援事業 | 2019 | 令和元年度虐待・DV対策等総合支援事業の実施 | 213 |
| 警察庁 | 国境離島警備部隊費等 | 2020 | 予算配分 | 208 |
| 内閣府 | 沖縄の子供の貧困対策に必要な経費 | 2020 | 居場所の運営支援 等 | 205 |
| 農林水産省 | 家畜伝染病予防費 | 2020 | 家畜伝染病予防費負担金
（豚熱防疫対策等） | 203 |
| 内閣府 | 治山事業に必要な経費 | 2018 | 治山事業費補助 | 201 |
| 農林水産省 | 次世代林業基盤づくり交付金 | 2018 | 県下の市町村等が実施する森林・林業再生基盤づくり交付金事業に対する補助等 | 190 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2016 | 所有者不明土地問題対策経費 | 186 |
| 内閣府 | 沖縄北部連携促進特別振興事業費 | 2019 | 用地購入 | 185 |
| 内閣府 | 沖縄の子供の貧困対策に必要な経費 | 2019 | 居場所の運営支援 等 | 182 |
| 農林水産省 | 家畜伝染病予防費 | 2019 | 家畜伝染病予防費負担金（CSF防疫対策等） | 178 |
| 防衛省 | 米軍再編関係経費 | 2020 | 文化財発掘調査業務 | 168 |
| 防衛省 | 提供施設の整備 | 2017 | 文化財発掘調査業務委託 | 166 |
| 農林水産省 | 特定地域経営支援対策事業 | 2019 | 市町村等への補助金事務、事業推進に必要な事務等 | 164 |
| 厚生労働省 | 保育対策総合支援事業費補助金（保育環境改善等事業を除く） | 2018 | 保育対策総合支援事業費補助金 | 163 |
| 厚生労働省 | へき地における医療提供等の実施 | 2020 | へき地保健医療対策事業 | 159 |
| 農林水産省 | 漁港関係等災害復旧事業 | 2017 | 漁港施設の災害復旧 | 156 |
| 農林水産省 | 漁港関係等災害復旧事業 | 2017 | 漁港施設の災害復旧 | 156 |
| 農林水産省 | 水産業競争力強化緊急事業 | 2017 | 施設整備に要する経費 | 152 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2015 | 所有者不明土地問題対策経費 | 151 |
| 厚生労働省 | へき地における医療提供等の実施 | 2015 | へき地診療所等に対する運営費に係る補助 | 149 |
| 農林水産省 | 漁港関係等災害復旧事業 | 2019 | 漁港施設・漁業用施設の災害復旧 | 146 |
| 農林水産省 | 漁港関係等災害復旧事業 | 2019 | 漁港施設・漁業用施設の災害復旧 | 146 |
| 厚生労働省 | へき地における医療提供等の実施 | 2018 | へき地保健医療対策事業 | 146 |
| 防衛省 | ＳＡＣＯ関係経費 | 2018 | 文化財発掘調査業務 | 142 |
| 総務省 | 統計調査の実施等事業（経常調査等） | 2018 | 〃 | 142 |
| 文部科学省 | へき地児童生徒援助費等補助 | 2017 | へき地児童生徒援助費等補助金（市町村負担分） | 138 |
| 文部科学省 | へき地児童生徒援助費等補助 | 2018 | へき地児童生徒援助費等補助金（市町村負担分） | 137 |
| 環境省 | 漂流・漂着・海底ごみに係る削減方策総合検討事業 | 2020 | 漂流・漂着・海底ごみの回収・処理等の実施。 | 136 |
| 国土交通省 | 一般空港等整備事業（直轄）（耐震対策事業を除く） | 2015 | 土地使用料 | 136 |
| 総務省 | 統計調査の実施等事業（経常調査等） | 2019 | 〃 | 135 |
| 農林水産省 | 浜の活力再生交付金 | 2017 | 市町村等に対する交付金の交付事務、指導監督等 | 135 |
| 総務省 | 統計調査の実施等事業（経常調査等） | 2017 | 〃 | 134 |
| 文部科学省 | へき地児童生徒援助費等補助 | 2019 | へき地児童生徒援助費等補助金（市町村負担分） | 133 |
| 防衛省 | ＳＡＣＯ関係経費 | 2017 | 文化財発掘調査業務 | 133 |
| 厚生労働省 | へき地における医療提供等の実施 | 2016 | へき地診療所等に対する運営費に係る補助 | 133 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2017 | 所有者不明土地実態調査（測量等調査等） | 133 |
| 総務省 | 統計調査の実施等事業（経常調査等） | 2020 | 〃 | 132 |
| 厚生労働省 | へき地における医療提供等の実施 | 2019 | へき地保健医療対策事業 | 132 |
| 文部科学省 | へき地児童生徒援助費等補助 | 2016 | へき地児童生徒援助費等補助金（市町村負担分） | 132 |
| 総務省 | 統計調査の実施等事業（経常調査等） | 2016 | 〃 | 131 |
| 環境省 | 漂流・漂着・海底ごみに係る削減方策総合検討事業 | 2018 | 漂流・漂着・海底ごみの回収・処理等の実施。 | 129 |
| 総務省 | 統計調査の実施等事業（経常調査等） | 2015 | 〃 | 129 |
| 厚生労働省 | ドクターヘリの導入促進（統合補助金分） | 2020 | ドクターヘリの導入促進に対する補助等 | 127 |
| 厚生労働省 | へき地における医療提供等の実施 | 2017 | へき地診療所等に対する運営費に係る補助 | 127 |
| 厚生労働省 | ドクターヘリの導入促進（統合補助金分） | 2018 | ドクターヘリの導入促進、ヘリコプター等添乗医師等確保に対する補助等 | 126 |
| 環境省 | 漂流・漂着・海底ごみに係る削減方策総合検討事業 | 2019 | 漂流・漂着・海底ごみの回収・処理等の実施。 | 120 |
| 厚生労働省 | 地方改善施設整備費補助金 | 2017 | 隣保館等施設整備費 | 119 |
| 農林水産省 | 漁港機能増進事業 | 2019 | 県事業の実施経費、管内の市町村に対する交付金の交付事務 | 112 |
| 環境省 | 漂流・漂着・海底ごみに係る削減方策総合検討事業 | 2017 | 漂流・漂着・海底ごみの回収・処理等の実施。 | 111 |
| 防衛省 | ＳＡＣＯ関係経費 | 2019 | 文化財発掘調査業務 | 105 |
| 厚生労働省 | 地方改善施設整備費補助金 | 2016 | 隣保館等施設整備費 | 105 |
| 内閣府 | 沖縄子供の貧困対策に必要な経費 | 2018 | 子供の貧困対策支援員配置、居場所の運営支援 等 | 104 |
| 文部科学省 | へき地児童生徒援助費等補助 | 2020 | へき地児童生徒援助費等補助金（市町村負担分） | 102 |
| 国土交通省 | 一般空港等整備事業（直轄）（耐震対策事業を除く） | 2016 | 土地使用料、業務委託費 | 102 |
| 警察庁 | 都道府県警察施設整備費補助金（災害に備えた道路交通環境の整備） | 2019 | 補助金交付 | 99 |
| 厚生労働省 | 母子父子寡婦福祉貸付金 | 2019 | 母子父子寡婦福祉資金の
貸付 | 99 |
| 文部科学省 | へき地児童生徒援助費等補助 | 2015 | へき地児童生徒援助費等補助金(市町村負担分) | 97 |
| 警察庁 | 都道府県警察施設整備費補助金（災害に備えた道路交通環境の整備） | 2018 | 補助金交付 | 96 |
| 国土交通省 | 地域居住機能再生推進事業 | 2015 | 地域居住機能再生推進事業 | 96 |
| 環境省 | 漂流・漂着・海底ごみに係る削減方策総合検討事業 | 2016 | 漂流・漂着・海底ごみの回収・処理等の実施。 | 87 |
| 農林水産省 | 消費・安全対策交付金 | 2020 | 重要病害虫の発生予防・まん延防止に係る事業実施計画の作成、事業の実施・事後評価等 | 87 |
| 防衛省 | 騒音防止事業（住宅防音） | 2020 | 住宅防音事業（補助金等交付） | 69 |
| 厚生労働省 | 未熟児養育費負担金 | 2020 | 養育医療の給付 | 68 |
| 防衛省 | 米軍再編関係経費 | 2019 | 文化財発掘調査業務 | 67 |
| 厚生労働省 | 職業能力開発校施設整備費等補助金 | 2017 | 都道府県立職業能力開発施設における建物・機器等の整備等 | 65 |
| 厚生労働省 | 未熟児養育費負担金 | 2016 | 養育医療の給付 | 65 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2018 | 所有者不明土地実態調査（所有者探索調査） | 65 |
| 厚生労働省 | 未熟児養育費負担金 | 2015 | 養育医療の給付 | 63 |
| 防衛省 | 米軍再編関係経費 | 2019 | 文化財発掘調査業務 | 62 |
| 農林水産省 | 消費・安全対策交付金 | 2019 | 重要病害虫の発生予防・まん延防止に係る事業実施計画の作成、事業の実施・事後評価等 | 62 |
| 農林水産省 | 離島漁業再生支援等交付金 | 2016 | 〃 | 61 |
| 農林水産省 | 離島漁業再生支援等交付金 | 2020 | 交付金の交付事務、指導監督、促進計画の審査等 | 59 |
| 厚生労働省 | 臨床研修費 | 2015 | 医師臨床研修の実施 | 58 |
| 農林水産省 | 離島漁業再生支援等交付金 | 2019 | 交付金の交付事務、指導監督、促進計画の審査等 | 57 |
| 農林水産省 | 離島漁業再生支援交付金 | 2015 | 〃 | 57 |
| 文部科学省 | 理科教育等設備整備費補助等 | 2016 | 理科教育設備整備費等補助金の支出 | 57 |
| 内閣府 | 森林整備事業に必要な経費 | 2020 | 県有林の整備及び特定森林再生に関する経費 | 56 |
| 農林水産省 | 離島漁業再生支援等交付金 | 2018 | 交付金の交付事務、指導監督、促進計画の審査等 | 56 |
| 農林水産省 | 消費・安全対策交付金 | 2016 | 重要病害虫の発生予防・まん延防止、家畜衛生の推進、病害虫の防除の推進等に係る事業実施計画の作成、事業の実施・事後評価等 | 56 |
| 農林水産省 | 消費・安全対策交付金 | 2015 | 重要病害虫の発生予防・まん延防止、家畜衛生の推進、農薬の適正使用等の総合的な推進等に係る事業実施計画の作成、事業の実施・事後評価等 | 56 |
| 農林水産省 | 離島漁業再生支援等交付金 | 2017 | 交付金の交付事務、指導監督、促進計画の審査等 | 54 |
| 農林水産省 | ６次産業化ネットワーク推進対策事業 | 2016 | 事業実施主体に対する交付金の交付事務、指導監督、調整等 | 53 |
| 農林水産省 | ６次産業化ネットワーク推進対策事業 | 2015 | 事業実施主体への交付金交付事務、指導監督、調整等 | 53 |
| 文部科学省 | 理科教育等設備整備費補助等 | 2015 | 理科教育設備整備費等補助金の支出 | 52 |
| 農林水産省 | 消費・安全対策交付金 | 2018 | 重要病害虫の発生予防・まん延防止、家畜衛生の推進、農薬の適正使用等の総合的な推進等に係る事業実施計画の作成、事業の実施・事後評価等 | 51 |
| 農林水産省 | 消費・安全対策交付金 | 2017 | 重要病害虫の発生予防・まん延防止、家畜衛生の推進、病害虫の防除の推進等に係る事業実施計画の作成、事業の実施・事後評価等 | 50 |
| 文部科学省 | 理科教育等設備整備費補助等 | 2018 | 理科教育設備整備費等補助金の支出 | 50 |
| 文部科学省 | 理科教育等設備整備費補助等 | 2020 | 理科教育設備整備費等補助金の支出 | 48 |
| 厚生労働省 | 国民健康保険団体連合会等補助金 | 2019 | 補助金等に係る予算の執行の適正化に関する法律第26条第2項に基づき、補助金等の交付に関する事務の一部を委任。 | 48 |
| 厚生労働省 | 母子父子寡婦福祉貸付金 | 2017 | 母子父子寡婦福祉資金の
貸付 | 48 |
| 文部科学省 | 理科教育等設備整備費補助等 | 2019 | 理科教育設備整備費等補助金の支出 | 47 |
| 文部科学省 | 理科教育等設備整備費補助等 | 2017 | 理科教育設備整備費等補助金の支出 | 47 |
| 防衛省 | 補償経費等 | 2019 | 権利取得裁決に係る不動産鑑定料 | 44 |
| 警察庁 | 都道府県警察施設整備費補助金（災害に備えた道路交通環境の整備） | 2020 | 補助金交付（交通安全施設等整備事業） | 43 |
| 農林水産省 | 沖縄県試験研究機関整備の助成に要する経費 | 2017 | 試験研究の推進に必要な施設及び備品等を整備 | 41 |
| 農林水産省 | 沖縄県試験研究機関整備の助成に要する経費 | 2015 | 沖縄県の農林水産業の発展に資する技術の向上に必要な試験研究を行うための備品を整備 | 41 |
| 厚生労働省 | 未熟児養育費負担金 | 2018 | 養育医療の給付 | 41 |
| 内閣府 | 良好で緑豊かな都市空間の形成等のための
国営公園事業に必要な経費 | 2016 | 首里城地区の復元整備に係る発掘調査の実施 | 41 |
| 農林水産省 | 沖縄県試験研究機関の助成に要する経費 | 2019 | 試験研究の推進に必要な施設及び備品等を整備 | 39 |
| 厚生労働省 | 婦人保護事業費補助金 | 2019 | 婦人相談所による要保護女子等の一時保護 | 39 |
| 農林水産省 | 沖縄県試験研究機関の助成に要する経費 | 2018 | 試験研究の推進に必要な施設及び備品等を整備 | 39 |
| 農林水産省 | 沖縄県試験研究機関整備の助成に要する経費 | 2016 | 技術開発の推進に必要な施設及び機器等を整備 | 39 |
| 厚生労働省 | 小児救急医療体制の充実 | 2018 | 小児救急医療を担う医療機関の運営に対する補助 | 39 |
| 農林水産省 | 沖縄県試験研究機関の助成に要する経費 | 2020 | 試験研究の推進に必要な施設及び備品等を整備 | 38 |
| 厚生労働省 | 婦人保護事業費補助金 | 2015 | 要保護女子等の収容保護及びＤＶ法に基づくＤＶ被害者の保護等 | 38 |
| 内閣府 | 良好で緑豊かな都市空間の形成等のための
国営公園事業に必要な経費 | 2015 | 首里城地区の復元整備に係る発掘調査の実施 | 38 |
| 厚生労働省 | 職業転換訓練費負担金 | 2016 | 訓練手当の支給 | 37 |
| 厚生労働省 | 婦人保護事業費補助金 | 2016 | 婦人相談所による要保護女子等の一時保護 | 37 |
| 厚生労働省 | 婦人保護事業費補助金 | 2020 | 婦人保護施設による要保護女子等の収容保護 | 35 |
| 厚生労働省 | 婦人保護事業費補助金 | 2018 | 婦人相談所による要保護女子等の一時保護 | 35 |
| 厚生労働省 | 産科医・産科医療機関の確保 | 2020 | 産科医療機関の運営に対する補助 | 34 |
| 厚生労働省 | 産科医・産科医療機関の確保 | 2019 | 産科医療機関の運営に対する補助 | 34 |
| 厚生労働省 | 産科医・産科医療機関の確保 | 2018 | 産科医療機関の運営に対する補助 | 34 |
| 厚生労働省 | 産科医・産科医療機関の確保 | 2017 | 産科医療機関の運営に対する補助 | 34 |
| 厚生労働省 | 産科医・産科医療機関の確保 | 2016 | 産科医療機関の運営に対する補助 | 34 |
| 厚生労働省 | 産科医・産科医療機関の確保 | 2015 | 産科医療機関の運営に対する補助 | 34 |
| 防衛省 | 提供施設の整備 | 2016 | 文化財発掘調査業務委託 | 33 |
| 厚生労働省 | 婦人保護事業費補助金 | 2017 | 婦人相談所による要保護女子等の一時保護 | 33 |
| 内閣府 | 良好で緑豊かな都市空間の形成等のための
国営公園事業に必要な経費 | 2017 | 首里城地区の復元整備に係る発掘調査の実施 | 33 |
| 内閣府 | 沖縄開発事業費（旧社会資本整備事業特別会計計上分） | 2018 | 平成３０年度小禄道路（鏡水原遺跡）埋蔵文化財発掘調査業務 | 32 |
| 厚生労働省 | 戦没者等の遺族に対する特別弔慰金等の支給事務 | 2020 | 各種特別給付金及び特別弔慰金の裁定等に係る事務費（事務委託） | 31 |
| 厚生労働省 | 国民健康保険団体連合会等補助金 | 2018 | 補助金等に係る予算の執行の適正化に関する法律第26条第2項に基づき、補助金等の交付に関する事務の一部を委任。 | 31 |
| 防衛省 | ＳＡＣＯ関係経費 | 2020 | 文化財発掘調査業務 | 28 |
| 国土交通省 | 一般空港等整備事業（直轄）（耐震対策事業を除く） | 2017 | 埋蔵文化財調査委託 | 28 |
| 防衛省 | 補償経費等 | 2017 | 支障除去期間補償金 | 27 |
| 厚生労働省 | 婦人保護事業費負担金 | 2016 | 婦人相談所による要保護女子等の一時保護 | 27 |
| 農林水産省 | 沖縄県試験研究機関の助成に要する経費 | 2020 | 農業関係の試験研究の実施 | 26 |
| 厚生労働省 | 母子父子寡婦福祉貸付金 | 2020 | 母子父子寡婦福祉資金の貸付 | 26 |
| 防衛省 | ＳＡＣＯ関係経費 | 2015 | 文化財発掘調査業務 | 26 |
| 農林水産省 | 農業施設災害復旧等事業 | 2015 | 同上 | 26 |
| 農林水産省 | 農林漁業センサス | 2018 | 統計法に基づく法定受託事務の実施 | 26 |
| 文部科学省 | 理科教育等設備整備費補助等 | 2016 | 理科教育設備整備費等補助金の実施 | 26 |
| 厚生労働省 | 婦人保護事業費負担金 | 2017 | 婦人相談所による要保護女子等の一時保護 | 26 |
| 厚生労働省 | 婦人保護事業費負担金 | 2015 | 婦人相談所による要保護女子等の一時保護 | 26 |
| 内閣府 | 沖縄開発事業費（旧社会資本整備事業特別会計計上分） | 2020 | 中城湾港改修工事に伴う漁業補償金等 | 25 |
| 厚生労働省 | 遺骨収集関連事業 | 2020 | 沖縄における遺骨収集や遺骨情報の収集等を行う（委託） | 25 |
| 内閣府 | 沖縄の人材育成推進に必要な経費 | 2020 | 高校中退者等キャリア形成支援事業の実施 | 25 |
| 厚生労働省 | 遺骨収集関連事業 | 2019 | 沖縄における遺骨収集や遺骨情報の収集等を行う（委託） | 25 |
| 厚生労働省 | 婦人保護事業費負担金 | 2019 | 婦人相談所による要保護女子等の一時保護 | 25 |
| 文部科学省 | 切れ目ない支援体制整備充実事業費補助 | 2018 | 切れ目ない支援体制整備に向けた取組として、自治体等が、（１）特別な支援を必要とする子供への就学前から学齢期、社会参加までの切れ目ない支援体制整備、（２）看護師、外部専門家の配置をする場合に要する経費の一部を補助する。 | 25 |
| 原子力規制委員会 | 環境放射能水準調査等事業 | 2018 | 各都道府県における環境放射能水準の調査 | 25 |
| 厚生労働省 | 遺骨収集関連事業 | 2018 | 沖縄における遺骨収集や遺骨情報の収集等を行う（委託） | 25 |
| 厚生労働省 | 地方改善施設整備費補助金 | 2018 | 隣保館等施設整備費 | 25 |
| 厚生労働省 | 婦人保護事業費負担金 | 2020 | 婦人相談所による要保護女子等の一時保護 | 24 |
| 文部科学省 | 理科教育等設備整備費補助等 | 2019 | 理科教育設備整備費等補助金の実施 | 24 |
| 文部科学省 | 理科教育等設備整備費補助等 | 2017 | 理科教育設備整備費等補助金の実施 | 24 |
| 厚生労働省 | 戦没者等の遺族に対する特別弔慰金等の支給事務 | 2016 | 各種特別給付金及び特別弔慰金の裁定等に係る事務費（事務委託） | 24 |
| 文部科学省 | 理科教育等設備整備費補助等 | 2018 | 理科教育設備整備費等補助金の実施 | 23 |
| 文部科学省 | 切れ目ない支援体制整備充実事業費補助 | 2017 | 特別支援教育専門家等配置等の切れ目ない支援体制整備に向けた取組に係る経費の一部補助を行う。 | 23 |
| 文部科学省 | 補習等のための指導員等派遣事業 | 2019 | 補習等のための指導員等配置に要する経費
（報酬・賃金、報償費、旅費） | 22 |
| 農林水産省 | 家畜伝染病予防費 | 2015 | 家畜伝染病予防費負担金（口蹄疫、高病原性鳥インフルエンザ、ヨーネ病等） | 22 |
| 文部科学省 | 地域の特色ある埋蔵文化財活用事業 | 2017 | 文化財等保存整備費補助金（支出委任） | 22 |
| 農林水産省 | 食料産業・６次産業化交付金 | 2020 | 事業実施主体に対する交付金の交付事務、指導監督、調整等 | 21 |
| 農林水産省 | 森林病害虫等被害対策 | 2016 | 森林病害虫等防除事業の実行 | 21 |
| 文部科学省 | 理科教育等設備整備費補助等 | 2015 | 理科教育設備整備費等補助金の支出 | 21 |
| 厚生労働省 | 都道府県がん対策推進事業 | 2018 | 都道府県がん対策推進事業の実施 | 21 |
| 厚生労働省 | 遺骨収集関連事業 | 2017 | 沖縄における遺骨収集や遺骨情報の収集等を行う（委託） | 21 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2020 | 対馬丸平和祈念事業推進費補助金 | 20 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2019 | 対馬丸平和祈念事業推進費補助金 | 20 |
| 農林水産省 | 森林病害虫等被害対策 | 2015 | 森林病害虫等防除事業及び農林水産大臣命令の実行 | 20 |
| 国土交通省 | 自動車事故による被害者対策の充実 | 2018 | 自動車事故の被害にあった救急患者を受け入れるための救急医療設備の整備 | 20 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2018 | 対馬丸平和祈念事業推進費補助金 | 20 |
| 内閣府 | 災害救助等に要する経費 | 2015 | 災害救助法に基づく救助 | 19 |
| 厚生労働省 | 都道府県がん対策推進事業 | 2020 | 都道府県がん対策推進事業の実施 | 19 |
| 厚生労働省 | 遺骨収集関連事業 | 2016 | 沖縄県において遺骨情報の収集や戦没者墓苑の清掃を行う（委託） | 19 |
| 厚生労働省 | 遺骨収集関連事業 | 2015 | 沖縄県において遺骨情報の収集や戦没者墓苑の清掃を行う | 19 |
| 厚生労働省 | 戦没者等の遺族に対する特別弔慰金等の支給事務 | 2017 | 各種特別給付金及び特別弔慰金の裁定等に係る事務費（事務委託） | 19 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2017 | 対馬丸平和祈念事業推進費補助金 | 19 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2016 | 対馬丸平和祈念事業推進費補助金 | 19 |
| 文部科学省 | 理科教育等設備整備費補助等 | 2020 | 理科教育設備整備費等補助金の実施 | 18 |
| 国土交通省 | 官民連携による民間資金を最大限活用した成長戦略の推進 | 2019 | 沖縄県既存複数MICE施設への公共施設等運営権導入調査 | 18 |
| 原子力規制委員会 | 環境放射能水準調査等事業委託費 | 2016 | 各都道府県における環境放射能水準の調査 | 18 |
| 国土交通省 | 一般空港等整備事業（補助） | 2016 | 下地島空港における空港整備事業費 | 18 |
| 厚生労働省 | へき地における医療提供体制整備の支援 | 2019 | へき地医療支援機構運営事業 | 17 |
| 厚生労働省 | へき地における医療提供体制整備の支援 | 2016 | へき地医療支援機構の運営 | 17 |
| 警察庁 | 警備装備品の整備 | 2019 | 予算配分 | 16 |
| 農林水産省 | 森林病害虫等被害対策 | 2017 | 森林病害虫等防除事業の実行 | 16 |
| 農林水産省 | 森林病害虫等被害対策 | 2016 | 森林病害虫等防除事業の実行 | 16 |
| 農林水産省 | 森林病害虫等被害対策 | 2015 | 森林病害虫等防除事業及び農林水産大臣命令の実行 | 16 |
| 文部科学省 | 高校生等への修学支援 | 2016 | 都道府県が設置する公立学校の教育に必要な経費を交付・支出 | 16 |
| 厚生労働省 | 介護職員処遇改善加算の取得促進特別支援事業 | 2017 | 各事業所における処遇改善加算の取得促進 | 16 |
| 厚生労働省 | へき地における医療提供体制整備の支援 | 2020 | へき地医療支援機構運営事業 | 15 |
| 文部科学省 | 地域の特色ある埋蔵文化財活用事業 | 2016 | 文化財等保存整備費補助金（支出委任） | 15 |
| 文部科学省 | インクルーシブ教育システム推進事業費補助 | 2015 | 合理的配慮協力員の巡回等により「合理的配慮」の実践事例を収集を行い、インクル－シブ教育システムの構築に取組む。 | 14 |
| 文部科学省 | 学校保健特別対策事業 | 2020 | 修学旅行のキャンセル料等支援（支出委任） | 14 |
| 原子力規制委員会 | 放射能調査研究に必要な経費 | 2015 | 米国原子力艦の我が国への寄港に伴う放射能調査を実施 | 14 |
| 厚生労働省 | 戦没者等の遺族に対する特別弔慰金等の支給事務 | 2018 | 各種特別給付金及び特別弔慰金の裁定等に係る事務費（事務委託） | 14 |
| 厚生労働省 | へき地における医療提供体制整備の支援 | 2017 | へき地医療支援機構運営事業 | 14 |
| 原子力規制委員会 | 放射能調査研究に必要な経費 | 2019 | 米国原子力艦の我が国への寄港に伴う放射能調査を実施 | 13 |
| 農林水産省 | 都道府県農業委員会ネットワーク機構負担金 | 2015 | 管内農業会議に交付 | 13 |
| 農林水産省 | 森林病害虫等被害対策 | 2017 | 森林病害虫等防除事業の実行 | 13 |
| 厚生労働省 | へき地における医療提供体制整備の支援 | 2018 | へき地医療支援機構運営事業 | 13 |
| 厚生労働省 | へき地における医療提供体制整備の支援 | 2015 | へき地医療支援機構の運営 | 13 |
| 厚生労働省 | 難病特別対策推進事業 | 2018 | 同上 | 13 |
| 警察庁 | 警備装備品の整備 | 2020 | 予算配分 | 12 |
| 農林水産省 | 都道府県農業委員会ネットワーク機構負担金 | 2019 | 管内農業会議に交付 | 12 |
| 農林水産省 | 都道府県農業委員会ネットワーク機構負担金 | 2018 | 管内農業会議に交付 | 12 |
| 農林水産省 | 都道府県農業委員会ネットワーク機構負担金 | 2017 | 管内農業委員会に交付 | 12 |
| 農林水産省 | 都道府県農業委員会ネットワーク機構負担金 | 2016 | 管内農業委員会に交付 | 12 |
| 原子力規制委員会 | 放射能調査研究に必要な経費 | 2018 | 米国原子力艦の我が国への寄港に伴う放射能調査を実施 | 12 |
| 原子力規制委員会 | 放射能調査研究に必要な経費 | 2017 | 米国原子力艦の我が国への寄港に伴う放射能調査を実施 | 12 |
| 原子力規制委員会 | 放射能調査研究に必要な経費 | 2016 | 米国原子力艦の我が国への寄港に伴う放射能調査を実施 | 12 |
| 厚生労働省 | 職業転換給付金制度 | 2016 | 職場適応訓練費負担金の国負担部分の交付 | 12 |
| 厚生労働省 | 医療用物資の備蓄等事業 | 2020 | 物資の保管・配送 | 11 |
| 農林水産省 | 食料産業・６次産業化交付金 | 2019 | 事業実施主体に対する交付金の交付事務、指導監督、調整等 | 11 |
| 厚生労働省 | 戦没者等の遺族に対する特別弔慰金等の支給事務 | 2019 | 各種特別給付金及び特別弔慰金の裁定等に係る事務費（事務委託） | 11 |
| 厚生労働省 | ハンセン病対策事業委託費 | 2019 | 沖縄振興特別措置法に基づき、沖縄県の療養所入所者等の医療及びその福祉の増進を図る。 | 11 |
| 厚生労働省 | 難病医療提供体制整備等事業 | 2017 | 同上 | 11 |
| 厚生労働省 | ハンセン病対策事業委託費 | 2018 | 沖縄振興特別措置法に基づき、沖縄県の療養所入所者等の医療及びその福祉の増進を図る。 | 11 |
| 厚生労働省 | ハンセン病対策事業委託費 | 2017 | 沖縄振興特別措置法に基づき、沖縄県の療養所入所者等の医療及びその福祉の増進を図る。 | 11 |
| 厚生労働省 | ハンセン病対策事業委託費 | 2016 | 沖縄振興特別措置法に基づき、沖縄県の療養所入所者等の医療及びその福祉の増進を図る。 | 11 |
| 厚生労働省 | ハンセン病対策事業委託費 | 2015 | 沖縄振興特別措置法に基づき、沖縄県の療養所入所者等の医療及びその福祉の増進を図る。 | 11 |
| 農林水産省 | 農林水産物・輸出力維持・強化緊急対策事業のうち外食産業におけるインバウンド需要回復緊急支援事業 | 2020 | 事業実施主体への補助金の交付事務、指導監督、調整 | 10 |
| 厚生労働省 | ハンセン病対策事業委託費 | 2020 | 沖縄振興特別措置法に基づき、沖縄県の療養所入所者等の医療及びその福祉の増進を図る。 | 10 |
| 原子力規制委員会 | 放射能調査研究に必要な経費 | 2020 | 米国原子力艦の我が国への寄港に伴う放射能調査を実施 | 10 |
| 内閣府 | 女性に対する暴力の根絶に向けた取組に必要な経費 | 2020 | 性犯罪・性暴力被害者のためのワンストップ支援センターの運営の安定化等に取り組む地方公共団体に対する交付金 | 10 |
| 厚生労働省 | 健康的な生活習慣づくり重点化事業 | 2019 | 受動喫煙対策促進事業の実施 | 10 |
| 内閣府 | 子供の未来応援地域ネットワーク形成支援事業
（地域子供の未来応援交付金） | 2017 | 地域子供の未来応援ネットワーク形成事業 | 10 |
| 防衛省 | ＳＡＣＯ関係経費 | 2016 | 文化財発掘調査業務 | 10 |
| 農林水産省 | 中山間地域所得向上支援事業 | 2016 | 市町村等への交付事務等 | 10 |
| 厚生労働省 | 新生児聴覚検査体制整備事業 | 2020 | 新生児聴覚検査体制整備事業 | 9 |
| 農林水産省 | 森林病害虫等被害対策 | 2018 | 森林病害虫等防除事業の実行 | 9 |
| 厚生労働省 | 専門医認定支援事業 | 2015 | 専門医の養成プログラムを作成する医療機関に対する補助 | 9 |
| 厚生労働省 | 国民生活基礎調査費 | 2019 | 統計調査員による調査票の配布回収後、都道府県が調査票を厚生労働省に提出 | 9 |
| 環境省 | 低炭素型廃棄物処理支援事業 | 2017 | 地域循環圏・エコタウン低炭素化促進事業 | 8 |
| 文部科学省 | 中学校・高等学校スポーツ活動振興事業 | 2019 | 全国高等学校総合体育大会の開催 | 8 |
| 警察庁 | 警察学校射撃場のバックストップ用特殊ゴムの整備 | 2020 | 予算配分 | 8 |
| 厚生労働省 | 職業転換給付金制度 | 2020 | 職場適応訓練費負担金の国負担部分の交付 | 8 |
| 農林水産省 | 漁業資源調査に要する経費 | 2019 | カツオマグロ類漁獲調査 | 8 |
| 防衛省 | 補償経費等 | 2018 | 権利取得裁決に係る不動産鑑定料 | 8 |
| 農林水産省 | 農業施設災害復旧等事業 | 2016 | 同上 | 8 |
| 農林水産省 | 漁業資源調査に要する経費 | 2018 | カツオマグロ類漁獲調査 | 8 |
| 厚生労働省 | 職業転換給付金制度 | 2017 | 職場適応訓練費負担金の国負担部分の交付 | 8 |
| 厚生労働省 | 専門医認定支援事業 | 2016 | 専門医の養成プログラムを作成する医療機関に対する補助 | 8 |
| 厚生労働省 | 国民健康保険制度関係業務事業費補助金 | 2019 | 市町村事務処理標準システムの導入推進、クラウド化推進体制の構築支援 | 8 |
| 厚生労働省 | 国民生活基礎調査費 | 2016 | 統計調査員による調査票の配布・回収後、都道府県が調査票を厚生労働省に提出 | 8 |
| 環境省 | 越境大気汚染対策推進費 | 2020 | 国設酸性雨環境測定所の管理運営委託業務 | 7 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2020 | 位置境界明確化調査等業務（人件費） | 7 |
| 文部科学省 | 国民文化祭 | 2020 | 令和４年度国民文化祭の開催準備、広報（支出委任） | 7 |
| 農林水産省 | 森林病害虫等被害対策 | 2019 | 森林病害虫等防除事業の実行 | 7 |
| 警察庁 | 警察学校射撃場のバックストップ用特殊ゴムの整備 | 2019 | 予算配分 | 7 |
| 厚生労働省 | 職業転換給付金制度 | 2019 | 職場適応訓練費負担金の国負担部分の交付 | 7 |
| 経済産業省 | 電源地域産業関連施設等整備費補助金 | 2015 | 工業研究施設整備事業 | 7 |
| 厚生労働省 | 災害時における医療提供体制の確保 | 2018 | 災害医療対策事業 | 7 |
| 厚生労働省 | 国民健康保険制度関係業務準備事業費補助金 | 2016 | 国保事業費納付金等算定標準システムの環境構築 | 7 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2018 | 位置境界明確化調査等業務 | 7 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2016 | 位置境界明確化調査等業務 | 7 |
| 環境省 | 産業廃棄物不法投棄等原状回復措置推進費補助金 | 2017 | 廃棄物の撤去・運搬等 | 7 |
| 農林水産省 | 漁業資源調査に要する経費 | 2020 | カツオマグロ類漁獲調査 | 7 |
| 文部科学省 | 特別支援教育充実事業 | 2016 | 特別支援学校等のキャリア教育・就労支援の推進や関係機関との連携の充実。 | 6 |
| 農林水産省 | 資源管理体制高度化推進事業 | 2015 | 資源管理体制推進にかかる事務費、調査研究等沖縄県委託費 | 6 |
| 農林水産省 | 森林病害虫等被害対策 | 2020 | 森林病害虫等防除事業の実行 | 6 |
| 文部科学省 | 要保護児童生徒援助費補助等 | 2020 | 要保護児童生徒援助費補助金の支出 | 6 |
| 環境省 | 越境大気汚染対策推進費 | 2019 | 国設酸性雨環境測定所の管理運営委託業務 | 6 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2019 | 位置境界明確化調査等業務（人件費） | 6 |
| 農林水産省 | 漁業資源調査に要する経費 | 2017 | カツオマグロ類漁獲調査 | 6 |
| 環境省 | 越境大気汚染対策推進費 | 2018 | 国設酸性雨環境測定所の管理運営委託業務 | 6 |
| 環境省 | 越境大気汚染対策推進費 | 2017 | 国設酸性雨環境測定所の管理運営 | 6 |
| 環境省 | 越境大気汚染対策推進費 | 2016 | 国設酸性雨環境測定所の管理運営 | 6 |
| 環境省 | 越境大気汚染対策推進費 | 2015 | 国設酸性雨環境測定所の管理運営 | 6 |
| 厚生労働省 | 職業転換給付金制度 | 2015 | 職場適応訓練費負担金の国負担部分の交付 | 6 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2018 | 位置境界明確化調査等業務（人件費） | 6 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2017 | 位置境界明確化調査等業務（人件費） | 6 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2017 | 位置境界明確化調査等業務 | 6 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2016 | 位置境界明確化調査等業務（人件費） | 6 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2015 | 位置境界明確化調査等業務（人件費） | 6 |
| 文部科学省 | 特別支援教育充実事業 | 2015 | 特別支援学校におけるキャリア教育・就職支援の取り組み及び特別支援学校高等部（知的障害）においてのノウハウの活用。 | 6 |
| 厚生労働省 | 健康的な生活習慣づくり重点化事業 | 2020 | 受動喫煙対策促進事業の実施 | 6 |
| 厚生労働省 | エイズ対策促進事業 | 2020 | エイズ対策促進事業 | 6 |
| 厚生労働省 | 小児慢性特定疾病対策等総合支援事業 | 2015 | 同上 | 6 |
| 農林水産省 | 資源管理体制高度化推進事業 | 2016 | 資源管理体制推進にかかる事務費、調査研究等沖縄県委託費 | 5 |
| 厚生労働省 | 国民健康保険制度関係業務事業費補助金 | 2020 | 市町村事務処理標準システムの導入推進、クラウド化推進体制の構築支援 | 5 |
| 農林水産省 | 沖縄県試験研究機関の助成に要する経費 | 2020 | 畜産関係の試験研究の実施 | 5 |
| 農林水産省 | 林業イノベーション推進総合対策 | 2020 | 早生樹母樹林等の整備 | 5 |
| 農林水産省 | 林業イノベーション推進総合対策 | 2020 | 早生樹母樹林等の整備 | 5 |
| 文部科学省 | スーパーグローバルハイスクール | 2020 | 開発構想名「「平成の大交易時代を構築せよ！」 沖縄からグローバルリーダーを創出」（H28指定校：沖縄県立那覇国際高等学校） | 5 |
| 厚生労働省 | 昭和館運営等事業 | 2020 | 先の大戦における戦没者の遺族及び留守家族等に対し、戦争による悲劇を永く歴史にとどめ、平和を祈念するとともに、その遺族等の福祉の向上を図る。 | 5 |
| 厚生労働省 | 国立ハンセン病療養所等入所者家族生活援護委託費 | 2020 | 生活保護法の基準に準じて援護を実施 | 5 |
| 厚生労働省 | エイズ対策促進事業 | 2019 | エイズ対策促進事業 | 5 |
| 厚生労働省 | 昭和館運営等事業 | 2019 | 先の大戦における戦没者の遺族及び留守家族等に対し、戦争による悲劇を永く歴史にとどめ、平和を祈念するとともに、その遺族等の福祉の向上を図る。 | 5 |
| 農林水産省 | 漁業資源調査に要する経費 | 2015 | カツオ・マグロ類の調査等 | 5 |
| 農林水産省 | 人・農地問題解決加速化支援事業 | 2016 | 管内の市町村への補助金交付、事業の推進に必要な事務等 | 5 |
| 厚生労働省 | 異状死死因究明支援事業 | 2017 | 異状死死因究明支援事業の実施 | 5 |
| 厚生労働省 | 異状死死因究明支援事業 | 2016 | 異状死死因究明支援事業の実施 | 5 |
| 厚生労働省 | 昭和館運営等事業 | 2018 | 先の大戦における戦没者の遺族及び留守家族等に対し、戦争による悲劇を永く歴史にとどめ、平和を祈念するとともに、その遺族等の福祉の向上を図る。 | 5 |
| 厚生労働省 | 昭和館運営等事業 | 2017 | 先の大戦における戦没者の遺族及び留守家族等に対し、戦争による悲劇を永く歴史にとどめ、平和を祈念するとともに、その遺族等の福祉の向上を図る。 | 5 |
| 厚生労働省 | 国立ハンセン病療養所等入所者家族生活援護委託費 | 2017 | 生活保護法の基準に準じて援護を実施 | 5 |
| 厚生労働省 | 介護保険事業費補助金（（項）介護保険制度運営推進費） | 2017 | 介護サービス情報の公表制度支援業務等 | 5 |
| 厚生労働省 | 介護保険事業費補助金（（項）介護保険制度運営推進費） | 2016 | 介護サービス情報の公表制度支援業務等 | 5 |
| 厚生労働省 | 介護保険事業費補助金（（項）介護保険制度運営推進費） | 2015 |
介護サービス情報の公表制度支援業務等
| 5 |
| 厚生労働省 | エイズ対策促進事業 | 2018 | エイズ対策促進事業、地方ブロックエイズ対策促進事業 | 5 |
| 農林水産省 | 地域森林計画編成事業費補助金 | 2019 | 地域森林計画の編成 | 5 |
| 厚生労働省 | 国立ハンセン病療養所等入所者家族生活援護委託費 | 2019 | 生活保護法の基準に準じて援護を実施 | 5 |
| 厚生労働省 | 国立ハンセン病療養所等入所者家族生活援護委託費 | 2018 | 生活保護法の基準に準じて援護を実施 | 5 |
| 厚生労働省 | 小児慢性特定疾病対策等総合支援事業 | 2020 | 同上 | 5 |
| 厚生労働省 | 昭和館運営等事業 | 2016 | 先の大戦における戦没者の遺族及び留守家族等に対し、戦争による悲劇を永く歴史にとどめ、平和を祈念するとともに、その遺族等の福祉の向上を図る。 | 5 |
| 厚生労働省 | 昭和館運営等事業 | 2015 | 先の大戦における戦没者の遺族及び留守家族等に対し、戦争による悲劇を永く歴史にとどめ、平和を祈念するとともに、その遺族等の福祉の向上を図る。 | 5 |
| 農林水産省 | EEZ内資源・漁獲管理体制強化事業 | 2018 | 資源状況等の調査及び漁獲量の把握等 | 5 |
| 厚生労働省 | 国立ハンセン病療養所等入所者家族生活援護委託費 | 2016 | 生活保護法の基準に準じて援護を実施 | 5 |
| 厚生労働省 | 国立ハンセン病療養所等入所者家族生活援護委託費 | 2015 | 生活保護法の基準に準じて援護を実施 | 5 |
| 厚生労働省 | 療養病床転換助成に必要な経費 | 2020 | 医療療養病床を介護保険施設等に転換する費用を助成 | 5 |
| 厚生労働省 | 国民健康保険制度関係業務事業費補助金 | 2018 | 市町村事務処理標準システムの導入推進、クラウド化推進体制の構築支援 | 5 |
| 文部科学省 | 防災教育推進事業 | 2017 | 緊急地震速報を活用した避難訓練の実施と学校安全アドバイザーによる指導助言を実施。 | 5 |
| 厚生労働省 | 小児慢性特定疾病対策等総合支援事業 | 2019 | 小児慢性特定疾病児童等の日常生活の便宜を図るために特殊寝台等の日常生活用具を給付する等の小児慢性特定疾病児童等の健全育成及び自立促進を図るための事業を実施する。 | 4 |
| 厚生労働省 | 異状死死因究明支援事業 | 2015 | 異状死死因究明支援事業の実施 | 4 |
| 国土交通省 | 治安及び救難体制の整備に関する経費 | 2019 | 施設借上 | 4 |
| 内閣府 | 良好で緑豊かな都市空間の形成等のための国営公園事業に必要な経費 | 2019 | 首里城地区の復元整備に係る発掘調査の実施 | 4 |
| 農林水産省 | 市場開拓に向けた取組を支える研究開発 | 2016 | へちまの栽培技術の開発 等 | 4 |
| 農林水産省 | 人・農地問題解決加速化支援事業 | 2017 | 管内の市町村への補助金交付、事業の推進に必要な事務等 | 4 |
| 環境省 | 在日米軍施設・区域周辺環境保全対策費 | 2016 | 沖縄県内の米軍施設・区域周辺における環境調査業務の実施 | 4 |
| 環境省 | 在日米軍施設・区域周辺環境保全対策費 | 2015 | 沖縄県内の米軍施設・区域での水質調査業務の実施 | 4 |
| 厚生労働省 | 職業転換給付金制度 | 2018 | 職場適応訓練費負担金の国負担部分の交付 | 4 |
| 厚生労働省 | 災害時における医療提供体制の確保 | 2017 | 国主催の総合防災訓練への参加旅費・DMAT訓練に係る費用等への補助 | 4 |
| 厚生労働省 | 戦没者追悼式挙行等事業 | 2018 | 全国戦没者追悼式参列に係る経費を国費により負担 | 4 |
| 厚生労働省 | 戦没者追悼式挙行等事業 | 2017 | 全国戦没者追悼式参列に係る経費を国費により負担 | 4 |
| 厚生労働省 | 戦没者追悼式挙行等事業 | 2016 | 全国戦没者追悼式参列に係る経費を国費により負担 | 4 |
| 厚生労働省 | 戦没者追悼式挙行等事業 | 2015 | 全国戦没者追悼式参列に係る経費を国費により負担 | 4 |
| 厚生労働省 | 戦傷病者特別援護法等に基づく戦傷病者等に対する療養の給付等の援護事業 | 2018 | 戦傷病者に対する療養の給付、補装具の支給等の援護を実施（事務委託） | 4 |
| 厚生労働省 | 小児慢性特定疾病対策等総合支援事業 | 2018 | 同上 | 4 |
| 厚生労働省 | 小児慢性特定疾病対策等総合支援事業 | 2017 | 同上 | 4 |
| 国土交通省 | 治安及び救難体制の整備に関する経費 | 2020 | 施設借上 | 4 |
| 環境省 | 在日米軍施設・区域周辺環境保全対策費 | 2018 | 沖縄県内の米軍施設・区域周辺における環境調査業務の実施 | 4 |
| 環境省 | 在日米軍施設・区域周辺環境保全対策費 | 2017 | 沖縄県内の米軍施設・区域周辺における環境調査業務の実施
| 4 |
| 厚生労働省 | 小児慢性特定疾病対策等総合支援事業 | 2016 | 同上 | 4 |
| 厚生労働省 | 介護サービス情報の公表制度支援事業 | 2020 | 介護サービス情報の公表制度支援業務 | 3 |
| 文部科学省 | 学校基本調査 | 2015 | 高等学校及び専修学校・各種学校等に対する調査票配付・収集及び審査等 | 3 |
| 文部科学省 | 学校基本調査 | 2018 | 高等学校及び専修学校・各種学校等に対する調査票配付・収集及び審査等 | 3 |
| 環境省 | 在日米軍施設・区域周辺環境保全対策費 | 2020 | 沖縄県内の米軍施設・区域周辺における環境調査業務の実施 | 3 |
| 文部科学省 | 学校基本調査 | 2016 | 高等学校及び専修学校・各種学校等に対する調査票配付・収集及び審査等（法定受託事務） | 3 |
| 文部科学省 | 学校基本調査 | 2020 | 高等学校及び専修学校・各種学校等に対する調査票配付・収集及び審査等（法定受託事務） | 3 |
| 文部科学省 | 学校基本調査 | 2017 | 高等学校及び専修学校・各種学校等に対する調査票配付・収集及び審査等 | 3 |
| 農林水産省 | 沖縄県試験研究機関の助成に要する経費 | 2020 | 畜産関係の試験研究の実施 | 3 |
| 防衛省 | 補償経費等 | 2019 | 権利取得裁決に係る不動産鑑定料 | 3 |
| 総務省 | 常備消防力の強化等地方公共団体における消防防災体制の充実強化 | 2019 | 消防の広域化及び連携・協力のモデル構築事業 | 3 |
| 農林水産省 | 戦略的プロジェクト研究推進事業のうち市場開拓に向けた取組を支える研究開発 | 2019 | へちまの栽培技術の開発 等 | 3 |
| 環境省 | 在日米軍施設・区域周辺環境保全対策費 | 2019 | 沖縄県内の米軍施設・区域周辺における環境調査業務の実施 | 3 |
| 厚生労働省 | 戦没者追悼式挙行等事業 | 2019 | 全国戦没者追悼式参列に係る経費を国費により負担 | 3 |
| 厚生労働省 | 医療連携体制推進事業 | 2019 | 都道府県に対し、各医療機関の医療機能を適切に情報提供するための事業に係る経費を補助 | 3 |
| 厚生労働省 | 戦傷病者戦没者遺族等援護法施行事務 | 2019 | 戦傷病者戦没者遺族等援護法施行に伴う裁定の調査事務等（事務委託） | 3 |
| 防衛省 | 補償経費等 | 2017 | 権利取得裁決に係る不動産鑑定料 | 3 |
| 農林水産省 | 戦略的プロジェクト研究推進事業のうち市場開拓に向けた取組を支える研究開発 | 2018 | へちまの栽培技術の開発 等 | 3 |
| 農林水産省 | 市場開拓に向けた取組を支える研究開発 | 2017 | へちまの栽培技術の開発 等 | 3 |
| 国土交通省 | 治安及び救難体制の整備に関する経費 | 2015 | 建物使用料 | 3 |
| 国土交通省 | 一般空港等整備事業（直轄）（耐震対策事業を除く） | 2018 | 埋蔵文化財調査委託 | 3 |
| 厚生労働省 | 異状死死因究明支援事業 | 2018 | 異状死死因究明支援事業の実施 | 3 |
| 厚生労働省 | 生活保護に関する調査事業 | 2016 | 被保護者世帯の家計の収支及び生活実態等調査に係る地方自治体への委託 | 3 |
| 厚生労働省 | 生活保護に関する調査事業 | 2015 | 被保護者世帯の家計の収支及びその内容の調査 | 3 |
| 厚生労働省 | 災害時における医療提供体制の確保 | 2016 | 国主催の総合防災訓練への参加旅費・DMAT訓練に係る費用等への補助 | 3 |
| 厚生労働省 | 災害時における医療提供体制の確保 | 2015 | 国主催の総合防災訓練への参加旅費・DMAT訓練に係る費用等への補助 | 3 |
| 厚生労働省 | 戦傷病者特別援護法等に基づく戦傷病者等に対する療養の給付等の援護事業 | 2017 | 戦傷病者に対する療養の給付、補装具の支給等の援護を実施（事務委託） | 3 |
| 厚生労働省 | 戦傷病者戦没者遺族等援護法施行事務 | 2018 | 戦傷病者戦没者遺族等援護法施行に伴う裁定の調査事務等（事務委託） | 3 |
| 厚生労働省 | 戦傷病者戦没者遺族等援護法施行事務 | 2017 | 戦傷病者戦没者遺族等援護法施行に伴う裁定の調査事務等（事務委託） | 3 |
| 厚生労働省 | 戦傷病者戦没者遺族等援護法施行事務 | 2016 | 戦傷病者戦没者遺族等援護法施行に伴う裁定の調査事務等（事務委託） | 3 |
| 厚生労働省 | 戦傷病者戦没者遺族等援護法施行事務 | 2015 | 戦傷病者戦没者遺族等援護法施行に伴う事務費 | 3 |
| 厚生労働省 | 医療連携体制推進事業 | 2018 | 都道府県に対し、各医療機関の医療機能を適切に情報提供するための事業に係る経費を補助 | 3 |
| 厚生労働省 | 医療連携体制推進事業 | 2017 | 都道府県に対し、各医療機関の医療機能を適切に情報提供するための事業に係る経費を補助 | 3 |
| 厚生労働省 | 医療連携体制推進事業 | 2016 | 都道府県に対し、各医療機関の医療機能を適切に情報提供するための事業に係る経費を補助 | 3 |
| 厚生労働省 | 医療連携体制推進事業 | 2015 | 都道府県に対し、各医療機関の医療機能を適切に情報提供するための事業に係る経費を補助 | 3 |
| 内閣府 | 沖縄開発事業（旧社会資本整備事業特別会計計上分） | 2016 | 用地補償等 | 3 |
| 内閣府 | 沖縄開発事業（旧社会資本整備事業特別会計計上分） | 2016 | 用地補償等 | 3 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2018 | 対馬丸遭難学童遺族特別支出金の支給（２件） | 3 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2017 | 対馬丸遭難学童遺族特別支出金の支給（２件） | 3 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2016 | 対馬丸遭難学童遺族特別支出金の支給（２件） | 3 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2015 | 対馬丸遭難学童遺族特別支出金の支給（２件） | 3 |
| 文部科学省 | 学校基本調査 | 2019 | 高等学校及び専修学校・各種学校等に対する調査票配付・収集及び審査等 | 3 |
| 内閣府 | 災害救助等に要する経費 | 2016 | 災害救助法に基づく救助 | 3 |
| 国土交通省 | 治安及び救難体制の整備に関する経費 | 2020 | 施設借上 | 3 |
| 厚生労働省 | 高齢者権利擁護等推進事業 | 2018 | 高齢者の権利擁護のための取組を推進 | 3 |
| 厚生労働省 | 高齢者権利擁護等推進事業 | 2015 | 高齢者の権利擁護のための取組を推進する。 | 3 |
| 文部科学省 | 国語施策の充実 | 2018 | 「危機的な状況にある言語・方言サミット」の実施 | 2 |
| 文部科学省 | 特別支援教育就学奨励費負担等 | 2015 | 都道府県・指定都市・中核市における特別支援教育の体制整備を推進するため、国がその経費の一部を補助することとし、特別支援教育の充実を図る。 | 2 |
| 厚生労働省 | 高齢者権利擁護等推進事業 | 2017 | 高齢者の権利擁護のための取組を推進 | 2 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の運航に関する経費 | 2020 | 船舶給水料 | 2 |
| 農林水産省 | 沖縄県試験研究機関の助成に要する経費 | 2020 | 水産業関係の試験研究の実施 | 2 |
| 農林水産省 | 沖縄県試験研究機関の助成に要する経費 | 2020 | 林業関係の試験研究の実施 | 2 |
| 農林水産省 | 水産業改良普及事業交付金 | 2020 | 普及指導員の設置、普及指導員による漁業者への技術・経営指導等 | 2 |
| 警察庁 | 銃器の整備等 | 2020 | 予算配分 | 2 |
| 厚生労働省 | 医療連携体制推進事業 | 2020 | 都道府県に対し、各医療機関の医療機能を適切に情報提供するための事業に係る経費を補助 | 2 |
| 厚生労働省 | 戦傷病者戦没者遺族等援護法施行事務 | 2020 | 戦傷病者戦没者遺族等援護法施行に伴う裁定の調査事務等（事務委託） | 2 |
| 農林水産省 | 森林情報活用促進事業 | 2019 | システムの整備 | 2 |
| 農林水産省 | 水産業改良普及事業交付金 | 2019 | 普及指導員の設置、普及指導員による漁業者への技術・経営指導等 | 2 |
| 厚生労働省 | 戦傷病者特別援護法等に基づく戦傷病者等に対する療養の給付等の援護事業 | 2019 | 戦傷病者に対する療養の給付、補装具の支給等の援護を実施（事務委託） | 2 |
| 厚生労働省 | 戦傷病者特別援護法等に基づく戦傷病者等に対する療養の給付等の援護事業 | 2019 | 戦傷病者に対する療養の給付、補装具の支給等の援護を実施（事務委託） | 2 |
| 厚生労働省 | 助産師活用推進事業 | 2019 | 助産師就業の偏在解消、助産実践能力の強化及び助産学生等の実習施設確保等 | 2 |
| 厚生労働省 | 異状死死因究明支援事業 | 2019 | 異状死死因究明支援事業の実施 | 2 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2019 | 対馬丸遭難学童遺族特別支出金の支給（１件） | 2 |
| 厚生労働省 | 助産師出向等支援導入事業 | 2018 | 助産師就業の偏在解消、助産実践能力の強化及び助産学生等の実習施設確保等 | 2 |
| 厚生労働省 | 助産師出向等支援導入事業 | 2017 | 助産師就業の偏在解消、助産実践能力の強化及び助産学生等の実習施設確保等 | 2 |
| 防衛省 | 補償経費等 | 2016 | 所在防衛施設に係る連絡調整業務 | 2 |
| 防衛省 | 補償経費等 | 2016 | 権利取得裁決に係る不動産鑑定料 | 2 |
| 防衛省 | 補償経費等 | 2015 | 所在防衛施設に係る連絡調整業務 | 2 |
| 農林水産省 | 水産業改良普及事業交付金 | 2018 | 普及指導員の設置、普及指導員による漁業者への技術・経営指導等 | 2 |
| 農林水産省 | 水産業改良普及事業交付金 | 2017 | 普及指導員の設置、普及指導員による漁業者への技術・経営指導等 | 2 |
| 農林水産省 | 水産業改良普及事業交付金 | 2016 | 普及指導員の設置、普及指導員による漁業者への技術・経営指導等 | 2 |
| 農林水産省 | 水産業改良普及事業交付金 | 2015 | 普及指導員の設置、普及指導員による漁業者への技術・経営指導等 | 2 |
| 文部科学省 | 中学校・高等学校スポーツ活動振興事業 | 2017 | 全国中学校体育大会の開催 | 2 |
| 国土交通省 | 治安及び救難体制の整備に関する経費 | 2018 | 施設使用料 | 2 |
| 国土交通省 | 治安及び救難体制の整備に関する経費 | 2017 | 敷地借上 | 2 |
| 内閣府 | 結婚に伴う経済的負担を軽減するための新生活支援を行う自治体支援事業 | 2016 | 結婚新生活支援事業費補助金の市区町村への交付 | 2 |
| 厚生労働省 | 異状死死因究明支援事業 | 2020 | 異状死死因究明支援事業の実施 | 2 |
| 農林水産省 | 水産多面的機能発揮対策 | 2015 | 事務の適切な実施を図るために必要な指導等の事務 | 2 |
| 内閣府 | 水道施設整備に必要な経費 | 2018 | 水道施設整備に係る指導監督事務 | 2 |
| 内閣府 | 水道施設整備に必要な経費 | 2017 | 水道施設整備に係る指導監督事務 | 2 |
| 内閣府 | 水道施設に必要な経費 | 2016 | 水道施設整備に係る指導監督事務 | 2 |
| 内閣府 | 水道施設整備に必要な経費 | 2015 | 水道施設整備に係る指導監督事務の実施 | 2 |
| 内閣府 | 水道施設整備に必要な経費 | 2019 | 水道施設整備に係る指導監督事務 | 2 |
| 農林水産省 | 水産多面的機能発揮対策 | 2016 | 事務の適切な実施を図るために必要な指導等の事務 | 2 |
| 農林水産省 | 水産多面的機能発揮対策 | 2018 | 事務の適切な実施を図るために必要な指導等の事務 | 2 |
| 国土交通省 | 治安及び救難体制の整備に関する経費 | 2020 | 施設借上 | 1 |
| 原子力規制委員会 | 放射能調査研究に必要な経費 | 2020 | 辺戸岬測定所における環境放射線等モニタリング調査を実施 | 1 |
| 原子力規制委員会 | 放射能調査研究に必要な経費 | 2019 | 辺戸岬測定所における環境放射線等モニタリング調査 | 1 |
| 農林水産省 | 水産多面的機能発揮対策 | 2017 | 事務の適切な実施を図るために必要な指導等の事務 | 1 |
| 原子力規制委員会 | 放射能調査研究に必要な経費 | 2018 | 辺戸岬測定所における環境放射線等モニタリング調査を実施 | 1 |
| 原子力規制委員会 | 放射能調査研究に必要な経費 | 2017 | 辺戸岬測定所における環境放射線等モニタリング調査を実施 | 1 |
| 内閣府 | 水道施設整備に必要な経費 | 2020 | 水道施設整備に係る指導監督事務 | 1 |
| 厚生労働省 | 災害時における医療提供体制の確保 | 2019 | ＤＰＡＴ体制整備事業 | 1 |
| 農林水産省 | 戦略的プロジェクト研究推進事業のうち現場ニーズ対応型研究 | 2018 | アルボウイルス感染症の監視情報の収集と防疫の最適化 | 1 |
| 警察庁 | 特殊詐欺対策の推進 | 2018 | 予算配分 | 1 |
| 内閣府 | 沖縄の酒類製造業の自立的経営の促進に必要な経費 | 2018 | 泡盛製造用県産長粒種米の栽培の実施 | 1 |
| 農林水産省 | 安全な農畜水産物安定供給のための包括的レギュラトリーサイエンス研究推進事業 | 2020 | アルボウイルス感染症の監視情報の収集と防疫の最適化 | 1 |
| 厚生労働省 | 戦傷病者特別援護法等に基づく戦傷病者等に対する療養の給付等の援護事業 | 2020 | 戦傷病者に対する療養の給付、補装具の支給等の援護を実施（事務委託） | 1 |
| 内閣府 | 沖縄の戦後処理対策に必要な経費 | 2020 | 対馬丸遭難学童遺族特別支出金の支給（１件） | 1 |
| 農林水産省 | 戦略的プロジェクト研究推進事業のうち現場ニーズ対応型研究 | 2019 | アルボウイルス感染症の監視情報の収集と防疫の最適化 | 1 |
| 防衛省 | 補償経費等 | 2017 | 所在防衛施設に係る連絡調整業務 | 1 |
| 防衛省 | 補償経費等 | 2017 | 権利取得裁決に係る不動産鑑定料 | 1 |
| 防衛省 | 補償経費等 | 2017 | 権利取得裁決に係る不動産鑑定料 | 1 |
| 農林水産省 | ６次産業化ネットワーク推進対策事業 | 2016 | 事業実施主体への交付金の交付事務、指導管理、調整等 | 1 |
| 農林水産省 | 牛肉等関税財源畜産業振興対策交付金 | 2017 | 肉用子牛生産者補給金等交付業務等事務委託 | 1 |
| 文部科学省 | 高校生等への修学支援 | 2017 | 都道府県が設置する公立学校の教育に必要な経費を交付・支出 | 1 |
| 文部科学省 | 地方教育行政推進事業 | 2017 | 市町村教育委員会研究協議会の開催 | 1 |
| 国土交通省 | 治安及び救難体制の整備に関する経費 | 2017 | 敷地借上 | 1 |
| 原子力規制委員会 | 放射能調査研究に必要な経費 | 2016 | 辺戸岬測定所における環境放射線等モニタリング調査を実施 | 1 |
| 原子力規制委員会 | 放射能調査研究に必要な経費 | 2015 | 辺戸岬測定所における環境放射線等モニタリング調査を実施 | 1 |
| 厚生労働省 | 外国人看護師候補者就労研修支援事業 | 2015 | 外国人看護師の研修等 | 1 |
| 内閣府 | 良好で緑豊かな都市空間の形成等のための国営公園事業に必要な経費 | 2018 | 首里城地区の復元整備に係る発掘調査の実施 | 1 |
| 内閣府 | 廃棄物処理施設整備に必要な経費 | 2017 | 循環型社会形成推進交付金事業の指導監督のために必要な経費 | 1 |
| 内閣府 | 廃棄物処理施設整備に必要な経費 | 2016 | 循環型社会形成推進交付金事業の指導監督のために必要な経費 | 1 |
| 内閣府 | 廃棄物処理施設整備に必要な経費 | 2015 | 循環型社会形成推進交付金事業の指導監督のために必要な経費 | 1 |
| 厚生労働省 | 地域保健従事者現任教育推進事業 | 2020 | 地域保健従事者現任教育推進事業の実施 | 1 |
| 内閣府 | 廃棄物処理施設整備に必要な経費 | 2018 | 循環型社会形成推進交付金事業の指導監督のために必要な経費 | 1 |
| 農林水産省 | 農業支援外国人適正受入サポート事業 | 2018 | 適正受入管理協議会への苦情・相談窓口の設置 | 1 |
| 農林水産省 | 農業支援外国人適正受入サポート事業 | 2019 | 適正受入管理協議会への苦情・相談窓口の設置 | 1 |
| 文部科学省 | 学校安全推進事業 | 2019 | 学校安全に関する教職員講習会等の実施 | 1 |
| 文部科学省 | 幼稚園教育内容・方法の改善充実 | 2017 | 幼稚園教育、幼稚園の運営・管理などに関する研究協議等の実施（幼稚園教育要領の改訂内容の周知等）※支出委任 | 1 |
| 文部科学省 | 学校保健推進事業 | 2019 | がん教育総合支援事業の実施 | 1 |
| 国土交通省 | 低潮線の保全に要する経費 | 2019 | 船舶の傭船 | 1 |
| 文部科学省 | 幼稚園教育内容・方法の改善充実 | 2019 | 幼稚園教育、幼稚園の運営・管理などに関する研究協議等の実施（幼稚園教育要領の内容の理解推進等）※支出委任 | 1 |
| 文部科学省 | 学校安全推進事業 | 2018 | 学校安全に関する教職員講習会等の実施 | 1 |
| 文部科学省 | 学校安全推進事業 | 2017 | ・防災教室講習会
・防犯教室講習会 | 1 |
| 文部科学省 | 国語施策の充実 | 2015 | 「危機的な状況にある言語・方言サミット」の実施 | 1 |
| 国土交通省 | 水資源の現状把握等に要する経費 | 2017 | 全国水需給動態調査 | 1 |
| 文部科学省 | 学校保健推進事業 | 2018 | 全国学校歯科保健研究大会 | 1 |
| 厚生労働省 | 国民生活基礎調査費 | 2020 | 厚生労働統計調査の実施 | 1 |
| 内閣府 | 廃棄物処理施設整備に必要な経費 | 2020 | 循環型社会形成推進交付金事業の指導監督に係る経費 | 1 |
| 国土交通省 | 水資源の現状把握等に要する経費 | 2019 | 全国水需給動態調査 | 1 |
| 厚生労働省 | 新生児聴覚検査体制整備事業 | 2019 | 新生児聴覚検査体制整備事業 | 1 |
| 内閣府 | 廃棄物処理施設整備に必要な経費 | 2019 | 循環型社会形成推進交付金事業の指導監督のために必要な経費 | 1 |
| 文部科学省 | 幼稚園教育内容・方法の改善充実 | 2018 | 幼稚園教育、幼稚園の運営・管理などに関する研究協議等の実施（幼稚園教育要領の内容の理解推進等）※支出委任 | 1 |
| 厚生労働省 | 新生児聴覚検査体制整備事業 | 2018 | 新生児聴覚検査体制整備事業 | 1 |
| 国土交通省 | 治安及び救難体制の整備に関する経費 | 2020 | 施設借上 | 1 |
| 警察庁 | 警察用船舶の整備 | 2016 | 予算配分 | 1 |
| 警察庁 | 警察用船舶の整備 | 2015 | 予算配分 | 1 |
| 厚生労働省 | 輸入食品の監視体制強化等事業 | 2017 | 食品の食中毒菌汚染実態調査（支出委任） | 1 |
| 農林水産省 | 森林総合監理士等育成対策事業 | 2015 | 森林・林業に関する専門知識・技術等に一定の資質を有した森林総合監理士を育成するため、その候補者となる若手技術者を対象とした研修への参加等 | 0 |
| 警察庁 | 銃器の整備等 | 2019 | 予算配分 | 0 |
| 警察庁 | 銃器の整備等 | 2016 | 銃器手入れ用具等消耗品購入に必要な予算配分 | 0 |
| 警察庁 | 警察用船舶の整備 | 2017 | 予算配分 | 0 |
| 警察庁 | 銃器の整備等 | 2018 | 銃器手入れ用具等消耗品購入に必要な予算配分 | 0 |
| 厚生労働省 | 地域健康危機管理対策事業 | 2017 | 地域健康危機管理体制推進事業の実施 | 0 |
| 厚生労働省 | 地域健康危機管理対策事業 | 2016 | 地域健康危機管理体制推進事業の実施 | 0 |
| 厚生労働省 | 地域健康危機管理対策事業 | 2015 | 地域健康危機管理体制推進事業の実施 | 0 |
| 文部科学省 | 公立学校施設災害復旧費 | 2015 | 災害復旧に関する事務費 | 0 |
| 厚生労働省 | 医薬品等監視指導対策費 | 2019 | 医薬品販売業者に対する指導の充実・強化 | 0 |
| 文部科学省 | 生涯スポーツ振興事業 | 2018 | 体力・運動能力調査の実施に係る支出委任 | 0 |
| 文部科学省 | 生涯スポーツ振興事業 | 2017 | 体力・運動能力調査の実施に係る支出委任 | 0 |
| 厚生労働省 | 遺骨伝達等事業 | 2017 | 遺族への遺骨伝達（事務委託） | 0 |
| 文部科学省 | 幼稚園教育内容・方法の改善充実 | 2020 | 幼稚園教育、幼稚園の運営・管理などに関する研究協議等の実施（幼稚園教育要領の内容の理解推進等）※支出委任 | 0 |
| 国土交通省 | 水資源の有効利用等の推進に関する調査経費 | 2020 | 全国水需給動態調査 | 0 |
| 文部科学省 | 学校安全推進事業 | 2020 | 学校安全に関する教職員講習会等の実施 | 0 |
| 厚生労働省 | 医薬品等ＧＭＰ対策事業 | 2020 | 査察整合性確保事業 | 0 |
| 警察庁 | サイバー空間における脅威への対処に係る人材育成 | 2019 | 補助金交付 | 0 |
| 農林水産省 | 農林漁業センサス | 2016 | 2015年農林業センサス結果の市町村別報告書を刊行。 | 0 |
| 文部科学省 | 地方教育行政推進事業 | 2017 | 中学校夜間学級の設置促進等推進事業 | 0 |
| 厚生労働省 | 医薬品等監視指導対策費 | 2018 | 医薬品販売業者に対する指導の充実・強化（委託契約） | 0 |
| 文部科学省 | 公立学校施設災害復旧費 | 2016 | 災害復旧に要する事務費 | 0 |
| 総務省 | 引揚者特別交付金支給事務費 | 2015 | 認定事務費等 | 0 |
| 国土交通省 | 治安及び救難体制の整備に関する経費 | 2020 | 施設借上 | 0 |
| 国土交通省 | 治安及び救難体制の整備に関する経費 | 2020 | 施設借上 | 0 |
| 国土交通省 | 治安及び救難体制の整備に関する経費 | 2020 | 施設借上 | 0 |
| 警察庁 | 警察用船舶の整備 | 2020 | 予算配分 | 0 |
| 厚生労働省 | 遺骨伝達等事業 | 2020 | 遺族への遺骨伝達（事務委託） | 0 |
| 国土交通省 | 水資源の有効利用等の推進に関する調査経費 | 2019 | 全国水需給動態調査 | 0 |
| 厚生労働省 | 医薬品等GVP（製造販売後安全管理基準）対策事業 | 2019 | GVP模擬視察研修の実施費（支出委任） | 0 |
| 厚生労働省 | 遺骨伝達等事業 | 2019 | 遺族への遺骨伝達（事務委託） | 0 |
| 警察庁 | 特殊詐欺対策の推進 | 2017 | 予算配分 | 0 |
| 国土交通省 | 水資源の有効利用等の推進に関する調査経費 | 2018 | 全国水需給動態調査 | 0 |
| 国土交通省 | 水資源の有効利用等の推進に関する調査経費 | 2017 | 全国水需給動態調査 | 0 |
| 国土交通省 | 水資源の有効利用等の推進に関する調査経費 | 2016 | 全国水需給動態調査業務 | 0 |
| 厚生労働省 | 遺骨伝達等事業 | 2018 | 遺族への遺骨伝達（事務委託） | 0 |
| 厚生労働省 | 遺骨伝達等事業 | 2016 | 遺族への遺骨伝達（事務委託） | 0 |
| 厚生労働省 | 危険ドラッグ対策費 | 2016 | 指定薬物標準品合成及び分析開発業務（委託契約） | 0 |
| 厚生労働省 | 医薬品等GVP（製造販売後安全管理基準）対策事業 | 2016 | GVP模擬査察研修の実施費（支出委任） | 0 |
| 厚生労働省 | 戦没者追悼式挙行等事業 | 2017 | 全国戦没者追悼式に係る献花補助者に対する旅費 | 0 |
| 文部科学省 | 地方教育費及び行政の実態調査 | 2019 | 調査説明会出席旅費（支出委任） | 0 |
| 文部科学省 | 地方教育費及び行政の実態調査 | 2017 | 調査票の作成・集計及び審査等（支出委任） | 0 |
| 文部科学省 | 地方教育費及び行政の実態調査 | 2017 | 調査票の作成・集計及び審査等（支出委任） | 0 |
| 厚生労働省 | 危険ドラッグ対策費 | 2019 | 指定薬物標準品合成及び分析開発業務 | 0 |
| 文部科学省 | 地方教育費及び行政の実態調査 | 2015 | 私立の高等学校以下の各学校に対する調査票配付・収集及び審査等 | 0 |
| 文部科学省 | 高校生等への修学支援 | 2019 | 都道府県が設置する公立高等学校の教育に必要な経費を交付・支出 | 0 |
| 文部科学省 | 地方教育費及び行政の実態調査 | 2018 | 調査票の配付・収集・審査等（支出委任） | 0 |
| 文部科学省 | 高校生等への修学支援 | 2020 | 都道府県が設置する公立高等学校の教育に必要な経費を交付・支出 | 0 |
| 環境省 | 大気環境監視測定網整備推進費 | 2020 | 令和２年度行政財産使用料（国設測定所（沖縄県）） | 0 |
| 農林水産省 | 船舶運航に要する経費 | 2019 | 岸壁使用料 | 0 |
| 内閣府 | 沖縄開発事業（旧社会資本整備事業特別会計計上分） | 2016 | 用地借料等 | 0 |
| 内閣府 | 沖縄開発事業（旧社会資本整備事業特別会計計上分） | 2016 | 用地借料等 | 0 |
